タニャ・シュタドラー | |
|---|---|
2023年のスタドラー | |
| 生まれる | 1981 |
| 国籍 | スイス、ドイツ |
| 科学者としてのキャリア | |
| フィールド | 系統学 |
| 機関 | チューリッヒ工科大学 |
ターニャ・シュタドラーは数学者であり、スイス連邦工科大学チューリッヒ校(ETHチューリッヒ)の計算進化学教授です。彼女は現在、スイスのCOVID-19科学諮問委員会の会長であり、 ETHチューリッヒ校の生物システム科学工学部の副学部長です。
キャリア
ターニャ・シュタドラーは、ミュンヘン工科大学、カーディフ大学、カンタベリー大学で応用数学と統計学を学びました。[1]ミュンヘン工科大学に進学し、2008年に「進化する樹木 - 系統学における種分化と絶滅のモデル」というテーマで博士号を取得しました(アヌシュ・タラズ教授、マイク・スティール教授と共著)。[2]チューリッヒ工科大学環境システム科学科のセバスチャン・ボンヘッファー教授のもとでポスドク研究員として働いた後、2011年にチューリッヒ工科大学ジュニアグループリーダーに昇進しました。2014年にチューリッヒ工科大学生物システム科学工学科の助教授となり、2017年に准教授、2021年に教授に昇進しました。[3]
研究
科学的貢献
Tanjaの研究は、進化論の観点から生命科学、特に大進化、疫学、発生生物学、免疫学における中核的な疑問に取り組んでいます。彼女の研究課題には、種分化のプロセスが現在の生物多様性にどのようにつながったかなどの基本的な側面や、 COVID-19やエボラのような病原体の拡散など、人間社会に直接関係する疑問が含まれています。Tanjaは、統計的系統動態ツール[4]を開発して適用し、ゲノム配列データから進化と個体群の動態を推定することでこれらの疑問を評価し、同時にコンソーシアムを率いてそのようなデータを作成しています。彼女のユニークなアプローチは、数学、コンピューターサイエンス、生物学を革新的に組み合わせたものです。
タニャは、系統樹の文脈で出生・死亡プロセスを使用する統計的枠組みを開発することで、系統動態学の分野に多大な理論的貢献をしました。 [5]特に、出生・死亡モデルにおける時間の経過に伴うサンプリングを説明する基礎を築き、疫病発生時に時間経過とともに収集された遺伝子配列データの一貫した分析や、化石(時間経過とともに順次収集)と現在の種のデータの一貫した分析を可能にしました。[6]
タニャはこの枠組みを使って、例えばHCVの拡散や2014年のエボラ出血熱の流行の定量化、ジカ熱の拡散の評価、都市部でのインフルエンザの流行の波が主に移動パターンによって引き起こされていることの実証、 COVID-19パンデミック中のリアルタイム情報の提供などを行った。[7] [8] [9]大進化論では、タニャは特に恐竜の絶滅が哺乳類の多様化に与えた影響を研究した。[10]最近では、統計的樹木思考を発生生物学に導入している。[11]
彼女のグループは2016年に「Taming the BEAST」を設立しました。BEAST 2は、ゲノム配列データから進化と個体群動態を推測することを可能にする、広く使用されているベイズ系統学ソフトウェアプラットフォームであり、Tanjaのチームは多くのパッケージに貢献しました。「Taming the BEAST」は、BEAST 2の使用方法を教える国際ワークショップシリーズとオンラインリソースの両方です。[12] [13]
疫学の分野では、ターニャは現在、病原体の拡散を理解するために廃水情報を利用する研究を先導しています。彼女は、ETHチューリッヒとEawagのプロジェクトの主任研究員です。彼女のチームは、廃水からのSARS-CoV-2とインフルエンザの再生産数を推定し、変異体の動態の理解に貢献しています。[14]
アウトリーチと政治関与
COVID-19パンデミックの間、タニャはスイス国立COVID-19科学タスクフォースのプレジデントを務め、2021年8月からタスクフォースが終了する2022年3月まで、スイスの当局や意思決定者に助言を行った。 [15]彼女はタスクフォースのデータおよびモデリンググループのメンバー、後に議長を務めた後、プレジデントに就任した。彼女はパンデミックの状況をスイス連邦政府と関係当局に毎週報告する責任を負っていた。さらに、連邦政府全体、連邦政府と州政府の行政機関のメンバー、およびスイス議会のさまざまな部門とのブリーフィングで、科学的知見を発表した。
