スキャンプ3

スキャンプ3
識別子
エイリアス	SCAMP3、C1orf3、分泌キャリア膜タンパク質3
外部ID	オミム：606913; MGI : 1346346;ホモロジーン: 4164;ジーンカード：SCAMP3; OMA :SCAMP3 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体1（ヒト）
終わり	155,262,430 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体3（マウス）
終わり	89,090,072 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	右副腎皮質; ; 左副腎; ; 左副腎皮質; ; 子宮内膜間質細胞; ; 心の頂点; ; 左心室; ; 脚の皮膚; ; 横行結腸粘膜; ; 腹部の皮膚; ; 腓腹筋;
	トップの表現
	卵黄嚢; ; 右腎臓; ; 受精卵; ; 太ももの筋肉; ; 外頸動脈; ; レンズ; ; 近位尿細管; ; リップ; ; 内頸動脈; ; 上前頭回;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	ユビキチンタンパク質リガーゼ結合;
細胞成分	膜の不可欠な構成要素; 細胞外エクソソーム; 細胞内膜で囲まれた細胞小器官; 膜; ゴルジ膜; ゴルジ体; トランスゴルジネットワーク膜; エンドソーム膜のリサイクル;
生物学的プロセス	タンパク質輸送; ゴルジ体後小胞輸送; 輸送;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	10067
	24045
	ENSG00000263290 ; ENSG00000116521
	ENSMUSG00000028049
	O14828
	O35609
	NM_005698 ; NM_052837
	NM_011886 ; NM_001309909 ; NM_001309910
	NP_005689 ; NP_443069
	NP_001296838 ; NP_001296839 ; NP_036016
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

分泌キャリア関連膜タンパク質3は、ヒトではSCAMP3遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]^[7]

関数

この遺伝子産物は、分泌キャリア膜タンパク質である SCAMP ファミリータンパク質に属します。これらは、ゴルジ体後のリサイクル経路で細胞表面へのキャリアとして機能します。異なるファミリーメンバーは、異なる遺伝子の非常に関連した産物であり、通常は一緒に発現します。これらの発見は、SCAMP が小胞輸送中に別々の経路ではなく同じ部位で機能する可能性があることを示唆しています。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする 2 つの転写バリアントが見つかりました。^[7]

インタラクション

SCAMP3はNEDD4と相互作用することが示されている。^[8]

参考文献

^ abc ENSG00000116521 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000263290、ENSG00000116521 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000028049 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Winfield SL、Tayebi N、Martin BM 、 Ginns EI、Sidransky E (1997 年 10 月)。「染色体 1q21 上のグルコセレブロシダーゼ遺伝子座に隣接する 3 つの追加遺伝子の特定: ゴーシェ病への影響」。ゲノム研究。7 ( 10 ): 1020–6。doi :10.1101/ gr.7.10.1020。PMC 310674。PMID 9331372。
^ Wu TT 、 Castle JD (1998 年 7 月)。「選択された分泌キャリア膜タンパク質 SCAMP1 および SCAMP3 のチロシンリン酸化と EGF 受容体との関連」。Molecular Biology of the Cell。9 ( 7): 1661– 74。doi :10.1091 / mbc.9.7.1661。PMC 25404。PMID 9658162。
^ ab 「Entrez Gene: SCAMP3 分泌キャリア膜タンパク質 3」。
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さらに読む

Wu TT、Castle JD (1997 年 7 月)。「分泌キャリア膜タンパク質 (SCAMP) の 37 kDa および 39 kDa アイソフォーム間の共局在および相互作用の証拠」。Journal of Cell Science。110 ( Pt 13) (13): 1533– 41。doi :10.1242/ jcs.110.13.1533。PMID 9224770 。
Singleton DR、Wu TT、Castle JD (1997 年 9 月)。「3 つの哺乳類 SCAMP (分泌キャリア膜タンパク質) は、類似した細胞内分布を持つ異なる遺伝子の非常に関連した産物です」。Journal of Cell Science。110 ( Pt 17) (17): 2099– 107。doi :10.1242/ jcs.110.17.2099。PMID 9378760 。
フェルナンデス＝チャコン R、アキリロアイエ M、ヤンツ R、アルバネシ JP、ズードホフ TC (2000 年 4 月)。「エンドサイトーシスにおけるSCAMP1の機能」。生物化学ジャーナル。275 (17): 12752– 6.土井: 10.1074/jbc.275.17.12752。PMID 10777571。
Brill LM、Salomon AR、Ficarro SB、Mukherji M、Stettler-Gill M、Peters EC (2004 年 5 月)。「固定化金属アフィニティークロマトグラフィーとタンデム質量分析法を用いたヒト T 細胞のチロシンリン酸化部位の堅牢なホスホプロテオームプロファイリング」。分析化学。76 ( 10): 2763– 72。doi :10.1021/ac035352d。PMID 15144186 。
Rush J、Moritz A、Lee KA、Guo A、Goss VL、Spek EJ、Zhang H、Zha XM、Polakiewicz RD、Comb MJ (2005 年 1 月)。「がん細胞におけるチロシンリン酸化の免疫親和性プロファイリング」。Nature Biotechnology 23 ( 1): 94– 101. doi :10.1038/nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、Macek B、Kumar C、Mortensen P、Mann M (2006 年 11 月)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。

外部リンク

UCSC ゲノムブラウザにおける SCAMP3 ヒト遺伝子の位置。
UCSC ゲノムブラウザにおける SCAMP3 ヒト遺伝子の詳細。

[refGRCh38Ensembl-1] ENSG00000116521 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000263290、ENSG00000116521 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000028049 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid9331372-5] ^ Winfield SL、Tayebi N、Martin BM 、 Ginns EI、Sidransky E (1997 年 10 月)。「染色体 1q21 上のグルコセレブロシダーゼ遺伝子座に隣接する 3 つの追加遺伝子の特定: ゴーシェ病への影響」。ゲノム研究。7 ( 10 ): 1020–6。doi :10.1101/ gr.7.10.1020。PMC 310674。PMID 9331372。

[pmid9658162-6] ^ Wu TT 、 Castle JD (1998 年 7 月)。「選択された分泌キャリア膜タンパク質 SCAMP1 および SCAMP3 のチロシンリン酸化と EGF 受容体との関連」。Molecular Biology of the Cell。9 ( 7): 1661– 74。doi :10.1091 / mbc.9.7.1661。PMC 25404。PMID 9658162。

[entrez-7] 「Entrez Gene: SCAMP3 分泌キャリア膜タンパク質 3」。

[pmid19158374-8] Aoh QL、Castle AM、Hubbard CH、Katsumata O、Castle JD (2009年3月)。「SCAMP3は上皮成長因子受容体の分解を抑制し、受容体のリサイクルを促進する」。Molecular Biology of the Cell . 20 (6): 1816– 32. doi :10.1091/mbc.E08-09-0894. PMC 2655259 . PMID 19158374.