ゾフィー・エウフェミア・フォン・バイエルン(チェコ語: Žofie Bavorská、ドイツ語: Sophie von Bayern、1376年 - 1428年11月4日[ 1 ])は、ボヘミア王、ローマ王、ルクセンブルク公ヴァーツラフの妻であり、ボヘミア女王であった。1419年にヴァーツラフが死去した後、短期間ボヘミアの摂政を務めた。
ゾフィーはヴィッテルスバッハ家の出身で、バイエルン=ミュンヘン公ヨハン2世とその妻ゴリツィアのカタリナの末娘であり、唯一の娘であった。ゾフィーには、バイエルン=ミュンヘン公エルンストとバイエルン公ヴィルヘルム3世という2人の兄がいた。
彼女の父方の祖父母は、バイエルン公シュテファン2世と、その最初の妻であるシチリアのエリザベッタ(シチリア王フリードリヒ3世とアンジューのエレオノールの娘)であった。ソフィアは、フランス王妃イザボー・フォン・バイエルンのいとこにあたる。ソフィアの母方の祖父母は、ゴリツィア伯マインハルト6世とプファンベルクのカタリナであった。
ゾフィーは叔父であるバイエルン公フリードリヒの庇護のもと、ランツフートで育った。ゾフィーは狩猟が好きで、それは将来の夫と共通する点の一つだった。1388年、叔父はゾフィーをプラハに連れて行き、姪の結婚のために政治的な交渉を行った。叔父は、12歳の王女がヴァーツラフに感銘を受けていたこと、そして結婚は政治的な理由によるものであると述べた。ゾフィーの父は、叔父であるフリードリヒ公によって結婚交渉の代理を務められた。
1389年5月2日、プラハでソフィアはローマ王ヴァーツラフと結婚した。ヴァーツラフとソフィアの結婚式は、おそらく国王の宰相ヤン司教によって執り行われた。ヴァーツラフはプラハ大司教と対立しており、ソフィアの戴冠式が危ぶまれていた。彼女が女王として戴冠できるのは、大司教の権限下のみであった。
ヴァーツラフは結婚を祝して、ヴァーツラフ聖書をはじめとする数々の優れた写本を作成した。また、夫婦の貞節に関する写本もあった。二人の関係は幸福だったと伝えられている。ソフィアには子供がいなかった。
ソフィアの夫は確かに無能な統治者ではなかった。年代記では偏った形で描写されている。ソフィアは経済的に有能だったとされている。1393年3月、彼女の告解師である聖ヨハネ・ネポムクは拷問で亡くなった。告解を明かすことを拒否して死んだと言われているが、彼は当時プラハ大司教ヤン・フォン・イェンシュテインとの対立にも巻き込まれていた。1402年から1403年にかけての反乱と夫の投獄の間、彼女はフラデツ・クラーロヴェーに住んでいた。ソフィア女王は当初ヤン・フスの信奉者で、彼の説教を聞き、ヴァーツラフと同様に彼を保護した。しかし、1410年にフスが教皇によって追放されると、彼女は支持を取り下げた。彼女は1415年のフスの死が暴動につながると確信していた。
ヴァーツラフは1419年に死去した。王太后となったソフィアは、義理の兄弟であるハンガリーのジギスムントのもとに身を寄せ、ボヘミア王位継承権を主張するジギスムントを支持した。ソフィアはしばらくの間、ボヘミアの摂政を務めた。
1419年10月、ボヘミアの有力者たちは、法と秩序を守ることを約束して、王太后ソフィアと条約を結んだ。しかし、彼女はすぐに権威を失った。ソフィアとジギスムントはプレシュプルクの土地を共同で管理していた。ソフィアとジギスムントが不倫関係にあったという噂が流れた。ジギスムントは、ボヘミア王太后はきっと再婚するだろう、おそらくポーランド王ヴワディスワフ2世ヤギェウォと結婚するだろうと述べていた。
ソフィアは1428年11月4日に亡くなった。