| TPM4 |
|---|
|
| 識別子 |
|---|
| 別名 | TPM4、HEL-S-108、トロポミオシン4 |
|---|
| 外部ID | オミム: 600317 ; MGI : 2449202 ;ホモロジーン: 100849 ;ジーンカード: TPM4 ; OMA : TPM4 - オルソログ |
|---|
|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| Bgee | | 人間 | マウス(相同体) |
|---|
| トップは | - 上腕二頭筋腱
- 子宮内膜の間質細胞
- 右冠動脈
- 胆嚢
- 上行大動脈
- 子宮体部
- 左卵管
- 平滑筋組織
- 下行胸部大動脈
- 脛骨動脈
|
| | トップは | - 生殖器結節
- 胚の尾
- 臍帯
- 左肺葉
- 下顎隆起
- 上顎隆起
- 真皮
- リンパ管の内皮細胞
- 精管
- 腹壁
|
| | より多くの参照発現データ |
|
|---|
| バイオGPS |   | | より多くの参照発現データ |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 | - カルシウムイオン結合
- アクチン結合
- 筋肉の構造構成要素
- タンパク質結合
- 金属イオン結合
- 同一のタンパク質結合
- タンパク質ホモ二量体化活性
- タンパク質ヘテロ二量体化活性
- アクチンフィラメント結合
| | 細胞成分 | - 細胞質
- 線状アクチン
- ポドソーム
- 細胞質
- 筋肉の細いフィラメント、トロポミオシン
- 皮質細胞骨格
- 細胞外エクソソーム
- 細胞骨格
- 膜
- ストレス繊維
- 焦点接着
- アクチンフィラメント
- アクチン細胞骨格
| | 生物学的プロセス | - 骨芽細胞の分化
- 筋フィラメントの滑り
- 筋肉の収縮
- アクチンフィラメントの組織化
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
| オルソログ |
|---|
| 種 | 人間 | ねずみ |
|---|
| アントレ | | |
|---|
| アンサンブル | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq(mRNA) | |
|---|
NM_001145160 NM_003290 NM_001367836 NM_001367837 NM_001367838 |
| |
|---|
| RefSeq(タンパク質) | |
|---|
NP_001138632 NP_003281 NP_001354765 NP_001354766 NP_001354767 |
| |
|---|
| 所在地(UCSC) | Chr 19: 16.07 – 16.1 Mb | Chr 8: 72.88 – 72.91 MB |
|---|
| PubMed検索 | [ 3 ] | [ 4 ] |
|---|
|
| ウィキデータ |
|
トロポミオシンα4鎖は、ヒトではTPM4遺伝子によってコードされるタンパク質である。 [ 5 ] [ 6 ]
参考文献
- 1 2 3 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000167460 – Ensembl、2017年5月
- 1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031799 – Ensembl、2017年5月
- ↑ 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ↑ 「マウス PubMed 参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ↑ Wilton SD、Lim L、Dorosz SD、Gunn HC、Eyre HJ、Callen DF、Laing NG (1996年7月)。「蛍光in situハイブリダイゼーションによるヒトα-トロポミオシン遺伝子TPM4のバンド19p13.1への割り当て」。Cytogenet Cell Genet . 72 (4): 294–6 . doi : 10.1159/000134206 . PMID 8641132 .
- ↑ 「Entrez Gene: TPM4 トロポミオシン 4」。
さらに読む
- Rasmussen HH、van Damme J、Puype M、et al . (1993)「正常ヒト表皮ケラチノサイトの二次元ゲルタンパク質データベースに記録された145タンパク質のマイクロシーケンス」。Electrophoresis。13 ( 12 ) : 960–9。doi : 10.1002 / elps.11501301199。PMID 1286667。S2CID 41855774。
- MacLeod AR、Talbot K、Smillie LB、Houlker C (1987)「ヒト線維芽細胞トロポミオシンTM30p1をコードする遺伝子ファミリーを定義するcDNAの特性解析」J. Mol. Biol . 194 (1): 1– 10. doi : 10.1016/0022-2836(87)90710-8 . PMID 3612796 .
- MacLeod AR、Houlker C、Reinach FC、et al. (1986) 「ヒト線維芽細胞における筋型トロポミオシン:代替RNAスプライシング機構による発現の証拠」 Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 82 (23): 7835–9 . doi : 10.1073/pnas.82.23.7835 . PMC 390864 . PMID 3865200 .
- Lawrence B、Perez-Atayde A、Hibbard MK、et al. (2000) 「炎症性筋線維芽細胞腫瘍におけるTPM3-ALKおよびTPM4-ALK癌遺伝子」 . Am . J. Pathol . 157 (2): 377–84 . doi : 10.1016/S0002-9440(10)64550-6 . PMC 1850130. PMID 10934142 .
- Meech SJ 、 McGavran L、Odom LFら (2001)。 「トロポミオシン4-未分化リンパ腫キナーゼ遺伝子融合を含むナチュラルキラー細胞特性を有する小児期のまれな髄外血液悪性腫瘍」。Blood。98(4 ):1209-16。doi:10.1182 / blood.V98.4.1209。PMID 11493472。
- Yi J、Kloeker S、Jensen CC、et al. (2002) 「ZyxinファミリーのLIMタンパク質は、 p130Casファミリーのシグナル伝達因子と相互作用する」 J. Biol. Chem . 277 (11): 9580–9 . doi : 10.1074/jbc.M106922200 . PMID 11782456 .
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、et al. (2003) 「15,000を超える全長ヒトおよびマウスcDNA配列の生成と初期解析」 . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Gevaert K、Goethals M、Martens L、et al. (2004)「質量分析法による選別N末端ペプチドの同定によるプロテオームの 探索とタンパク質プロセシングの解析」Nat. Biotechnol . 21 (5): 566–9 . doi : 10.1038/nbt810 . PMID 12665801. S2CID 23783563 .
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "21,243個の全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
- Lin KT、Lu RM、Tarn WY (2004) 「WWドメイン含有タンパク質は初期スプライソソームと相互作用し、生体内でのプレmRNAスプライシングに関与する」。Mol . Cell. Biol . 24 (20): 9176–85 . doi : 10.1128 / MCB.24.20.9176-9185.2004 . PMC 517884. PMID 15456888 .
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、et al. (2004) 「NIH全長cDNAプロジェクトの現状、品質、および拡張:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」 . Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101 /gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .
- Bruneel A、Labas V、Mailloux A、et al . (2006)「エトポシド誘発アポトーシスに適用したヒト臍帯静脈内皮細胞のプロテオミクス」。Proteomics。5 ( 15 ) : 3876–84。doi : 10.1002 / pmic.200401239。PMID 16130169。S2CID 26007149。
- Rual JF、Venkatesan K、Hao Tら(2005)。「ヒトタンパク質間相互作用 ネットワークのプロテオーム規模のマップに向けて」。Nature。437 ( 7062 ):1173–8。Bibcode:2005Natur.437.1173R。doi:10.1038 / nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。