タニャはタスクフォースに中核的な科学的知見を積極的に提供した。彼女が毎日計算していた再生産数は、流行監視の重要な部分となった。[16]再生産数は、国の「2020年6月19日のCOVID-19流行に対抗するための特別事態における措置に関する条例」で採用された。さらに、再生産数ダッシュボードは、南アフリカ保健省が新しい変異体オミクロンについて世界に知らせた際にも注目された。タニャはまた、スイスを拠点とする最も広範なSARS-CoV-2シークエンシングの取り組みを主導し、新しい変異体の出現と拡散に関する結果を提供した。[17]この取り組みを通じて、スイスで最初のベータ、ガンマ、デルタ変異体が検出されました。[18] [19]
プラットフォームcov-spectrumはTanjaのチームによって開発され、SARS-CoV-2変異体の追跡に不可欠なものとなった。[20]これはSARS-CoV-2系統の指定を容易にするために広く使用されており、ワクチンの更新のためのSARS-CoV-2株の可能性を議論するFDA諮問委員会会議などの政策にも使用されている。mpoxの発生中、チームは新たに広がるウイルスを追跡するために数日以内にmpox-spectrumを立ち上げた。[21]
政府への助言や政策立案者への情報提供に加え、彼女はパンデミックの状況を国民に知らせることにも積極的に関わるようになった。タンジャはスイス国内のニュースや全国テレビ番組、連邦記者会見を通じて科学的知見を頻繁に伝えた。[22]
私生活
シュタドラーはパートナーと二人の娘とともにバーゼルに住んでいる。[23]
受賞と栄誉
- 2008年 TUM博士号受賞[1]
- 2012年ヨーロッパ進化生物学会ジョン・メイナード・スミス賞[24]
- 2013年ERC助成金開始[3]
- 2013年 ETHラシス賞[3]
- 2013年ゾンタ賞[25]
- 2016年 ETHゴールデンアウル賞受賞[26]
- 2021年:SMBE中堅社員優秀賞。
- 2021年:ドイツ国立科学アカデミー・レオポルディーナのカルス賞[27]
- 2022年:レスラー賞[28]
- 2022年:クラリベイト誌による高引用研究者[29]
- 2023年:ドイツ国立科学アカデミー会員レオポルディーナ[30]
参考文献
- ^ ab “CV Tanja Stadler” . 2020年1月1日閲覧。
- ^ 「PhD thesis Tanja Stadler」(PDF) 。 2019年1月1日閲覧。
- ^ abc 「ETH Latsis Prize 2013」。2013年11月8日。 2018年12月30日閲覧。
- ^ Tanja Stadler (2015 年 7 月)、「ゲノムデータの系統動態分析による伝染病の蔓延の根本原因の解明」、Trends in Microbiology、23 (7): 383–386、doi :10.1016/j.tim.2015.04.007、PMID 26139467
- ^ Tanja Stadler (2009 年 11 月)、「出生死亡モデルにおける不完全サンプリングとサンプリングベースの合流点との関連について」、Journal of Theoretical Biology、261 (1): 58–66、Bibcode :2009JThBi.261...58S、doi :10.1016/j.jtbi.2009.07.018、PMID 19631666
- ^ Tanja Stadler (2014 年 7 月)、「発散時間推定値の一貫した較正のための化石化した誕生と死のプロセス」、PNAS、111 (29): E2957–E2966、arXiv : 1310.2968、Bibcode :2014PNAS..111E2957H、doi : 10.1073/pnas.1319091111、PMC 4115571、PMID 25009181
- ^ Tanja Stadler (2012年12月)、「出生死亡スカイラインプロットはHIVとC型肝炎ウイルス(HCV)の流行拡大の経時的変化を明らかにする」、PNAS、110(1):228–233、doi:10.1073/pnas.1207965110、PMC 3538216、PMID 23248286
- ^ Tanja Stadler (2020年11月)、「 系統学による都市内インフルエンザA/H3N2の流行拡大の特徴づけ」、 PLOS Pathogens、16 (11): e1008984、doi : 10.1371/journal.ppat.1008984、PMC 7676729、PMID 33211775
- ^ Tanja Stadler (2021年2月)、「ヨーロッパにおけるSARS-CoV-2の起源と初期の拡散」、PNAS、118 (9)、Bibcode :2021PNAS..11812008N、doi : 10.1073/pnas.2012008118、PMC 7936359、PMID 33571105
