ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| TDRD3 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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1WJI、2LTO、3PMT、3PNW、3S6W |
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| 識別子 |
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| エイリアス | TDRD3、3を含むチューダードメイン |
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| 外部ID | オミム:614392; MGI : 2444023;ホモロジーン: 12771;ジーンカード:TDRD3; OMA :TDRD3 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 14番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 14|14 E1 | 始める | 87,654,075 bp [2] |
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| 終わり | 87,782,940 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - アキレス腱
- 心室帯
- 結腸上皮
- 上腕二頭筋の腱
- 腓腹筋
- 太ももの筋肉
- 神経節隆起
- 腓骨神経
- 膵臓の体
- 脳梁
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| | トップの表現 | - 受精卵
- 性器結節
- 一次卵母細胞
- 内側神経節隆起
- 精母細胞
- 心室中隔
- 胎児の尾
- 精子細胞
- 吻側回遊流
- 脈絡叢上皮
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- メチル化ヒストン結合
- 転写活性化因子活性
- クロマチン結合
- タンパク質結合
- RNA結合
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- エクソン-エクソン接合複合体
- 核
- 核質
- ゴルジ体
- 細胞質
| | 生物学的プロセス |
- 核酸テンプレート転写の制御
- クロマチン組織
- 核酸テンプレート転写の正の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001146070 NM_001146071 NM_030794 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001139542 NP_001139543 NP_110421 |
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| 場所 (UCSC) | 13 章: 60.4 – 60.57 Mb | 14 章: 87.65 – 87.78 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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チューダードメイン含有タンパク質3は、ヒトではTDRD3遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]チューダードメインとUBAタンパク質ドメイン
を含み、3つの異なるタンパク質アイソフォームを有する。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000083544 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000022019 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez Gene: TDRD3 チューダードメイン 3 を含む」。
さらに読む
- Mehrle A、Rosenfelder H、 Schupp I 、他 (2006)。「2006 年の LIFEdb データベース」。Nucleic Acids Res . 34 (データベース号): D415–8。doi : 10.1093/nar/gkj139。PMC 1347501。PMID 16381901。
- Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). 「ORFeome から生物学へ: 機能ゲノミクスパイプライン」Genome Res . 14 (10B): 2136–44. doi :10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336 .
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Simpson JC、Wellenreuther R、Poustka A、et al. (2001)。「大規模cDNAシーケンシングによって同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」。EMBO Rep . 1 (3): 287–92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614 。
- Wiemann S、Weil B、Wellenreuther R、他 (2001)。「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログに向けて:ヒトcDNAをコードする500個の新規完全タンパク質の配列決定および分析」。Genome Res . 11 (3): 422–35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166 。
- Hartley JL、Temple GF、Brasch MA (2001)。「in vitro 部位特異的組み換えを用いた DNA クローニング」。Genome Res . 10 (11): 1788–95. doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863 。