彼女はスコットランド王ジェームズ4世の命令により、強力なスコットランド海軍を建設するという政策の一環として、 1505年頃にリースで建造された。彼は彼女を新妻マーガレット・チューダーにちなんで命名した。1502年から1506年6月までの造船記録には彼女の建造について言及されているようで、2人のフランス人熟練造船技師ジョン・ローランズとジェネン・デューが作業員の中にいた。アンドリュー・バートンの船員の一部は工事の監視に雇われていた。ジェームズ4世は1505年5月25日に建造途中の船上で晩餐会を開き、ホリールード宮殿からタペストリーと銀器を持ち込んだ。[ 1 ]
建造当時、この船はスコットランド海軍のどの船よりもかなり大きかったが、その後すぐに、さらにかなり大きい軍艦マイケル号に取って代わられた。処女航海として、1506年7月にジェームズ4世をメイ島まで運んだ。 [ 2 ]新しい装備には、9つのクロスボウ、6つの羅針盤、2つの夜間観測用鏡が含まれていた。
ジェームズ4世は自分用に特別な金の笛を注文し、銀製の笛も購入した。船には白い斜め十字の入った青い旗と、フランドル人のナンニク(Nanynek Dierxsoun)が金と絹でスコットランドの赤いライオンを刺繍した黄色の旗があった。[ 3 ]旗とストリーマー用の特別なフランドルの布は、イタリアの商人ジェローム・フレスコバルディに注文された。斜め十字の青い布はライオンの舌と爪の背景にもなっており、「船の旗には聖アンドロイの十字架が描かれた青い布が吹き、旗のライオンの舌と爪には他の色の布が使われた」。[ 4 ]
マーガレット号は1512年にエアースで修理された。[ 5 ] 1512年11月、グレート・マイケル号とマーガレット号はブラックネスにいた。ジェームズ4世は聖アンドリューの日にマイケル号に乗船し、フランス大使シャルル・ド・トック・スール・ド・ラ・モットと謁見した。スコットランドとフランスの古き同盟が確認された。[ 6 ]
1513年の春、マーガレット号はフランス国王ルイ12世に貸し出されるために改装された。イギリス大使ニコラス・ウェストは1513年4月13日にその準備の様子を記している。
月曜日にニューヘイブンに行くと、そこにはリンのキリストの船の荷役を終えたばかりのマーガレット号が停泊していて、多くの男たちがその船で作業していた。ある者は船の主舷に座り、ある者は水面上の船体にコーキングを施していた。水面下では船体は新しく瀝青を塗られていたのだ。[ 7 ]
ジョン・フレミング卿は、マーガレット号の副提督であり、マイケル号の提督であるアラン伯爵に次ぐ地位にあった。艦隊はまずキャリックファーガスを焼き払い、フランスに向かう前にエア沖で待機した。ピットスコッティのロバート・リンゼイは、艦隊の遅延がジェームズ4世のイングランド侵攻を誘発したと信じていた。[ 8 ]マーガレット号は、フランスでの任務を終え、1515年5月26日にオールバニー公爵と共にダンバートンに帰港した。1515年7月、同船はジェームズと共にアードゴワンのジョン・スチュワートの所有となった。9月には2隻の船のために新しいドックが建設された。大砲はギャビン・ジャーダンと大工長ジョン・ドラモンドの指揮の下、荷揚げされ、グラスゴーからエディンバラへ輸送された。[ 9 ]