SEC61B

SEC61B
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	2WWB、4CG6
識別子
エイリアス	SEC61B、Sec61トランスロコンβサブユニット、SEC61トランスロコンサブユニットβ
外部ID	オミム：609214; MGI : 1913462;ホモロジーン: 38229;ジーンカード：SEC61B; OMA :SEC61B - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	9番染色体（ヒト）
終わり	99,230,615 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体4（マウス）
終わり	47,483,242 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	耳下腺; ; 膵臓の体; ; 卵母細胞; ; 精巣上体; ; 幽門; ; 下垂体前葉; ; 気管; ; 鼻粘膜の嗅覚領域; ; ベータ細胞; ; 肝臓の右葉;
	トップの表現
	耳下腺; ; 精嚢; ; 顎下腺; ; 原腸胚; ; ランゲルハンス島; ; 下顎突出; ; 臼歯; ; 上顎突出; ; 体節; ; 涙腺;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	表皮成長因子結合; タンパク質結合; RNA結合; タンパク質輸送ATPase活性;
細胞成分	膜の不可欠な構成要素; 細胞質; 膜; Sec61トランスロコン複合体; 小胞体; 小胞体膜; 小胞体 Sec 複合体;
生物学的プロセス	逆行性タンパク質輸送、ERからサイトゾルへ; IRE1を介した未折り畳みタンパク質応答; ユビキチン依存性ERAD経路; タンパク質輸送; 細胞内タンパク質輸送; SRP依存性共翻訳タンパク質の膜への標的化、転座; 翻訳後タンパク質の膜への標的化、転座; 輸送; 分子機能の調節;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	10952
	66212
	ENSG00000106803
	ENSMUSG00000053317
	P60468
	翻訳:
	NM_006808
	NM_024171
	NP_006799
	NP_077133
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

タンパク質輸送タンパク質Sec61サブユニットベータは、ヒトではSEC61B遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]^[7]

Sec61 複合体は、小胞体(ER) 膜のタンパク質転座装置の中心的な構成要素です。Sec61 複合体は、タンパク質が ER 膜を横切って転座し、ER 膜に統合される膜貫通チャネルを形成します。この複合体は、アルファ、ベータ、ガンマの 3 つの膜タンパク質で構成されています。この遺伝子は、ベータサブユニットタンパク質をコードします。Sec61 サブユニットは、ER 後区画でも観察されており、これらのタンパク質が ER から脱出してリサイクルできることを示唆しています。この転写産物には、複数のポリアデニル化部位があるという証拠があります。^[7]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000106803 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000053317 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Hartmann E, Sommer T, Prehn S, Gorlich D, Jentsch S, Rapoport TA (1994 年 3 月). 「タンパク質転座複合体の構成要素の進化的保全」. Nature . 367 (6464): 654–7. Bibcode :1994Natur.367..654H. doi :10.1038/367654a0. PMID 8107851. S2CID 4323463.
^ Greenfield JJ、High S（1999年8月）。「Sec61複合体はERとER-ゴルジ中間体の両方に位置する」。J Cell Sci . 112（10）：1477–86。doi ： 10.1242 /jcs.112.10.1477。PMID 10212142 。
^ ab "Entrez Gene: SEC61B Sec61 ベータサブユニット".

