ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| セマ4B |
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| 識別子 |
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| エイリアス | SEMA4B、SEMAC、SemC、セマフォリン4B |
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| 外部ID | オミム:617029; MGI : 107559;ホモロジーン: 8426;ジーンカード:SEMA4B; OMA :SEMA4B - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体7(マウス)[2] |
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| | バンド | 7|7 D2 | 始める | 79,836,589 bp [2] |
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| 終わり | 79,876,275 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 回腸粘膜
- 食道粘膜
- 二次卵母細胞
- S状結腸の筋層
- 鼻粘膜の嗅覚領域
- 歯茎
- 膣
- 横行結腸
- 歯肉上皮
- 甲状腺の右葉
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| | トップの表現 | - 積雲細胞
- 外頸動脈
- 顎下腺
- 毛様体
- 内頸動脈
- 腰椎神経節
- リップ
- 吻側回遊流
- 卵黄嚢
- 血
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ニューロピリン結合
- セマフォリン受容体結合
- 化学忌避活性
| | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- 膜
- 細胞外空間
- 細胞膜
- 細胞膜の不可欠な構成要素
| | 生物学的プロセス |
- 多細胞生物の発達
- 細胞分化
- 神経系の発達
- 負の走化性
- 神経堤細胞の移動
- 細胞移動の正の調節
- 軸索誘導に関与する軸索伸長の負の調節
- セマフォリン-プレキシンシグナル伝達経路
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_020210 NM_198925 NM_001324029 NM_001324030 NM_001324031
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NM_001324032 NM_001324034 NM_001393916 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001310958 NP_001310959 NP_001310960 NP_001310961 NP_001310962
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NP_001310963 NP_064595 NP_945119 |
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| 場所 (UCSC) | 15 章: 90.16 – 90.23 Mb | 7 章: 79.84 – 79.88 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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セマフォリン4Bは、ヒトではSEMA4B遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000185033 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000030539 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Puschel AW、Adams RH、Betz H (1995 年 6 月)。「マウスのセマフォリン D/コラプシンは多様な遺伝子ファミリーのメンバーであり、軸索伸展を阻害するドメインを作成します」。ニューロン。14 ( 5 ): 941–8。doi : 10.1016 /0896-6273(95)90332-1。PMID 7748561 。
- ^ 「Entrez Gene: SEMA4B セマドメイン、免疫グロブリンドメイン (Ig)、膜貫通ドメイン (TM)、短い細胞質ドメイン (セマフォリン) 4B」。
さらに読む
- Nagase T, Kikuno R, Hattori A, et al. (2001). 「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XIX. 試験管内で大きなタンパク質をコードする脳由来の100個の新しいcDNAクローンの完全な配列」。DNA Res . 7 (6): 347–55. doi : 10.1093/dnares/7.6.347 . PMID 11214970。
- Swiercz JM、Kuner R、Behrens J 、 Offermanns S (2002)。「Plexin-B1 は PDZ-RhoGEF/LARG と直接相互作用して RhoA と成長円錐の形態を制御する」。Neuron。35 ( 1 ): 51–63。doi : 10.1016 /S0896-6273(02)00750- X。PMID 12123608 。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Clark HF、Gurney AL、Abaya E、他 (2003)。「分泌タンパク質発見イニシアチブ (SPDI)、新規ヒト分泌タンパク質および膜貫通タンパク質を同定するための大規模な取り組み: バイオインフォマティクス評価」。Genome Res . 13 (10): 2265–70. doi :10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309 。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Zhang Z、Henzel WJ (2005)。「実験的に検証された切断部位の分析に基づくシグナルペプチド予測」。Protein Sci . 13 (10): 2819–24. doi :10.1110/ps.04682504. PMC 2286551. PMID 15340161 。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Liu T、Qian WJ、Gritsenko MA、他 (2006)。「免疫親和性サブトラクション、ヒドラジド化学、質量分析によるヒト血漿 N-グリコプロテオーム分析」。J . Proteome Res . 4 (6): 2070–80. doi :10.1021/pr0502065. PMC 1850943. PMID 16335952 .
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、et al. (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983。