バイエルン=ミュンヘン公ヨハン2世(1341年- 1397年)(ドイツ語: Johann II, Herzog von Bayern-München)は、1375年からバイエルン=ミュンヘン公であった。彼はシュテファン2世とシチリアのエリザベスの三男であった。[ 1 ]
彼の母方の祖父母はシチリア王フリードリヒ3世とアンジューのエレオノールであった。彼女の両親はナポリ王カール2世とハンガリーのマリア・アルパードであった。
マリアはハンガリー王イシュトヴァーン5世とその妻である王妃エリザベートの娘であり、エリザベートはクマン族の族長ザイハン・オブ・クニの娘で、結婚前は異教徒であった。
ステファン5世はハンガリー王ベーラ4世とマリア・ラスカリナの息子である。マリア・ラスカリナはテオドロス1世ラスカリスとアンナ・アンジェリーナの娘である。アンナは東ローマ皇帝アレクシオス3世とエウフロシネ・ドゥカイナ・カマテリーナの娘である。

1375年から1392年まで、ヨハンは兄弟のシュテファン3世とフリードリヒと共にバイエルン=ランツフートを統治した。1385年、ヨハン2世とその妻はリエンスと共にゴリツィア伯領の3分の1を相続したが、1392年にはハプスブルク家にその部分を売却した。1392年、ヨハンは兄弟2人がベルナボ・ヴィスコンティの娘と結婚していたためイタリアでの冒険に資金援助することを拒否し、またシュテファンの宮廷維持費も高額だったため、バイエルンの新たな分割に着手した。こうしてバイエルン=ランツフート公国は縮小され、バイエルン=インゴルシュタットとバイエルン=ミュンヘンが創設された。フリードリヒはバイエルン=ランツフートを保持し、シュテファンはバイエルン=インゴルシュタットを受け取ったが、すぐにそれを不利な点として扱うようになった。そのため、ヨハンは1395年までのわずか3年間だけバイエルン=ミュンヘンを統治し、その後、兄弟間の武力衝突を経て、再びシュテファンと権力を分かち合うことになった。
ヨハン2世の後を継いだのは息子のエルンストとヴィルヘルム3世で、彼らはついにシュテファン3世に対抗してバイエルン=ミュンヘンにおける単独統治を確立することに成功した。ヨハンはミュンヘンのフラウエン教会に埋葬されている。
ジョンは1372年にゴリツィア伯マインハルト6世とプファンベルクのカタリナの娘、ゴリツィアのカタリナと結婚した[ 1 ] 。彼らの子供は以下の通りである。
彼には非嫡出子のヨハン・グリュンヴァルダー(1393年- 1452年)もおり、彼は枢機卿でありフライジング司教であった。