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| ロダネーゼのようなドメイン | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| シンボル | ローダネーゼ | ||||||||
| パム | PF00581 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| プロサイト | PDOC00322 | ||||||||
| SCOP2 | 2ora / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| OPMスーパーファミリー | 413 | ||||||||
| OPMタンパク質 | 2mpn | ||||||||
| 医療機器 | cd00158 | ||||||||
| メンブラノーム | 571 | ||||||||
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| チオ硫酸硫黄転移酵素 | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| EC番号 | 2.8.1.1 | ||||||||
| CAS番号 | 9026-04-4 | ||||||||
| データベース | |||||||||
| インテンズ | IntEnzビュー | ||||||||
| ブレンダ | BRENDAエントリー | ||||||||
| エクスパス | NiceZyme ビュー | ||||||||
| ケッグ | KEGGエントリー | ||||||||
| メタサイク | 代謝経路 | ||||||||
| プリアモス | プロフィール | ||||||||
| PDB構造 | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| 遺伝子オントロジー | アミゴー / クイックゴー | ||||||||
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ロダネーゼは、シアン化物（CN − ）をチオシアン酸塩（SCN −、別名「ロダネート」）に変換して解毒するミトコンドリア 酵素です。 [1]酵素学では、一般名はチオ硫酸硫黄転移酵素（EC 2.8.1.1）です。[2]右の図は、結晶学的に決定されたロダネーゼの構造を示しています。
次の反応 を触媒します。
- チオ硫酸塩 + シアン化物亜硫酸塩 + チオシアン酸塩
構造とメカニズム
この反応は2段階で進行する。第一段階では、チオ硫酸塩がシステイン-247 1のチオール基によって還元され、過硫化物と亜硫酸塩2が形成される。第二段階では、過硫化物がシアン化物と反応してチオシアン酸塩が生成され、システインチオール1が再生される。[3]
Rhodanese は、以下を含む多数のタンパク質ファミリーと進化的関係を共有しています。
- Cdc25 ホスファターゼ触媒ドメイン
- 真核生物の二重特異性MAPKホスファターゼの非触媒ドメイン
- 酵母PTP型MAPKホスファターゼの非触媒ドメイン
- 酵母Ubp4、Ubp5、Ubp7の非触媒ドメイン
- 哺乳類Ubp-Yの非触媒ドメイン
- ショウジョウバエ熱ショックタンパク質 HSP-67BB
- いくつかの細菌のコールドショックおよびファージショックタンパク質
- 植物老化関連タンパク質
- ロダネーゼの触媒ドメインと非触媒ドメイン[4]
ロダネーゼには内部重複がある。このドメインはホスファターゼやユビキチンC末端加水分解酵素などの他のタンパク質にも単一コピーとして存在する。[5]
臨床的関連性
この反応は、生成されるチオシアン酸塩の毒性が約1/200であるため、シアン化物への曝露の治療に重要です。[6] :p. 15938チオ硫酸塩溶液をシアン化物中毒の解毒剤として使用するのは、この酵素サイクルの活性化に基づいています。
ヒトタンパク質
ヒトのミトコンドリアのロダネーゼ遺伝子はTSTです。
以下の他のヒト遺伝子は InterPro の「ロダナーゼ様」ドメインと一致しますが、触媒活性を持つロダナーゼではありません( #構造とメカニズムの関連ファミリーのリストも参照)。
- M 期誘導ホスファターゼ: CDC25A ; CDC25B ; CDC25C ;
- 二重特異性タンパク質ホスファターゼ: DUSP ; DUSP1 ; DUSP2 ; DUSP4 ; DUSP5 ; DUSP6 ; DUSP7 ; DUSP10 ; DUSP16、別名 MKP7;
- チオ硫酸：グルタチオン硫黄転移酵素：KAT、現在は「TSTD1」として知られています。
- アデニル基転移酵素および硫黄基転移酵素：MOCS3 ;
- 3-メルカプトピルビン酸硫黄転移酵素: MPST、別名「TSTD2」
- 酵素ではありません: TBCK; TSGA14;
- ユビキチンカルボキシル末端加水分解酵素：USP8 ;
- 不明なアクティビティ: TSTD3
命名法
酵素の標準的な命名規則では、酵素の名前は「-ase」の文字で終わることになっていますが、ロダネーゼは1933年に初めて記述され、[7] 1955年に酵素委員会が設立される前のことでした。そのため、古い名前はすでに広く使用されていました。
この酵素クラスの体系名は「チオ硫酸:シアン化物硫黄転移酵素」です。 よく使われる他の名前には、「チオ硫酸シアン化物トランススルフラーゼ」、「チオ硫酸チオトランスフェラーゼ」、「ロダネーゼ」、「ロダナーゼ」などがあります。
参考文献
- ^ Cipollone R、Ascenzi P、Tomao P、Imperi F、Visca P (2008)。「シアン化物の酵素解毒：Pseudomonas aeruginosa Rhodaneseからの手がかり」。分子 微生物学およびバイオテクノロジージャーナル。15 （2–3 ）：199–211。doi ：10.1159/000121331。PMID 18685272。S2CID 25431686 。
- ^ EC 2.8.1.1、国際生化学・分子生物学連合
- ^ Cipollone R、Ascenzi P、Tomao P、Imperi F、Visca P (2008)。「シアン化物の酵素解毒：Pseudomonas aeruginosa Rhodaneseからの手がかり」。分子 微生物学およびバイオテクノロジージャーナル。15 （2–3 ）：199–211。doi ：10.1159/000121331。PMID 18685272。S2CID 25431686 。
- ^ 「チオ硫酸硫黄転移酵素、保存部位（IPR001307）」。EMBL- EBI。InterPro。
- ^ Gliubich F, Gazerro M, Zanotti G, Delbono S, Bombieri G, Berni R (1996 年 8 月). 「化学的に修飾されたロダネーゼの活性部位の構造的特徴」. The Journal of Biological Chemistry . 271 (35): 21054–61. doi : 10.1074/jbc.271.35.21054 . PMID 8702871.
- ^ Jaszczak E, Polkowska Ż, Narkowicz S, Namieśnik J (2017 年 7 月). 「環境中のシアン化物 - 分析 - 問題と課題」.環境科学および汚染研究国際誌. 24 (19): 15929–15948. doi :10.1007/s11356-017-9081-7. PMC 5506515. PMID 28512706 .
- ^ Cipollone R、Ascenzi P、Visca P (2007 年 2 月)。「ロダネーゼ スーパーファミリーの共通テーマとバリエーション」。IUBMB Life。59 ( 2 ) : 51–9。doi : 10.1080 /15216540701206859。PMID 17454295。
外部リンク
ウィキメディア・コモンズには、ローダネーゼに関連するメディアがあります。
- 米国国立医学図書館の医学件名標目表(MeSH)の Rhodanese
