ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
SETD6 利用可能な構造 電子データ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス SETD6 、SETドメイン6を含む、SETドメイン6を含む、タンパク質リジンメチルトランスフェラーゼ 外部ID オミム ：616424; MGI : 1913333; ホモロジーン : 38743; ジーンカード ：SETD6; OMA :SETD6 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体8（マウス） [2] バンド 8|8 D1 始める 95,715,881 bp [2] 終わり 95,719,010 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 二次卵母細胞 膵臓の体 小脳の右半球 上腕二頭筋の腱 右子宮管 甲状腺の右葉 甲状腺の左葉 小脳虫部 下垂体 下垂体前葉
トップの表現 耳板 上行大動脈 球形嚢 大動脈弁 耳小胞 外頸動脈 内頸動脈 近位尿細管 受精卵 卵黄嚢
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
メチルトランスフェラーゼ活性 トランスフェラーゼ活性 タンパク質結合 NF-κB結合 タンパク質リジンN-メチルトランスフェラーゼ活性 細胞成分 生物学的プロセス
幹細胞集団の維持 ヒストンリジンメチル化 メチル化 NF-κB転写因子活性の負の制御 ペプチジルリジンモノメチル化 幹細胞の分化 炎症反応の調節 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) RefSeq (タンパク質) NP_001030295 NP_001355283
場所 (UCSC) 16 章: 58.52 – 58.52 Mb 8 章: 95.72 – 95.72 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
SETドメイン6は 、ヒトではSETD6 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5]
SETD6は核因子κB（NF-κB）のRelAサブユニットをモノメチル化する。リジン310でのRelAモノメチル化（RelAK310me1）はPKMT G9a様タンパク質（GLP）をリクルートすることでRelA標的遺伝子の恒常的抑制をもたらし、H3K9me2を触媒してクロマチンサイレンシングと遺伝子抑制をもたらす。TNFaとリポ多糖による刺激に反応して、PKCzetaによるセリン311でのRelAのリン酸化（RelAS311ph）はGLPとRelAK310me1の相互作用を物理的にブロックし、転写活性化をもたらす。 [6]
SETD6によるPAK4のメチル化はWnt/β-カテニン経路の活性化を促進する。SETD6は、in vitroおよび細胞内のクロマチンの両方でPAK4に結合し、メチル化する。様々な細胞株におけるSETD6の枯渇は、Wnt/β-カテニン標的遺伝子の発現の劇的な減少につながる。 [7]
SETD6はDJ1に結合するがメチル化はしない。基底状態では、SETD6とDJ1はクロマチンと結合し、DJ1を阻害してNrf2の転写活性を活性化する。酸化ストレスに反応して、SETD6 mRNAとタンパク質のレベルは劇的に減少する。 [8]
SETD6は有糸分裂中にK209とK413でPLK1に特異的に結合しメチル化する。SETD6の枯渇とリジン残基の二重置換（K209/413R）はPLK1の触媒活性の上昇につながり、さまざまな有糸分裂段階の加速につながり、早期の細胞質分裂で終わる。 [9]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000103037 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031671 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「Entrez Gene: SETドメインを含む6」。2010年12月5日時点のオリジナルよりアーカイブ 。 2017年11月1日 閲覧。 ^ Levy D、Kuo AJ、Chang Y、Schaefer U、Kitson C、Cheung P、Espejo A、Zee BM、Liu CL、Tangsombatvisit S、Tennen RI、Kuo AY、Tanjing S、Cheung R、Chua KF、Utz PJ、Shi X、プリンジャ RK、リー K、ガルシア BA、ベッドフォード MT、タラホフスキー A、チェン X、ゴザニ O （2011年1月）。 「SETD6によるNF-κBサブユニットRelAのリジンメチル化は、クロマチンでのヒストンメチルトランスフェラーゼGLPの活性とNF-κBシグナル伝達の持続性抑制を結びつける。」 自然免疫学 。 12 (1): 29–36。 土井 ：10.1038/ni.1968。 PMC 3074206 。 PMID 21131967。 ^ Vershinin Z、Feldman M、Chen A、Levy D (2016 年 3 月)。「SETD6 による PAK4 メチル化は Wnt/β-カテニン経路の活性化を促進する」。The Journal of Biological Chemistry。291 ( 13): 6786–95。doi : 10.1074 / jbc.M115.697292。PMC 4807267。PMID 26841865 。 ^ Chen A、Feldman M、Vershinin Z、 Levy D (2016 年 2 月)。「SETD6 は酸化ストレス応答の負の調節因子です」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - 遺伝子調節メカニズム 。1859 (2): 420–7。doi : 10.1016 /j.bbagrm.2016.01.003。PMID 26780326 。 ^ Feldman M, Vershinin Z, Goliand I, Elia N, Levy D (2019年1月). 「メチルトランスフェラーゼSETD6はPLK1メチル化を介して有糸分裂の進行を制御する」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。116 ( 4 ):1235–1240。Bibcode :2019PNAS..116.1235F。doi : 10.1073/ pnas.1804407116。PMC 6347700。PMID 30622182 。
さらに読む
Weil LE、Shmidov Y、Kublanovsky M、 Morgenstern D、Feldman M、Bitton R、Levy D (2018 年 10 月)。「ヒトリジンメチルトランスフェラーゼ SETD6 のオリゴマー化と自動メチル化」。Journal of Molecular Biology。430 ( 21): 4359–4368。doi :10.1016/ j.jmb.2018.08.028。PMID 30189201。S2CID 52167348 。 Kublanovsky M、Aharoni A、Levy D (2018 年 7 月)。「非活性部位相互作用による PKMT 基質認識の強化」。 生化学 および生物物理学的研究通信 。501 (4): 1029–1033。doi : 10.1016 /j.bbrc.2018.05.103。PMID 29778536。S2CID 205956659。 Feldman M、 Levy D (2018 年 1 月)。 「 SETD6 メチル トランスフェラーゼの触媒活性のペプチド阻害」 。Oncotarget。9 ( 4): 4875–4885。doi : 10.18632 /oncotarget.23591。PMC 5797019。PMID 29435148 。 マルティン＝モラレス L、フェルドマン M、ヴェルシニン Z、ガレ P、カルデス T、レヴィ D (2017 年 11 月)。 「家族性結腸直腸癌 X 型における SETD6 ドミナントネガティブ変異」。 ヒト分子遺伝学 。 26 (22): 4481–4493。 土井 : 10.1093/hmg/ddx336 。 PMID 28973356。 Chang Y、Levy D、Horton JR、Peng J、Zhang X、Gozani O、Cheng X (2011 年 8 月)。「メチルリジンシグナル伝達を介した SETD6 による NF-kB ネットワークの制御の構造的基礎」。 核酸 研究 。39 ( 15 ): 6380–9。doi :10.1093 / nar/gkr256。PMC 3159447。PMID 21515635 。 Levy D、Liu CL、Yang Z、Newman AM、Alizadeh AA、Utz PJ、Gozani O (2011 年 10 月)。「新規リジンメチルトランスフェラーゼ基質の同定のためのプロテオミクスアプローチ」。 エピ ジェネ ティクス & クロマチン 。4 :19。doi : 10.1186 / 1756-8935-4-19。PMC 3212905。PMID 22024134 。
