ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
スキル 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス SKIL 、SNO、SnoA、SnoI、SnoN、SKI 様プロトオンコゲン、SKI 様プロトオンコゲン 外部ID オミム : 165340; MGI : 106203; ホモロジーン : 3948; ジーンカード ：SKIL; OMA :SKIL - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体3（マウス） [2] バンド 3 A3|3 15.12 cM 始める 31,149,207 bp [2] 終わり 31,176,726 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 上腕二頭筋の腱 副鼻腔粘膜 小腸粘膜 アキレス腱 上腕二頭筋の骨格筋組織 臓側胸膜 鼻咽頭上皮 結腸上皮 内皮細胞 浅側頭動脈
トップの表現 臼歯 積雲細胞 外頸動脈 松果体 大動脈領域の中膜 毛様体 大腿骨体 腸間膜リンパ節 内頸動脈 臍帯
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
DNA結合 転写コリプレッサー活性 タンパク質ドメイン特異的結合 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 DNA結合転写抑制活性、RNAポリメラーゼII特異的 タンパク質結合 SMADバインディング クロマチン結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 タンパク質含有複合体結合 細胞成分
細胞質 PML本体 核質 先体小胞 核 タンパク質含有複合体 生物学的プロセス
デスドメイン受容体を介した外因性アポトーシスシグナル伝達経路の正の調節 サイトカインに対する反応 リンパ球の恒常性 抗生物質に対する反応 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 胚盤胞形成 軸索形成の正の調節 タンパク質ホモ三量体化 水晶体線維細胞の分化 DNA損傷に対する内因性アポトーシスシグナル伝達経路の正の調節 精子形成 タンパク質ヘテロ三量体化 成長因子への反応 骨格筋組織の発達 BMPシグナル伝達経路の負の調節 トランスフォーミング成長因子β受容体シグナル伝達経路 トランスフォーミング成長因子β受容体シグナル伝達経路の負の調節 ニューロンの発達 細胞分化の負の調節 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001145097 NM_001145098 NM_001248008 NM_005414
NM_001039090 NM_001271772 NM_011386 NM_001398558 NM_001398559 NM_001398560
RefSeq (タンパク質) NP_001138569 NP_001138570 NP_001234937 NP_005405
NP_001034179 NP_001258701 NP_035516 NP_001385487 NP_001385488 NP_001385489
場所 (UCSC) 3 章: 170.36 – 170.4 Mb 3 章: 31.15 – 31.18 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
スキー様タンパク質 は、ヒトではSKIL 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
インタラクション SKILは SKIタンパク質 と 相互作用し 、 [7] デカペンタプレジックホモログ3に対するマザーズ [8] [9] および デカペンタプレジックホモログ2に対するマザーズ [8] [9] 。
タンパク質ファミリー SKILはSki/Sno/Dacファミリーに属し、 SKIタンパク質 、 Dachshund 、 SKIDA1 によって共有されています。 [10] Ski/Sno/Dacファミリーのメンバーは、およそ100アミノ酸の長さのドメインを共有しています。
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000136603 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000027660 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 野村 暢; 笹本 聡; 石井 聡; 伊達 剛志; 松井 正; 石崎 亮 (1989 年 9 月). 「ski および ski 関連遺伝子 sno のヒト cDNA クローンの単離」. Nucleic Acids Res . 17 (14): 5489–500. doi :10.1093/nar/17.14.5489. PMC 318172. PMID 2762147 . ^ “Entrez Gene: SKIL SKI 様癌遺伝子”. ^ Cohen, SB; Zheng G; Heyman HC; Stavnezer E (1999 年 2 月)。「SnoN および Ski オンコプロテインのヘテロ二量体はホモ二量体よりも優先的に形成され、より強力な形質転換因子である」。Nucleic Acids Res . 27 ( 4 ) 。イギリス: 1006–14。doi :10.1093/nar/27.4.1006。ISSN 0305-1048。PMC 148280。PMID 9927733 。 ^ ab Stroschein, SL; Bonni S; Wrana JL; Luo K (2001 年 11 月). 「Smad3 は SnoN のユビキチン化と分解のために後期促進複合体をリクルートする」. Genes Dev . 15 (21). 米国: 2822–36. doi :10.1101/gad.912901. ISSN 0890-9369. PMC 312804. PMID 11691834 . ^ ab Stroschein, SL; Wang W; Zhou S; Zhou Q; Luo K (1999年10月). 「SnoNオンコプロテインによるTGF-βシグナル伝達の負のフィードバック制御」. Science . 286 (5440). 米国: 771–4. doi :10.1126/science.286.5440.771. ISSN 0036-8075. PMID 10531062. ^ 「保存されたタンパク質ドメインファミリー Ski_Sno」。NCBI 。 2019年 5月5日 閲覧 。
さらに読む
