ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
SETD7 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1H3I、1MT6、1MUF、1N6A、1N6C、1O9S、1XQH、2F69、3CBM、3CBO、3CBP、3M53、3M54、3M55、3M56、3M57、3M58、3M59、3M5A、3OS5、 3VUZ、3VV0、4E47、4J7F、4J8O、4JDS、4JLG、5EG2、5AYF
識別子 エイリアス SETD7 、KMT7、SET7、SET7/9、SET9、リジンメチルトランスフェラーゼ7を含むSETドメイン、7を含むSETドメイン、ヒストンリジンメチルトランスフェラーゼ 外部ID オミム ：606594; MGI : 1920501; ホモロジーン : 12741; ジーンカード ：SETD7; OMA :SETD7 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体3（マウス） [2] バンド 3|3 Ｃ 始める 51,422,740 bp [2] 終わり 51,468,300 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 前脛骨筋 三角筋 右心房の心筋組織 左心室の心筋 腕の皮膚 大腿四頭筋 腹直筋の骨格筋組織 上腕二頭筋 外側広筋 上腕二頭筋の骨格筋組織
トップの表現 上腕三頭筋 側頭筋 胸鎖乳突筋 毛様体 二腹筋 小脳葉 小脳虫部 足首 外側膝状体 水晶体上皮
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
メチルトランスフェラーゼ活性 トランスフェラーゼ活性 p53結合 クロマチン結合 タンパク質リジンN-メチルトランスフェラーゼ活性 タンパク質結合 ヒストンリジンNメチルトランスフェラーゼ活性 細胞成分 生物学的プロセス
転写の調節、DNAテンプレート ペプチジルリジンモノメチル化 転写、DNAテンプレート DNA損傷刺激に対する細胞反応 転写の正の制御、DNAテンプレート ペプチジルリジンメチル化 メチル化 ヘテロクロマチン組織 ペプチジルリジンジメチル化 ヒストンリジンメチル化 エタノールに対する反応 ヒストンH3-K9メチル化の調節 クロマチン組織 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001306199 NM_001306200 NM_030648
RefSeq (タンパク質) NP_001293128 NP_001293129 NP_085151
場所 (UCSC) 4 章: 139.5 – 139.61 Mb 3 章: 51.42 – 51.47 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
ヒストンリジンN-メチルトランスフェラーゼSETD7 は、ヒトでは SETD7 遺伝子によってコードされる 酵素 である 。 [5] [6] [7]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000145391 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000037111 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Nishioka K, Chuikov S, Sarma K, Erdjument-Bromage H, Allis CD, Tempst P, Reinberg D (2002 年 2 月)。「Set9 はヘテロクロマチン形成に必要なヒストンテールの修飾を排除することで転写を促進する新規ヒストン H3 メチルトランスフェラーゼです」。Genes Dev . 16 (4): 479–89. doi :10.1101/gad.967202. PMC 155346. PMID 11850410 。 ^ Wang H, Cao R, Xia L, Erdjument-Bromage H, Borchers C, Tempst P, Zhang Y (2002年1月). 「ヒストンH3-リジン4特異的メチルトランスフェラーゼの精製と機能特性」. Mol Cell . 8 (6): 1207–17. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00405-1 . PMID 11779497. S2CID 37879139. ^ 「SETD7 SETドメイン7を含む、ヒストンリジンメチルトランスフェラーゼ[ホモサピエンス（ヒト）]」。
さらに読む
Nagase T, Kikuno R, Hattori A, et al. (2001). 「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XIX. 試験管内で大きなタンパク質をコードする脳由来の100個の新しいcDNAクローンの完全な配列」。DNA Res . 7 (6): 347–55. doi : 10.1093/dnares/7.6.347 . PMID 11214970。 Wilson JR、Jing C、Walker PA、他 (2002)。「ヒストンメチルトランスフェラーゼ SET7/9 の結晶構造と機能解析」。Cell . 111 (1): 105–15. doi : 10.1016/S0092-8674 ( 02)00964-9 . PMID 12372304. S2CID 14727763. Jacobs SA、Harp JM、Devarakonda S、et al. (2002)。「SET ドメインの活性部位は結び目上に構築される」。Nat . Struct. Biol . 9 (11): 833–8. doi :10.1038/nsb861. PMID 12389038. S2CID 28718612。 Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 Kwon T、Chang JH、Kwak E、et al. (2003)。「SET7/9-AdoMetの構造から明らかになったヒストンリジンメチル転移のメカニズム」。EMBO J. 22 ( 2): 292–303. doi : 10.1093/emboj/cdg025. PMC 140100. PMID 12514135. Xiao B、 Jing C、 Wilson JR、他 (2003)。「ヒトヒストンメチルトランスフェラーゼ SET7/9 の構造と触媒機構」 ( PDF) 。Nature。421 ( 6923 ) : 652–6。Bibcode :2003Natur.421..652X。doi :10.1038/nature01378。PMID 12540855。S2CID 4423407。 Wysocka J、Myers MP、Laherty CD、et al. (2003)。「ヒトSin3デアセチラーゼとトリソラックス関連Set1/Ash2ヒストンH3-K4メチルトランスフェラーゼは、細胞増殖因子HCF-1によって選択的に結合される」。Genes Dev . 17 (7): 896–911. doi :10.1101/gad.252103. PMC 196026 . PMID 12670868。 Kouskouti A, Scheer E, Staub A, et al. (2004). 「SET9 を介したメチル化による TAF10 機能の遺伝子特異的調節」 Mol. Cell . 14 (2): 175–82. CiteSeerX 10.1.1.320.8454 . doi :10.1016/S1097-2765(04)00182-0. PMID 15099517. Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。 Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。 Chuikov S 、 Kurash JK、 Wilson JR 、他 (2004)。「リジンメチル化によるp53活性の調節」。Nature 432 ( 7015 ): 353–60。Bibcode :2004Natur.432..353C。doi :10.1038/nature03117。PMID 15525938。S2CID 4398310。 Couture JF、Collazo E、Hauk G、Trievel RC (2006)。「SET7/9のメチル化部位特異性の構造的基礎」。Nat . Struct. Mol. Biol . 13 (2): 140–6. doi :10.1038/nsmb1045. PMID 16415881. S2CID 38483056. 早川 孝文、大谷 勇、早川 暢文、他 (2007)。「RBP2 は MRG15 複合体の構成要素であり、遺伝子内ヒストン H3 リジン 4 のメチル化をダウンレギュレートする」。 遺伝子細胞。12 ( 6 ) : 811–26。doi : 10.1111/ j.1365-2443.2007.01089.x。PMID 17573780。S2CID 10003129 。
