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化学では、三角錐は、頂点に1 つの原子があり、三角形の底面の角に 3 つの原子がある分子の幾何学で、正四面体に似ています (正四面体幾何学と混同しないでください)。 角の 3 つの原子がすべて同じ場合、分子は点群C 3vに属します。 三角錐幾何学を持つ分子やイオンには、プニクトゲン水素化物(XH 3 )、三酸化キセノン (XeO 3 )、塩素酸イオンClO − 3、亜硫酸イオンSO 2− 3などがあります。有機化学では、三角錐幾何学を持つ分子は、sp 3混成と表現されることがあります。VSEPR 理論のAXE 法では、分類は AX 3 E 1であるとされています。
アンモニア中の窒素は5個の価電子を持ち、3個の水素原子と結合してオクテット則を満たします。これにより、各結合角がarccos (− 1 / 3 ) ≈ 109.5°となる正四面体の幾何構造になります。しかし、3個の水素原子は孤立電子対によって反発され、幾何構造は107°の結合角を持つ三角錐（正3面ピラミッド）に歪みます。対照的に、三フッ化ホウ素は平面構造で、ホウ素には孤立電子対がないため、三角平面幾何構造をとります。アンモニアでは、三角錐は急速に窒素反転を起こします。[ 1 ]