さらに読む

Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Wiertz EJ、Tortorella D、 Bogyo M、他 (1997)。「Sec61 を介した膜タンパク質の小胞体からプロテアソームへの移動と破壊」。Nature。384 ( 6608 ) : 432–8。doi :10.1038/384432a0。PMID 8945469。S2CID 6276718 。
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). 「全長濃縮および5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Knight BC, High S (1998). 「Sec61alpha の膜統合: 小胞体転座複合体のコア成分」. Biochem. J. 331 ( Pt 1): 161–7. doi :10.1042/bj3310161. PMC 1219334. PMID 9512475 .
Chen Y、Le Cahérec F、Chuck SL (1998)。「カルネキシンと転座を変化させる他の因子は、Sec61 複合体におけるユビキチンとアポ B の急速な結合に影響を与える」。J . Biol. Chem . 273 (19): 11887–94. doi : 10.1074/jbc.273.19.11887 . PMID 9565615。
Kalies KU、Rapoport TA、Hartmann E (1998)。「Sec61 複合体の β サブユニットは共翻訳タンパク質輸送を促進し、転座中にシグナルペプチダーゼと相互作用する」。J . Cell Biol . 141 (4): 887–94. doi :10.1083/jcb.141.4.887. PMC 2132780. PMID 9585408 。
Bebök Z、Mazzochi C、King SA、他 (1998)。「小胞体からプロテアソームへの嚢胞性線維症膜コンダクタンス制御因子輸送の基礎となるメカニズムには、Sec61beta と細胞質の脱グリコシル化媒介物が含まれる」。J . Biol. Chem . 273 (45): 29873–8. doi : 10.1074/jbc.273.45.29873 . PMID 9792704。
Ingley E、Williams JH、Walker CE、他 (1999)。「新規 ADP リボシル化様因子 (ARL-6) は、タンパク質伝導チャネル SEC61beta サブユニットと相互作用する」。FEBS Lett . 459 (1): 69–74. doi :10.1016/S0014-5793(99)01188-6. PMID 10508919. S2CID 30948975.
Yamaguchi A, Hori O, Stern DM, et al. (2000). 「ストレス関連小胞体タンパク質 1 (Serp1)/リボソーム関連膜タンパク質 4 (Ramp4) はストレス時に膜タンパク質を安定化し、その後のグリコシル化を促進する」J. Cell Biol . 147 (6): 1195–204. doi :10.1083/jcb.147.6.1195. PMC 2168098. PMID 10601334 .
Meyer HA, Grau H, Kraft R, et al. (2000). 「哺乳類の Sec61 は Sec62 および Sec63 と関連している」J. Biol. Chem . 275 (19): 14550–7. doi : 10.1074/jbc.275.19.14550 . PMID 10799540.
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
Humphray SJ 、Oliver K、Hunt AR、他 (2004)。「ヒト染色体9のDNA配列と分析」。Nature 429 ( 6990 ) : 369–74。Bibcode : 2004Natur.429..369H。doi : 10.1038/nature02465。PMC 2734081。PMID 15164053。
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
Besemer J、 Harant H、Wang S、et al. (2005)。「血管細胞接着分子 1 の共翻訳転座の選択的阻害」。Nature . 436 ( 7048 ) : 290–3。Bibcode :2005Natur.436..290B。doi : 10.1038/nature03670。PMID 16015337。S2CID 4431610。
Kim JE、Tannenbaum SR、White FM (2005)。「HT-29ヒト結腸腺癌細胞のグローバルホスホプロテオーム」。J . Proteome Res . 4 (4): 1339–46. doi :10.1021/pr050048h. PMID 16083285。
Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、et al. (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。
Liao HJ、Carpenter G (2007)。「Sec61トランスロコンのEGF受容体の核への輸送と遺伝子発現における役割」。Mol . Biol. Cell . 18 (3): 1064–72. doi :10.1091/mbc.E06-09-0802. PMC 1805100. PMID 17215517 。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000106803 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000053317 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid8107851-5] Hartmann E, Sommer T, Prehn S, Gorlich D, Jentsch S, Rapoport TA (1994 年 3 月). 「タンパク質転座複合体の構成要素の進化的保全」. Nature . 367 (6464): 654–7. Bibcode :1994Natur.367..654H. doi :10.1038/367654a0. PMID 8107851. S2CID 4323463.

[pmid10212142-6] Greenfield JJ、High S（1999年8月）。「Sec61複合体はERとER-ゴルジ中間体の両方に位置する」。J Cell Sci . 112（10）：1477–86。doi ： 10.1242 /jcs.112.10.1477。PMID 10212142 。

[entrez-7] "Entrez Gene: SEC61B Sec61 ベータサブユニット".