タンパク質
SCP2 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス SCP2 、NLTP、NSL-TP、SCP-2、SCP-CHI、SCP-X、SCPX、ステロールキャリアタンパク質2、SCOX 外部ID オミム : 184755; MGI : 98254; ホモロジーン : 37717; ジーンカード ：SCP2; OMA :SCP2 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体4（マウス） [2] バンド 4 C7|4 50.2 cM 始める 107,901,036 bp [2] 終わり 108,002,195 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 小腸粘膜 肝臓の右葉 眼瞼結膜 胚上皮 十二指腸 直腸 鼻咽頭上皮 S状結腸粘膜 胆嚢 幽門
トップの表現 近位尿細管 右腎臓 白色脂肪組織 肝胆道系 肝臓 小腸 顆粒球 十二指腸 人間の腎臓 結腸
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
トランスフェラーゼ活性 ホスファチジルイノシトール転移活性 脂肪酸アシルCoA結合 アシルトランスフェラーゼ活性、アミノアシル基以外の基を転移する ステロールトランスポーター活性 オレイン酸結合 長鎖脂肪酸アシルCoA結合 コレステロール結合 タンパク質結合 プロパノイルCoA C-アシルトランスフェラーゼ活性 触媒活性 シグナル伝達受容体結合 アシルトランスフェラーゼ活性 脂質結合 プロピオニルCoA C2-トリメチルトリデカノイルトランスフェラーゼ活性 細胞成分
膜 細胞内膜小器官 ペルオキシソーム 核質 ペルオキシソームマトリックス ミトコンドリア 細胞外エクソソーム 細胞質 細胞質 タンパク質含有複合体 生物学的プロセス
プロゲステロンの生合成プロセス ペルオキシソーム組織 脂質輸送 イノシトール三リン酸の生合成過程 α-リノレン酸の代謝プロセス ステロイド代謝過程の正の調節 脂質ヒドロペルオキシド輸送 細胞内コレステロール輸送の正の調節 アシルCoAオキシダーゼを用いた脂肪酸のβ酸化 代謝 タンパク質の細胞膜への局在 胆汁酸の生合成プロセス ステロール輸送 ステロイド生合成プロセス リン脂質輸送 輸送 ペルオキシソームへのタンパク質標的化 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001007098 NM_001007099 NM_001007100 NM_001007250 NM_001193599 NM_001193600 NM_001193617 NM_002979 NM_001330587
RefSeq (タンパク質) NP_001007099 NP_001007100 NP_001007101 NP_001007251 NP_001180528 NP_001180529 NP_001180546 NP_001317516 NP_002970
場所 (UCSC) 1 章: 52.93 – 53.05 Mb 4 番: 107.9 – 108 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
非特異的脂質転移タンパク質は、 ステロールキャリアタンパク質2 （SCP-2）または プロパノイルCoA C-アシルトランスフェラーゼ としても知られ 、ヒトでは SCP2 遺伝子によってコードされる タンパク質 です 。 [5] [6]
関数 この遺伝子は、2 つの独立して制御されるプロモーターからの転写開始の結果として、ステロール キャリア タンパク質 X (SCPx) とステロール キャリア タンパク質 2 (SCP2) の 2 つのタンパク質をコードします。近位プロモーターから開始された転写は長い SCPx タンパク質をコードし、遠位プロモーターから開始された転写は短い SCP2 タンパク質をコードします。2 つのタンパク質は共通の C 末端 を共有しています。証拠から、SCPx タンパク質は 分岐鎖脂肪酸 の酸化に関与する ペルオキシソーム 関連 チオラーゼ であることが示唆されています。一方、SCP2 タンパク質は細胞内脂質転送タンパク質であると考えられています。この遺伝子の選択的スプライシングにより、複数の転写バリアントが生成され、いくつかは異なるアイソフォームをコードします。すべての転写バリアントの完全長の性質は決定されていません。 [7]
臨床的意義 この遺伝子は脂質代謝に関わる臓器で高発現しており、 細胞がペルオキシソームを欠乏し 胆汁酸の合成が障害される ゼルウェガー症候群 に関与している可能性がある。 [7]
インタラクション SCP2はカベオリン1 [8] およびペルオキシソーム受容体 PEX5 [9] と 相互作用する ことが示されている 。
参考文献
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さらに読む
Seedorf U、Ellinghaus P、Roch Nofer J (2000)。「ステロールキャリアタンパク質-2」。Biochim . Biophys. Acta . 1486 (1): 45–54. doi :10.1016/s1388-1981(00)00047-0. PMID 10856712。 Gallegos AM、Atshaves BP、Storey SM、他 (2001)。「ステロールキャリアタンパク質-2の遺伝子構造、細胞内局在、および機能的役割」。Prog . Lipid Res . 40 (6): 498–563. doi :10.1016/S0163-7827(01)00015-7. PMID 11591437。 山本 亮（1993）「ヒトステロールキャリアタンパク質2遺伝子のCOS-7細胞における局在とcDNA発現」 北海道 医学雑誌 67 （ 6）：839-48。PMID 1483685。 