ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| セル |
|---|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | SCEL、シエリン |
|---|
| 外部ID | オミム:604112; MGI : 1891228;ホモロジーン:2850;ジーンカード:SCEL; OMA :SCEL - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置(マウス) |
|---|
 | | クロ。 | 14番染色体(マウス)[2] |
|---|
| | バンド | 14|14 E2.3 | 始める | 103,750,778 bp [2] |
|---|
| 終わり | 103,850,233 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
|---|
| トップの表現 | - 太ももの皮
- 口腔
- 腕の皮膚
- 咽頭粘膜
- ヒップの皮膚
- 腹部の皮膚
- 頬粘膜細胞
- 羊水
- 歯茎
- 人間のペニス
|
| | トップの表現 | - 結膜円蓋
- 外耳の皮膚
- 角膜実質
- 食道
- 毛包
- 背中の皮膚
- 腹部の皮膚
- 水晶体上皮
- 右肺
- リップ
|
| | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- 細胞質
- 細胞外エクソソーム
- 膜
- 角質化した封筒
- 細胞質の核周囲領域
| | 生物学的プロセス |
- 胚の発育
- 表皮の発達
- ケラチノサイトの分化
- 機械的刺激に対する反応
- 標準的なWntシグナル伝達経路の正の制御
- 胚の発育は出産または卵の孵化で終わる
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
| オルソログ |
|---|
| 種 | 人間 | ねずみ |
|---|
| エントレズ | | |
|---|
| アンサンブル | | |
|---|
| ユニプロット | | |
|---|
| RefSeq (mRNA) | |
|---|
NM_001160706 NM_003843 NM_144777 |
| |
|---|
| RefSeq (タンパク質) | |
|---|
NP_001154178 NP_003834 NP_659001 |
| |
|---|
| 場所 (UCSC) | 13 章: 77.54 – 77.65 Mb | 14 章: 103.75 – 103.85 Mb |
|---|
| PubMed検索 | [3] | [4] |
|---|
|
| ウィキデータ |
|
シエリンとは、ヒトではSCEL遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、終末分化ケラチノサイトの角質化エンベロープの前駆体である。このタンパク質は細胞の周辺部に局在し、角質化エンベロープ内のタンパク質の組み立てや調節に機能する可能性がある。異なるアイソフォームをコードする転写バリアントが存在する。代替ポリAシグナルを利用する転写バリアントが文献に記載されているが、その全長は決定されていない。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000136155 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000022123 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Champliaud MF、Burgeson RE、Jin W、Baden HP、Olson PF (1998 年 12 月)。「角質細胞角化エンベロープの LIM ドメインタンパク質である sciellin の cDNA クローニングと特性評価」。J Biol Chem . 273 (47): 31547–54。doi : 10.1074/ jbc.273.47.31547。PMID 9813070。
- ^ ab "Entrez Gene: SCEL シエリン".
さらに読む
- Corona W、Karkera DJ、Patterson RH、他 (2004)。「食道扁平上皮癌の候補遺伝子としての Sciellin (SCEL) の分析」。Anticancer Res . 24 (3a): 1417–9。PMID 15274303 。
- Champliaud MF、Viel A、Baden HP (2003)。「皮膚におけるビタミン D 発現亢進タンパク質 1 の発現と培養ケラチノサイトにおけるシエリンとの相互作用」。J . Invest. Dermatol . 121 (4): 781–5. doi : 10.1046/j.1523-1747.2003.12539.x . PMID 14632196。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Champliaud MF、Baden HP、Koch M、他 (2001)。「バリア特性を示す脊椎動物上皮における sciellin (SCEL) の遺伝子特性とタンパク質の局在」。Genomics . 70 ( 2): 264–8. doi :10.1006/geno.2000.6390. PMID 11112355。
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). 「全長濃縮および5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Kvedar JC、 Manabe M、Phillips SB 、他 (1992)。「ヒトケラチノサイトの角質化エンベロープの前駆体であるシエリンの特性」。 分化。49 ( 3): 195–204。doi : 10.1111/j.1432-0436.1992.tb00667.x。PMID 1377656。