ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| セマ4F |
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| 識別子 |
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| エイリアス | SEMA4F、M-SEMA、PRO2353、S4F、SEMAM、SEMAW、m-Sema-M、セマフォリン 4F |
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| 外部ID | オミム:603706; MGI : 1340055;ホモロジーン: 3147;ジーンカード:SEMA4F; OMA :SEMA4F - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体6(マウス)[2] |
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| | バンド | 6 C3|6 35.94 cM | 始める | 82,888,866 bp [2] |
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| 終わり | 82,916,750 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 内皮細胞
- 中側頭回
- 前頭前皮質
- 生殖腺
- 睾丸
- 上前頭回
- 腓骨神経
- 右前頭葉
- 中心後回
- ブロードマン領域23
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| | トップの表現 | - 三叉神経節
- 黒質
- 腹内側核
- 腰椎神経節
- 嗅周囲皮質
- 嗅内皮質
- 顆頭
- CA3フィールド
- 一次運動野
- 弓状核
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ニューロピリン結合
- セマフォリン受容体結合
- 化学忌避活性
| | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- シナプス後膜
- 膜
- 細胞膜
- シナプス
- 細胞膜の不可欠な構成要素
- 小胞体
- 細胞外空間
- シナプス後密度
- 細胞接合
- 樹状突起
- 細胞投影
- 核周細胞
| | 生物学的プロセス |
- 細胞分化
- 細胞間シグナル伝達
- 神経系の発達
- 軸索誘導
- 多細胞生物の発達
- 軸索伸展の負の調節
- 網膜神経節細胞の軸索誘導
- 負の走化性
- 神経堤細胞の移動
- 細胞移動の正の調節
- 軸索誘導に関与する軸索伸長の負の調節
- セマフォリン-プレキシンシグナル伝達経路
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001271661 NM_001271662 NM_004263 |
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NM_001113481 NM_011350 NM_001308374 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001258590 NP_001258591 NP_004254 |
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| 場所 (UCSC) | 2 章: 74.65 – 74.68 Mb | 6 章: 82.89 – 82.92 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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セマフォリン4Fは、ヒトではSEMA4F遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000135622 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000000627 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Encinas JA、Kikuchi K、Chedotal A、de Castro F、Goodman CS、Kimura T (1999 年 3 月)。「セマフォリンファミリーのメンバーである Sema W のクローニング、発現、および遺伝子マッピング」。米国科学 アカデミー紀要。96 (5): 2491–6。Bibcode : 1999PNAS ... 96.2491E。doi : 10.1073/ pnas.96.5.2491。PMC 26812。PMID 10051670。
- ^ 「Entrez Gene: SEMA4F セマドメイン、免疫グロブリンドメイン (Ig)、膜貫通ドメイン (TM)、短い細胞質ドメイン (セマフォリン) 4F」。
さらに読む
- Giger RJ、Urquhart ER、Gillespie SK、Levengood DV、Ginty DD、Kolodkin AL (1998 年 11 月)。「ニューロピリン 2 はセマフォリン IV の受容体である: 受容体の機能と特異性の構造的基礎に関する洞察」。ニューロン。21 ( 5 ): 1079–92。doi : 10.1016/S0896-6273(00)80625- X。PMID 9856463 。
- Hartley JL、Temple GF、 Brasch MA (2000 年 11 月)。「in vitro部位特異的組み換えを用いた DNA クローニング」。ゲノム研究。10 ( 11): 1788–95。doi :10.1101/gr.143000。PMC 310948。PMID 11076863。
- ヴィーマン S、ヴァイル B、ヴェレンロイター R、ガッセンフーバー J、グラスル S、アンゾルゲ W、ベッヒャー M、ブロッカー H、バウアーザックス S、ブルーム H、ラウバー J、デュスターヘフト A、バイエル A、ケーラー K、ストラック N、メーヴェス HW、オッテンヴェルダー B 、オーバーマイヤー B、タンペ J、ホイブナー D、ワンブット R、コーン B、クライン M、プストカ A (2001 年 3 月)。 「ヒトの遺伝子とタンパク質のカタログを目指して: ヒト cDNA をコードする 500 個の新規完全タンパク質の配列決定と分析」。ゲノム研究。11 (3): 422-35。土井:10.1101/gr.GR1547R。PMC 311072。PMID 11230166。
- Simpson JC、Wellenreuther R、 Poustka A、Pepperkok R 、 Wiemann S (2000 年 9 月)。「大規模 cDNA シーケンシングによって同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」。EMBO レポート。1 ( 3 ): 287–92。doi :10.1093/embo-reports/kvd058。PMC 1083732。PMID 11256614。
- Schultze W、Eulenburg V、Lessmann V、Herrmann L、Dittmar T、Gundelfinger ED、Heumann R、Erdmann KS (2001 年 8 月)。「Semaphorin4F はシナプス関連タンパク質 SAP90/PSD-95 と相互作用する」。Journal of Neurochemistry . 78 (3): 482–9. doi : 10.1046/j.1471-4159.2001.00447.x . PMID 11483650。
- Francks C、Fisher SE、Olson RK、Pennington BF、Smith SD、DeFries JC、Monaco AP (2002 年 3 月)。「染色体 2p12-16 失読症感受性遺伝子座の詳細なマッピング: 定量的関連分析と位置候補遺伝子 SEMA4F および OTX1」。精神遺伝学。12 (1 ) : 35–41。doi :10.1097/00041444-200203000-00005。hdl : 11858 /00-001M-0000-0012- C9C5-5。PMID 11901358。S2CID 15050388 。
- Wiemann S、Arlt D、Huber W、Wellenreuther R、Schleeger S、Mehrle A、Bechtel S、Sauermann M、Korf U、Pepperkok R、Sültmann H、Poustka A (2004 年 10 月)。 「ORFeome から生物学へ: 機能的ゲノミクス パイプライン」。ゲノム研究。14 (10B): 2136–44。土井:10.1101/gr.2576704。PMC 528930。PMID 15489336。
- 大月 哲、太田 哲、西川 哲、林 和、鈴木 裕、山本 丈、若松 亜、木村 和、坂本 和、波多野 直、河合 裕、石井 俊、斉藤 和、小島 俊、杉山 達、小野 達也、岡野 和、吉川 裕、青塚 S、佐々木 N、服部 A、奥村 K、永井 K、菅野 S、磯貝 T (2007)。 「オリゴキャップされたcDNAライブラリーからの分泌タンパク質または膜タンパク質をコードする完全長ヒトcDNAの選択のためのシグナル配列およびキーワードトラップのインシリコ」。DNA 研究。12 (2): 117-26。土井:10.1093/dnares/12.2.117。PMID 16303743。
- Mehrle A、Rosenfelder H、Schupp I、del Val C、Arlt D、Hahne F、Bechtel S、Simpson J、Hofmann O、Hide W、Glatting KH、Huber W、Pepperkok R、Poustka A、Wiemann S (2006 年 1 月)。「2006 年の LIFEdb データベース」。核酸研究。34 (データベース 号): D415-8。doi :10.1093/nar/gkj139。PMC 1347501。PMID 16381901。