- ^ Tanja Stadler (2021年3月)、「哺乳類の系統発生は最近の多様化率の変化を明らかにする」、米国科学アカデミー紀要、108 (15): 6187–6192、doi : 10.1073/pnas.1016876108、PMC 3076834、PMID 21444816
- ^ Tanja Stadler (2021年3月)、「細胞生物学者のための系統動態」、Science、371 (6526)、doi :10.1126/science.aah6266、PMID 33446527、S2CID 231606785
- ^ Tanja Stadler (2017年6月)、「Taming the BEAST」、Systematic Biology、67 (1): 170–174、doi :10.1093/sysbio/syx060、PMC 5925777、PMID 28673048
- ^ Tanja Stadler (2019年4月)、「BEAST 2.5: ベイズ進化解析のための高度なソフトウェアプラットフォーム」、PLOS Computational Biology、15 (4): e1006650、Bibcode :2019PLSCB..15E6650B、doi : 10.1371/journal.pcbi.1006650、PMC 6472827、PMID 30958812
- ^ Tanja Stadler (2022年5月)、「廃水に基づくSARS-CoV-2の有効再生産数の推定」、Environmental Health Perspectives、130 (5)、doi :10.1289/EHP10050、PMC 9135136、PMID 35617001
- ^ 「スイス国立COVID-19科学タスクフォース」。
- ^ サイア、ジェレミー;ヤナ・S・ハウスマン;アングスト、ダニエル・C.李、錦州。ネハー、リチャード A.マーティス、マーローズ H.ボンヘッファー、セバスチャン。スタドラー、ターニャ (2022)。 「SARS-CoV-2の実効再生産数の推定と世界規模のモニタリング」。eライフ。11.土井: 10.7554/eLife.71345。PMC 9467515。PMID 35938911。
- ^ 「スイスSARS-CoV-2シーケンシングコンソーシアム(S3C)」。
- ^ Tanja Stadler (2022年8月)、「SARS-CoV-2の実効再生産数の推定と世界規模の監視」、eLife、11、doi:10.7554/eLife.71345、PMC 9467515、PMID 35938911
- ^ Tanja Stadler (2022 年 6 月)、「バイオインフォマティクスのボトルネックへの対処によるゲノム疫学の推進: 課題、設計原則、スイスの例」、Epidemics、39、doi :10.1016/j.epidem.2022.100576、PMC 9107180、PMID 35605437
- ^ 「CoV-Spectrum: 新しい変異体を識別し特徴付けるために世界中で共有されているSARS-CoV-2データの分析」。
- ^ 「ジェンスペクトラム」.
- ^ 「COVID-19パンデミック」。
- ^ 「データハンター • ETHチューリッヒ財団」ETHチューリッヒ財団. 2024年11月1日閲覧。
- ^ 「ジョン・メイナード・スミス賞」 。 2019年1月1日閲覧。
- ^ 「Prix Zonta」 . 2019年1月1日閲覧。
- ^ 「ETH Golden Owl」 。 2019年1月1日閲覧。
- ^ “Leopoldina verleiht Carus-Medaillen、Tanja Stadler、Dominic Bresser”. Nachrichten aus der Wissenschaft » idw (ドイツ語)。 2021-09-01 。2023 年 12 月 2 日に取得。
- ^ “ターニャ・スタッドラーがレスラー賞を受賞”.チューリッヒ工科大学。 2022-06-23 。2024 年 11 月 1 日に取得。
- ^ 「Tanja Stadler、2022年に最も引用されたETH研究者の一人に」ETH Zurich . 2022-11-15 . 2024-11-01閲覧。
- ^ 「ミットグリーダー」. Nationale Akademie der Wissenschaften Leopoldina (ドイツ語)。 2023 年 6 月 29 日。2023 年12 月 2 日に取得。
外部リンク
- ETH チューリッヒ 生物システム科学工学部 – 計算進化グループ
- ジェンスペクトラム
- 廃水再生エネルギー
- 野獣を飼いならす
- ターニャ・シュタドラーの作品に関する報道の抜粋
