トラック2

トラック2
識別子
エイリアス	TRAK2、ALS2CR3、CALS-C、GRIF-1、GRIF1、MILT2、OIP98、キネシンタンパク質2の輸送
外部ID	オミム：607334; MGI : 1918077;ホモロジーン: 22861;ジーンカード：TRAK2; OMA :TRAK2 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体2（ヒト）
終わり	201,451,500 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体1（マウス）
終わり	58,973,430 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	迷走神経背側運動核; ; 視神経; ; 海綿骨; ; 上腕二頭筋の腱; ; 脈絡叢上皮; ; 下オリーブ核; ; C1セグメント; ; 迷走神経下神経節; ; 右心室; ; 視床下核;
	トップの表現
	淡蒼球; ; 耳石器官; ; 二腹筋; ; 卵形嚢; ; 骨髄; ; ヒラメ筋; ; 外側広筋; ; 脊髄の腰椎部分; ; 上頸神経節; ; 側頭筋;
	参照表現データの詳細
	; ;
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	シグナル伝達受容体結合; タンパク質結合; GABA受容体結合; キネシン結合; TPRドメイン結合; 酵素結合; ミオシン結合;
細胞成分	細胞質; エンドソーム; 細胞膜; 初期エンドソーム; ミトコンドリア; 核; 樹状突起細胞質; 樹状突起; ニューロン投影; ソーマ; 軸索成長円錐; 細胞質小胞; 軸索細胞質;
生物学的プロセス	RNAポリメラーゼIIによる転写の調節; タンパク質標的; タンパク質のO結合型糖鎖; ミトコンドリアの順行性樹状突起輸送; エンドソームからリソソームへの輸送; 樹状突起の形態形成; 軸索形成の負の調節; ミトコンドリアの樹状突起輸送; 順行性軸索輸送; タンパク質の局在; 神経新生; 微小管に沿った小胞輸送; ミトコンドリアの分布; ミトコンドリアの順行性軸索輸送;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	66008
	70827
	ENSG00000115993
	ENSMUSG00000026028
	O60296
	該当なし
	NM_015049
	NM_172406
	NP_055864
	該当なし
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

トラフィッキングキネシン結合タンパク質2は、ヒトではTRAK2遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]^[7]

インタラクション

TRAK2はKir2.1 ^[8]およびGABRB2 ^[9]と相互作用することが示されている。

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000115993 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000026028 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Hadano S, Yanagisawa Y, Skaug J, Fichter K, Nasir J, Martindale D, Koop BF, Scherer SW, Nicholson DW, Rouleau GA, Ikeda J, Hayden MR (2001 年 1 月)。「若年性筋萎縮性側索硬化症 (ALS2) の重要領域である染色体 2q33-q34 における 3 つの新規遺伝子 ALS2CR1、ALS2CR2、および ALS2CR3 のクローニングと特性評価: ALS2 の候補遺伝子」。Genomics . 71 ( 2): 200–13. doi :10.1006/geno.2000.6392. PMID 11161814。
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^ 「Entrez Gene: TRAK2 輸送タンパク質、キネシン結合 2」。
^ Grishin A, Li H, Levitan ES, Zaks-Makhina E (2006 年 10 月). 「K+ チャネル Kir2.1 の輸送因子としての gamma-aminobutyric acid 受容体相互作用因子 1 (TRAK2) の同定」. The Journal of Biological Chemistry . 281 (40): 30104–11. doi : 10.1074/jbc.M602439200 . PMID 16895905.
^ Beck M、Brickley K、Wilkinson HL、Sharma S、Smith M、Chazot PL、Pollard S、Stephenson FA (2002 年 8 月)。「新規 GABAA 受容体関連タンパク質 GRIF-1 の同定、分子クローニング、および特性評価」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 33): 30079–90。doi : 10.1074/ jbc.M200438200。PMID 12034717。

