ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| THBS3 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | THBS3、TSP3、トロンボスポンジン3 |
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| 外部ID | オミム:188062; MGI : 98739;ホモロジーン: 5159;ジーンカード:THBS3; OMA :THBS3 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体3(マウス)[2] |
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| | バンド | 3 F1|3 39.01 cM | 始める | 89,122,487 bp [2] |
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| 終わり | 89,134,144 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 右子宮管
- 脛骨
- 子宮体部
- 右精巣
- 左精巣
- 右冠動脈
- 左子宮管
- 脛骨神経
- 上腕二頭筋の腱
- 子宮頸管
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| | トップの表現 | - 心室帯
- 精母細胞
- 肺胞上皮
- リップ
- 足首
- 右肺葉
- 足首関節
- 食道
- 輸出管
- 精子細胞
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- カルシウムイオン結合
- ヘパリン結合
- 細胞外マトリックス構造成分
| | 細胞成分 |
- 細胞質の核周囲領域
- 細胞外領域
- 細胞外マトリックス
- 細胞外空間
- コラーゲン含有細胞外マトリックス
| | 生物学的プロセス |
- 成長板軟骨の発達
- 骨の成熟に関わる骨化
- 細胞-マトリックス接着
- 細胞接着
- 骨梁形成
- 細胞外マトリックスの組織化
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001252607 NM_001252608 NM_007112 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001239536 NP_001239537 NP_009043 |
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| 場所 (UCSC) | 1 章: 155.2 – 155.21 Mb | 3 章: 89.12 – 89.13 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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トロンボスポンジン3(TSP3)は、ヒトではTHBS3遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、トロンボスポンジンファミリーに属します。トロンボスポンジンファミリーのメンバーは、細胞間および細胞とマトリックスの相互作用を媒介する接着性糖タンパク質です。TSP3は骨格成熟の調節に関与していることが判明しています。 [7]このタンパク質は、単一のジスルフィド結合によって結合した五量体分子を形成します。この遺伝子は、メタキシン1と共通のプロモーターを共有しています。 [6] SARS-CoV-2感染に対する遺伝的感受性に関連する1番染色体上の遺伝子として特定されています。[8]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000169231 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000028047 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Vos HL、Devarayalu S、de Vries Y、Bornstein P (1992 年 6 月)。「トロンボスポンジン 3 (Thbs3)、トロンボスポンジン遺伝子ファミリーの新しいメンバー」。The Journal of Biological Chemistry。267 ( 17 ): 12192– 12196。doi : 10.1016 /S0021-9258(19)49823-2。PMID 1601886 。
- ^ ab "Entrez Gene: THBS3 トロンボスポンジン 3".
- ^ Hankenson KD、Hormuzdi SG、Meganck JA、Bornstein P (2005 年 7 月)。「トロンボスポンジン 3 遺伝子の破壊を受けたマウスは骨の幾何学的および生体力学的特性が異なり、大腿骨頭の発達が促進される」。分子 細胞生物学。25 (13): 5599– 5606。doi :10.1128/ MCB.25.13.5599-5606.2005。PMC 1156967。PMID 15964815。
- ^ Niemi ME、Karjalainen J、Liao RG、Neale BM、Daly M、Ganna A、他。 (2021年12月)。 「新型コロナウイルス感染症のヒト遺伝子構造のマッピング」。自然。600 (7889): 472–477。ビブコード:2021Natur.600..472C。土井:10.1038/s41586-021-03767-x。PMC 8674144。PMID 34237774。S2CID 235776838 。
さらに読む
- O'Rourke KM、 Laherty CD、Dixit VM (1992 年 12 月)。「トロンボスポンジン 1 とトロンボスポンジン 2 は、ホモ三量体とヘテロ三量体の両方として発現される」。The Journal of Biological Chemistry。267 ( 35): 24921– 24924。doi : 10.1016/S0021-9258(19)73983-0。PMID 1459996。
- Adolph KW、Long GL、Winfield S、 Ginns EI 、Bornstein P (1995 年 5 月)。「ヒトトロンボスポンジン 3 遺伝子 (THBS3) の構造と構成」。ゲノミクス。27 ( 2 ) : 329– 336。doi : 10.1006/geno.1995.1050。PMID 7558000。
- Qabar A、Derick L、Lawler J、Dixit V (1995 年 5 月)。「トロンボスポンジン 3 は、2 つのシステイン残基を含む鎖間ジスルフィド結合によって結合された五量体分子です」。The Journal of Biological Chemistry。270 ( 21): 12725– 12729。doi : 10.1074/ jbc.270.21.12725。PMID 7759526。
- Maruyama K, Sugano S (1994年1月). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」. Gene . 138 ( 1–2 ): 171–174 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Qabar AN、Lin Z、Wolf FW、O'Shea KS、 Lawler J、Dixit VM (1994 年 1 月)。「トロンボスポンジン 3 は発達的に調節されるヘパリン結合タンパク質です」。The Journal of Biological Chemistry。269 ( 2): 1262– 1269。doi : 10.1016/ S0021-9258 (17)42252-6。PMID 8288588。
- Bornstein P、Devarayalu S、Edelhoff S、Disteche CM (1993 年 3 月)。「マウストロンボスポンジン 3 (Thbs3) 遺伝子の分離と特性」。Genomics . 15 ( 3): 607– 613. doi :10.1006/geno.1993.1114. PMID 8468055。
- Winfield SL、Tayebi N、Martin BM 、 Ginns EI、Sidransky E (1997 年 10 月)。「染色体 1q21 上のグルコセレブロシダーゼ遺伝子座に隣接する 3 つの追加遺伝子の特定: ゴーシェ病への影響」。ゲノム研究。7 ( 10 ): 1020– 1026。doi :10.1101 / gr.7.10.1020。PMC 310674。PMID 9331372。
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997年10月). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 ( 1– 2): 149– 156. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Adolph KW (1999 年5月)。「ヒト組織におけるトロンボスポンジン 2およびトロンボスポンジン 3 mRNA の相対的存在量」。生化学および生物物理学的研究通信。258 (3): 792– 796。doi :10.1006/bbrc.1999.0710。PMID 10329465 。
- Adolph KW 、 Bornstein P (1999 年 7 月)。「ヒトトロンボスポンジン 3 遺伝子: 転写開始と選択的スプライシング転写の分析」。分子細胞生物学研究通信。2 (1): 47– 52。doi :10.1006/ mcbr.1999.0148。PMID 10527891 。
- Carron JA、Hiscott P、Hagan S、Sheridan CM、Magee R、Gallagher JA (2001)。「培養されたヒト網膜色素上皮細胞はトロンボスポンジン-1、-2、-3、および-4を差別的に発現する」。国際生化学・細胞生物学誌。32 ( 11– 12 ) : 1137– 1142。doi : 10.1016/S1357-2725(00)00065-0。PMID 11137453 。
- Armstrong DJ、Hiscott P、Batterbury M、Kaye S (2002 年 6 月)。「角膜間質細胞 (ケラトサイト) は創傷修復表現型においてトロンボスポンジン 2 および 3 を発現する」。国際生化学・細胞生物学誌。34 (6): 588– 593。doi :10.1016/S1357-2725(01)00157-1。PMID 11943589 。
- Dalla-Torre CA、Yoshimoto M、Lee CH、Joshua AM、de Toledo SR、Petrilli AS、他 (2006 年 10 月)。「骨肉腫患者の生物学的行動と生存に対する THBS3、SPARC、SPP1 発現の影響」。BMC Cancer。6 : 237。doi : 10.1186 / 1471-2407-6-237。PMC 1609181。PMID 17022822。