ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
RLIM 識別子 エイリアス RLIM 、NY-REN-43、RNF12、リングフィンガータンパク質、LIMドメイン相互作用、MRX61、TOKAS 外部ID オミム : 300379; MGI : 1342291; ホモロジーン ：7920; ジーンカード ：RLIM; OMA :RLIM - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 X染色体（マウス） [2] バンド X 46.42 cM|XD 始める 103,000,769 bp [2] 終わり 103,024,890 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 中側頭回 軟骨組織 アキレス腱 ブロードマン領域46 中心後回 内淡蒼球 嗅内皮質 ブロードマン領域23 上腕二頭筋の腱 緻密部
トップの表現 原腸胚 積雲細胞 内頸動脈 受精卵 生殖腺隆起 外頸動脈 外胚葉 耳小胞 吻側回遊流 耳板
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
転写コリプレッサー活性 金属イオン結合 トランスフェラーゼ活性 ユビキチンタンパク質転移酵素活性 ユビキチンタンパク質リガーゼ活性 タンパク質結合 細胞成分 生物学的プロセス
転写の負の調節、DNAテンプレート 転写、DNAテンプレート タンパク質のユビキチン化 プロテアソームを介したユビキチン依存性タンパク質分解プロセス タンパク質ポリユビキチン化 転写の調節、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 ユビキチン依存性タンパク質分解プロセス DNA結合転写因子活性の負の制御 X染色体のランダムな不活性化 X染色体の不活性化による用量補償の調節 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
E3ユビキチンタンパク質リガーゼRLIM は、ヒトでは RLIM 遺伝子によってコードされる 酵素 である 。 [5] [6]
関数 この遺伝子によってコードされるタンパク質は、RING-H2ジンクフィンガータンパク質である。これは、LIMドメイン結合1（LDB1/CLIM）を標的とし、プロテアソーム依存性LDB1分解を引き起こすユビキチンタンパク質リガーゼであることが示された。このタンパク質とLDB1は、ホメオドメイン転写因子であるLHX1/LIM-1の共抑制因子である。同じタンパク質をコードする選択的スプライシング転写バリアントが報告されている。 [6] メスのマウスでは、X染色体不活性化の調節因子として機能する。
インタラクション RNF12はエストロゲン受容体α と 相互作用する ことが示されている 。 [7]
参考文献
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さらに読む
ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實＝岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005）。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。 自然 。 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026. Hiratani I, Yamamoto N, Mochizuki T, Ohmori SY, Taira M (2003). 「Rnf12/RLIM による過剰 Ldb1 の選択的分解は、アフリカツメガエルオーガナイザー機能において適切な Ldb1 発現レベルと Xlim-1/Ldb1 化学量論をもたらす」。 開発。130 ( 17 ) : 4161–75。doi :10.1242/dev.00621。PMID 12874135。S2CID 18111062 。 Ostendorff HP、Bossenz M、Mincheva A、Copeland NG、Gilbert DJ、Jenkins NA、Lichter P、Bach I (2000)。「LIM ホメオドメイン因子のコリプレッサーである RLIM をコードする遺伝子の機能的特徴」。Genomics . 69 ( 1): 120–30. doi :10.1006/geno.2000.6311. PMID 11013082。 Bach I、Rodriguez-Esteban C、Carrière C、Bhushan A、Krones A、Rose DW、Glass CK、Andersen B、Izpisúa Belmonte JC、Rosenfeld MG (1999)。「RLIM はヒストン脱アセチル化酵素複合体のリクルートメントを介して LIM ホメオドメイン転写因子の機能活性を阻害する」。Nat . Genet . 22 (4): 394–9. doi :10.1038/11970. PMID 10431247. S2CID 22326394。 Shin J, Bossenz M, Chung Y, Ma H, Byron M, Taniguchi-Ishigaki N, Zhu X, Jiao B, Hall LL, Green MR, Jones SN, Hermans-Borgmeyer I, Lawrence JB, Bach I (2010). 「マウスの刷り込みX染色体の不活性化には母体のRnf12/RLIMが必要である」. Nature . 467 (7318): 977–81. Bibcode :2010Natur.467..977S. doi :10.1038/nature09457. PMC 2967734. PMID 20962847 . Jiao B、Taniguchi-Ishigaki N、Güngör C、Peters MA、Chen YW、Riethdorf S、Drung A、Ahronian LG、Shin J、Pagnis R、Pantel K、Tachibana T、Lewis BC、Johnsen SA、Bach I (2013)。「RLIM/Rnf12 の機能活性はリン酸化依存性の核質間輸送によって制御される」。Mol Biol Cell . 24 (19): 3085–96. doi :10.1091/mbc.E13-05-0239. PMC 3784382 . PMID 23904271。