さらに読む

長瀬孝文、石川健、宮島直、田中明、小谷秀、野村直、小原修 (1998 年 2 月)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。IX. 試験管内で大きなタンパク質をコードできる脳由来の 100 個の新しい cDNA クローンの完全な配列」。DNA研究。5 ( 1): 31–9。doi : 10.1093/dnares/ 5.1.31。PMID 9628581 。
Machado RD、Pauciulo MW、Fretwell N、Veal C、Thomson JR、Vilariño Güell C、Aldred M、Brannon CA、Trembath RC、Nichols WC (2000 年 9 月)。「家族性原発性肺高血圧症の遺伝子 PPH1 の臨界間隔の改良に基づく物理および転写マップ。国際 PPH コンソーシアム」。Genomics . 68 ( 2): 220–8. doi :10.1006/geno.2000.6291. PMID 10964520。
Beck M、Brickley K、Wilkinson HL、Sharma S、Smith M、Chazot PL、Pollard S、Stephenson FA (2002 年 8 月)。「新規 GABAA 受容体関連タンパク質 GRIF-1 の同定、分子クローニング、および特性評価」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 33): 30079–90。doi : 10.1074/ jbc.M200438200。PMID 12034717。
Iyer SP、Akimoto Y、Hart GW (2003 年 2 月)。「O-GlcNAc トランスフェラーゼと相互作用するコイルドコイルドメインタンパク質の新規ファミリーの同定とクローニング」。The Journal of Biological Chemistry。278 ( 7): 5399–409。doi : 10.1074 /jbc.M209384200。PMID 12435728。
Brickley K、Smith MJ、Beck M、Stephenson FA (2005 年 4 月)。「GRIF-1 および OIP106、コイルドコイルドメインタンパク質の新規遺伝子ファミリーのメンバー: キネシンとの生体内および生体外での関連性」。The Journal of Biological Chemistry。280 ( 15): 14723–32。doi : 10.1074/ jbc.M409095200。PMID 15644324。
Fransson S、Ruusala A、Aspenström P (2006 年 6 月)。「非定型 Rho GTPase Miro-1 および Miro-2 はミトコンドリア輸送に重要な役割を果たす」。生化学および生物物理学的研究通信。344 (2): 500–10。doi :10.1016/ j.bbrc.2006.03.163。PMID 16630562 。
Smith MJ、Pozo K、Brickley K、Stephenson FA (2006 年 9 月)。「キネシン KIF5C の GRIF-1 結合ドメインのマッピングにより、貨物の順行輸送におけるアダプタータンパク質としての GRIF-1 の役割が実証される」。The Journal of Biological Chemistry。281 ( 37): 27216–28。doi : 10.1074/ jbc.M600522200。PMID 16835241。
Grishin A、Li H、Levitan ES、Zaks-Makhina E (2006 年 10 月)。「K+ チャネル Kir2.1 の輸送因子としての γ-アミノ酪酸受容体相互作用因子 1 (TRAK2) の同定」。The Journal of Biological Chemistry。281 ( 40): 30104–11。doi : 10.1074/ jbc.M602439200。PMID 16895905。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000115993 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000026028 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid11161814-5] Hadano S, Yanagisawa Y, Skaug J, Fichter K, Nasir J, Martindale D, Koop BF, Scherer SW, Nicholson DW, Rouleau GA, Ikeda J, Hayden MR (2001 年 1 月)。「若年性筋萎縮性側索硬化症 (ALS2) の重要領域である染色体 2q33-q34 における 3 つの新規遺伝子 ALS2CR1、ALS2CR2、および ALS2CR3 のクローニングと特性評価: ALS2 の候補遺伝子」。Genomics . 71 ( 2): 200–13. doi :10.1006/geno.2000.6392. PMID 11161814。

[pmid16380713-6] Gilbert SL、Zhang L、Forster ML、Anderson JR、Iwase T、Soliven B、Donahue LR、Sweet HO、Bronson RT、Davisson MT、Wollmann RL、Lahn BT (2006 年 2 月)。「Trak1 変異は高張マウスの GABA(A) 受容体恒常性を乱す」。Nature Genetics。38 ( 2 ) : 245–50。doi :10.1038/ng1715。PMID 16380713。S2CID 20231963 。

[entrez-7] 「Entrez Gene: TRAK2 輸送タンパク質、キネシン結合 2」。

[pmid16895905-8] Grishin A, Li H, Levitan ES, Zaks-Makhina E (2006 年 10 月). 「K+ チャネル Kir2.1 の輸送因子としての gamma-aminobutyric acid 受容体相互作用因子 1 (TRAK2) の同定」. The Journal of Biological Chemistry . 281 (40): 30104–11. doi : 10.1074/jbc.M602439200 . PMID 16895905.

[pmid12034717-9] Beck M、Brickley K、Wilkinson HL、Sharma S、Smith M、Chazot PL、Pollard S、Stephenson FA (2002 年 8 月)。「新規 GABAA 受容体関連タンパク質 GRIF-1 の同定、分子クローニング、および特性評価」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 33): 30079–90。doi : 10.1074/ jbc.M200438200。PMID 12034717。