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| U11 スプライソソームRNA | |
|---|---|
 ヒトU11スプライソソームRNAの二次構造 | |
| 識別子 | |
| シンボル | 11歳 |
| Rfam | RF00548 |
| その他のデータ | |
| RNAタイプ | 遺伝子; snRNA ;スプライシング |
| ドメイン | 真核生物 |
| 行く | GO:0000369 GO:0030627 GO:0005692 |
| それで | 0000398 0000000 |
| PDB構造 | PDBe |
U11 snRNA（核小体リボ核酸）は、マイナースプライソソームタンパク質複合体における重要な非コードRNAであり、選択的スプライシング機構を活性化する。マイナースプライソソームは、メジャースプライソソームと同様のタンパク質成分と関連している。U11 snRNAを使用して5'スプライス部位を認識し（機能的にはU1 snRNAと同等）、U12 snRNAは分岐点に結合して3'スプライス部位を認識する（機能的にはU2 snRNAと同等）。[1]
二次構造
U11 snRNAは、5'末端をスプライス部位配列（5' ss）とするステムループ構造を持ち[2]、4つのステムループ構造（I-IV）を含む。植物、脊椎動物、昆虫のU11 snRNAの構造比較では、5'部位に4方向ジャンクションを持つ構造に折り畳まれ、3'部位にステムループ構造があることが示されている[3] 。
アセンブリ経路中の結合部位
5'スプライス部位領域は、真核生物のU12型プレmRNAイントロンの5'スプライス部位と配列相補性を持っています。5'スプライス部位とSm結合部位は、すべての種で高度に保存されています。[3]また、ステムループIIIは、高度に保存されたヌクレオチド配列「AUCAAGA」を持っているため、タンパク質結合部位または塩基対形成領域のいずれかである可能性があります。[3]
選択的スプライシングにおける役割
U11 および U12 snRNP (マイナー スプライソソーム経路) は、U1 および U2 snRNP (メジャー スプライソソーム経路) の機能類似体ですが、U4 atac / U6 atac snRNPはU4 / U6に類似しています。メジャー スプライシング経路とは異なり、U11 および U12 snRNP は、安定した、あらかじめ形成された U11/U12 ジ snRNP 複合体として mRNA に結合します。これは、7 つのタンパク質 (65K、59K、48K、35K、31K、25K、20K) を使用して行われます。そのうち 4 つ (59K、48K、35K、25K) は、U11 snRNA に関連しています。[4]
スプライソソームの形成中、U11およびU12 snRNAの5'末端は、塩基対形成を介して、それぞれmRNAの5'スプライス部位および分岐点配列と相互作用する。[4] [5] U11 snRNPは、 U11 snRNP結合スプライシングエンハンサー（USSE）として知られるタンデムリピートに結合し、スプライシングプロセスを開始する。[6] U11およびU12 snRNAは両方とも二重複合体として一緒になるので、プレスプライソソーム複合体のイントロンの2つの末端の間に分子ブリッジを形成する。[4] U11-48KおよびU11/U12-65Kタンパク質は、U12型イントロンのスプライス部位を認識し、U11/U12二重複合体を安定化する。[6]スプライソソーム複合体を活性化した後、U11 snRNAはアセンブリを離れる。
この種の5'スプライス部位認識とタンパク質-タンパク質、タンパク質-RNA、RNA-RNA相互作用によるイントロン架橋は、メジャースプライソソーム複合体とは異なり、マイナースプライソソーム複合体に特有です。 [4]選択的スプライシングはタンパク質をコードする遺伝子発現（mRNA）の変異の鍵であるため、U11はこの制御プロセスに不可欠であり、プロテオームプールの形成に関与しています。したがって、U11 snRNAは進化の観点から重要です。[7]
参考文献
- ^ エリオット、デイビッド、ラドメリー、マイケル (2011) 。RNAの分子生物学。オックスフォード大学出版局。p.124。
- ^ Russell AG 、 Charette JM、Spencer DF、 Gray MW (2006 年 10 月)。「マイナースプライソソームの初期の進化の起源」。Nature . 443 ( 7113): 863–6。Bibcode : 2006Natur.443..863R。doi :10.1038/nature05228。PMID 17051219。S2CID 4419061。
- ^ abc Schneider C, Will CL, Brosius J, Frilander MJ, Lührmann R (2004 年 6 月). 「ショウジョウバエにおける進化的に異なる U11 小型核リボ核タンパク質粒子の同定」(PDF) . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 101 (26): 9584–9. Bibcode :2004PNAS..101.9584S. doi : 10.1073/pnas.0403400101 . PMC 470718 . PMID 15210936.
- ^ abcd Will CL、Schneider C、Hossbach M、Urlaub H、Rauhut R、Elbashir S、Tuschl T、Lührmann R (2004 年 6 月)。「ヒト 18S U11/U12 snRNP には、U2 依存性スプライソソームには見られない一連の新規タンパク質が含まれています」。RNA . 10 ( 6): 929–41. doi :10.1261/rna.7320604. PMC 1370585 . PMID 15146077。
- ^ Kolossova I 、Padgett RA (1997 年 3 月)。「U11 snRNA は、U12 依存性 (AU - AC) プレ mRNA イントロンの5' スプライス部位と生体内で相互作用する」。RNA。3 (3): 227–33。PMC 1369475。PMID 9056760 。
- ^ ab Verbeeren J、Niemelä EH、Turunen JJ、Will CL、Ravantti JJ、Lührmann R、Frilander MJ (2010 年 3 月)。「スプライシング制御の古代のメカニズム: 選択的スプライシングの活性化因子としての U11 snRNP」。Molecular Cell。37 ( 6 ) : 821–33。doi : 10.1016 /j.molcel.2010.02.014。hdl : 11858/ 00-001M -0000-0012-D5F2-D。PMID 20347424 。
- ^ Kashyap, Luv; Tripathi Parul. 「選択的スプライシング: 1 つの遺伝子が多数のタンパク質を作る仕組み」(PDF)。バイオサイエンス解説。
外部リンク
- Rfamの U11 スプライソソーム RNA のページ