Baker ME、Billheimer JT、Strauss JF (1992)。「哺乳類 58 kD ステロール キャリア タンパク質 (SCPx) のアミノ末端部分と大腸菌アセチル CoA アシルトランスフェラーゼの類似性: SCPx における遺伝子融合の証拠」。DNA Cell Biol . 10 (9): 695–8. doi :10.1089/dna.1991.10.695. PMID 1755959。 Schroeder F, Butko P, Nemecz G, Scallen TJ (1990). 「蛍光デルタ5,7,9(11),22-エルゴスタトラン-3 ベータ-オールとステロールキャリアタンパク質-2との相互作用」 J. Biol. Chem . 265 (1): 151–7. doi : 10.1016/S0021-9258(19)40208-1 . PMID 2294101. Ohba T、Holt JA、Billheimer JT、Strauss JF (1995)。「ヒトステロールキャリアタンパク質x/ステロールキャリアタンパク質2遺伝子には2つのプロモーターがある」。 生化学 。34 ( 33 ) : 10660–8。doi :10.1021/bi00033a042。PMID 7654720。 Ohba T, Rennert H, Pfeifer SM, et al. (1995). 「ヒトステロールキャリアタンパク質X/ステロールキャリアタンパク質2遺伝子（SCP2）の構造」. Genomics . 24 (2): 370–4. doi : 10.1006/geno.1994.1630 . PMID 7698762. Woodford JK、Colles SM、Myers-Payne S、他 (1995)。「ステロールキャリアタンパク質-2は直接膜相互作用により膜間ステロール輸送を刺激する」。Chem . Phys. Lipids . 76 (1): 73–84. doi :10.1016/0009-3084(95)02436-M. PMID 7788802。 Vesa J、Hellsten E、Barnoski BL、他 (1994)。「ステロールキャリアタンパク質 X/ステロールキャリアタンパク質 2 の 1p32 への割り当てと乳児神経セロイドリポフスチン症の原因遺伝子としての除外」。Hum . Mol. Genet . 3 (2): 341–6. doi :10.1093/hmg/3.2.341. PMID 8004106。 Seedorf U, Brysch P, Engel T, et al. (1994). 「ステロールキャリアタンパク質Xは、固有のステロールキャリアおよび脂質転移活性を持つペルオキシソーム3-オキソアシルコエンザイムAチオラーゼである」。J . Biol. Chem . 269 (33): 21277–83. doi : 10.1016/S0021-9258(17)31960-9 . PMID 8063752。 Szyperski T、Scheek S、Johansson J 、 et al. (1993)。「ヒトステロールキャリアタンパク質2の二次構造と3次元ポリペプチドバックボーンフォールドのNMR測定」。FEBS Lett。335 （ 1）：18–26。doi ： 10.1016 /0014-5793（93）80431- S。PMID 8243660。S2CID 9969358 。 Seedorf U, Scheek S, Engel T, et al. (1994). 「ヒトステロールキャリアタンパク質2の構造活性研究」 J. Biol. Chem . 269 (4): 2613–8. doi : 10.1016/S0021-9258(17)41988-0 . PMID 8300590. Yanase T, Hara T, Sakai Y, et al. (1996). 「ヒト副腎皮質組織におけるステロールキャリアタンパク質2（SCP2）の発現」 Eur. J. Endocrinol . 134 (4): 501–7. doi :10.1530/eje.0.1340501. PMID 8640304. Stolowich NJ、Frolov A、Atshaves B、et al. (1997)。「ステロールキャリアタンパク質-2脂肪酸結合部位：NMR、円偏光二色性、蛍光分光法による測定」。 生化学 。36 ( 7 ): 1719–29。doi :10.1021/bi962317a。PMID 9048555 。 Schalk JA、Offenberg HH、Peters E、et al. (1999)。「ヒト SCP2 cDNA の単離と特徴付け、および遺伝子の染色体局在」。Mamm . Genome . 10 (6): 642–4. doi :10.1007/s003359901062. PMID 10341103. S2CID 9107396。 Jatzke C, Hinz HJ, Seedorf U, Assmann G (1999). 「野生型および c17s 変異型ヒトステロールキャリアタンパク質 2 の安定性と結合特性」. Biochim. Biophys. Acta . 1432 (2): 265–74. doi :10.1016/S0167-4838(99)00114-4. PMID 10407148. Kimura H, Fujii H, Suzuki S, et al. (1999). 「ラットおよびヒト腎臓の脂質結合タンパク質」. Kidney Int. Suppl . 71 : S159–62. doi : 10.1046/j.1523-1755.1999.07141.x . PMID 10412765. Huang H、Ball JM、 Billheimer JT、Schroeder F (1999)。「ステロールキャリアタンパク質-2アミノ末端：膜相互作用ドメイン」。 生化学 。38 （ 40）：13231–43。doi ：10.1021/bi990870x。PMID 10529196 。