Pearson-White S (1993)。「SnoI、skiプロトオンコゲンホモログsnoの新しい選択的スプライシングアイソフォーム」。Nucleic Acids Res . 21 (19): 4632–8. doi :10.1093/nar/21.19.4632. PMC 311202 . PMID 8233802。 Pearson-White S; Crittenden R (1997). 「プロトオンコジーン Sno の発現、代替アイソフォーム、および即時早期血清反応」。 Nucleic Acids Res . 25 (14): 2930–7. doi :10.1093/nar/25.14.2930. PMC 146803 . PMID 9207045. Cohen SB; Zheng G; Heyman HC; Stavnezer E (1999)。「SnoN および Ski オンコプロテインのヘテロ二量体はホモ二量体よりも優先的に形成され、より強力な形質転換因子である」。Nucleic Acids Res . 27 (4): 1006–14. doi :10.1093/nar/27.4.1006. PMC 148280 . PMID 9927733。 Stroschein SL、Wang W、Zhou S、et al. (1999)。「SnoN オンコプロテインによる TGF-β シグナル伝達の負のフィードバック制御」。Science . 286 ( 5440): 771–4. doi :10.1126/science.286.5440.771. PMID 10531062。 Bonni S、Wang HR、Causing CG、et al. (2001)。「TGF-beta は SnoN を分解の標的とする Smad2-Smurf2 ユビキチンリガーゼ複合体の組み立てを誘導する」。Nat . Cell Biol . 3 (6): 587–95. doi :10.1038/35078562. PMID 11389444. S2CID 23270947. Imoto I, Pimkhaokham A, Fukuda Y, et al. (2001). 「SNO は食道扁平上皮癌における 3q26 の遺伝子増幅の可能性のある標的である」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 286 (3): 559–65. doi :10.1006/bbrc.2001.5428. PMID 11511096。 Stroschein SL; Bonni S; Wrana JL; Luo K (2001). 「Smad3 は SnoN のユビキチン化と分解のために後期促進複合体をリクルートする」。 Genes Dev . 15 (21): 2822–36. doi :10.1101/gad.912901. PMC 312804 . PMID 11691834。 Mizuide M, Hara T, Furuya T, et al. (2003). 「Smad3 の 2 つの短いセグメントは、Smad3 と c-Ski および SnoN との特異的相互作用に重要である」。J . Biol. Chem . 278 (1): 531–6. doi : 10.1074/jbc.C200596200 . PMID 12426322。 Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 Tomsig JL; Snyder SL; Creutz CE (2003). 「コパインファミリータンパク質を介したカルシウムシグナル伝達の標的の特定。コイルドコイルコパイン結合モチーフの特性評価」。J . Biol. Chem . 278 (12): 10048–54. doi : 10.1074/jbc.M212632200 . PMID 12522145。 He J、Tegen SB、Krawitz AR、et al. (2003)。「Ski および SnoN のトランスフォーミング活性は、Smad タンパク質の活性を抑制する能力に依存する」 ( PDF) 。J . Biol. Chem . 278 (33): 30540–7。doi : 10.1074/ jbc.M304016200。PMID 12764135。S2CID 31081406 。 Colland F, Jacq X, Trouplin V, et al. (2004). 「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」 Genome Res . 14 (7): 1324–32. doi :10.1101/gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748 . Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。 Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。 Sarker KP; Wilson SM; Bonni S (2005). 「SnoN は、形質転換成長因子ベータ応答の細胞タイプ特異的メディエーターです」。J . Biol. Chem . 280 (13): 13037–46. doi : 10.1074/jbc.M409367200 . PMID 15677458。 Barrios-Rodiles M、Brown KR、Ozdamar B 、et al. (2005)。「哺乳類細胞における動的シグナル伝達ネットワークのハイスループットマッピング」。Science。307 ( 5715 ) : 1621–5。Bibcode : 2005Sci ...307.1621B。doi : 10.1126 /science.1105776。PMID 15761153。S2CID 39457788 。 Poser I、Rothhammer T、Dooley S、et al. (2005)。「悪性黒色腫におけるSno発現の特徴」。Int . J. Oncol . 26 (5): 1411–7. doi :10.3892/ijo.26.5.1411. PMID 15809735。 Krakowski AR、Laboureau J、Mauviel A、et al. (2005)。「正常組織および非悪性細胞の細胞質SnoNは、Smadタンパク質を隔離することでTGF-βシグナル伝達に拮抗する」。Proc . Natl . Acad. Sci. USA . 102 (35): 12437–42。Bibcode : 2005PNAS..10212437K。doi : 10.1073 / pnas.0504107102。PMC 1194926。PMID 16109768 。 Zhu Q; Pearson-White S; Luo K (2006). 「線維芽細胞の形質転換成長因子β誘導性腫瘍形成におけるSnoN腫瘍タンパク質の必要性」 Mol. Cell. Biol . 25 (24): 10731–44. doi :10.1128/MCB.25.24.10731-10744.2005. PMC 1316959. PMID 16314499 . Briones-Orta MA、Sosa-Garrocho M、Moreno-Alvarez P、et al. (2006)。「SnoN コリプレッサーは smad7 遺伝子プロモーターに結合し、これを抑制する」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 341 (3): 889–94. doi :10.1016/j.bbrc.2006.01.041. PMID 16442497。
