シュードモナス・クロロラフィス

シュードモナス・クロロラフィス
科学的分類
ドメイン：	細菌
門:	シュードモナドタ
クラス：	ガンマプロテオバクテリア
注文：	シュードモナス目
家族：	シュードモナス科
属:	シュードモナス
種：	P.クロロラフィス
二名法名
	シュードモナス・クロロラフィス; ( Guignardおよび Sauvageau 1894) ; Bergeyら。 1930年
タイプ株
	ATCC 9446; CCUG 552 B ; CFBP 2132 ; CIP 63.22 ; DSM 50083 ; HAMBI 2011 ; JCM 2778 ; LMG 5004 ; NBRC 3904 ; NCCB 76041 および 37027 ; NCTC 13002 ; VKM B-1246
同義語
	バチルス・クロロラフィスギニャールとソヴァジョ 1894

Pseudomonas chlororaphisは、農業や園芸において土壌接種剤として使用される細菌ですフェナジン型抗生物質の生産により、特定の真菌性植物病原体に対する生物防除剤として作用します。^{[1] 16S}rRNA分析に基づいて、類似の種がこのグループに分類されています。^[2]

2020年に行われた比較ゲノムおよび系統ゲノム研究では、 Pseudomonas属全体から494の完全なゲノムが解析され、そのうち43がP. chlororaphis株でした。^[3]この研究では、P. chlororaphis種は、その単系統性と平均ヌクレオチド同一性の基準に基づいて決定されました。この種は、によって決定されたより広範なP. fluorescens種複合体内にあります。^[3]^[4]^[5] この種の株のタンパク質数とGC含量は、それぞれ5599〜6401（平均：6076）と61.9〜64％（平均：62.8％）の範囲でした。^[3]さらに、43のP. chlororaphisプロテオームには3587のコアタンパク質（この種のすべての株で共有）が含まれており、11のコアタンパク質はそのグループに特異的であり、したがってPseudomonas属の他のすべての株には存在しません。^[3]これらの11のグループ特異的なコアタンパク質のうち2つは、ホリンファミリーバクテリオシンとマイトマイシン様生合成タンパク質であり、他の根に定着する細菌に対して競争上の優位性を与える可能性があります。^[3]

のシュードモナス・クロロラフィスグループ

Pseudomonas chlororaphis は、 Pseudomonas属内のサブグループにその名を貸しています。 P. chlororaphisサブグループの他のメンバーは、P. aurantiaca、P. aureofaciens、P. fragi、P. lundensis、およびP. taetrolensです。^[2]

参考文献

^ Chin-A-Woeng TF, et al. (2000). 「フェナジン-1-カルボキサミド産生細菌 Pseudomonas chlororaphis PCL1391 による根のコロニー形成は、トマトの根腐れおよび根腐れの生物的防除に不可欠である」Mol Plant Microbe Interact . 13 (12): 1340–5. doi : 10.1094/MPMI.2000.13.12.1340 . hdl : 1887/62881 . PMID 11106026.
^ ab Anzai; Kim, H; Park, JY; Wakabayashi, H; Oyaizu, H; et al. (2000年7月). 「16S rRNA配列に基づくシュードモナスの系統学的所属」. Int J Syst Evol Microbiol . 50 (4): 1563–89. doi :10.1099/00207713-50-4-1563. PMID 10939664.
^ abcde Nikolaidis, Marios; Mossialos, Dimitris; Oliver, Stephen G.; Amoutzias, Grigorios D. (2020-07-24). 「Pseudomonas 主要進化グループ間のコアプロテオームの比較分析により、Pseudomonas aeruginosa および Pseudomonas chlororaphis の種特異的適応が明らかになる」.多様性. 12 (8): 289. doi : 10.3390/d12080289 . ISSN 1424-2818.
^ Mulet, Magdalena; Lalucat, Jorge; García-Valdés, Elena (2010年3月). 「Pseudomonas種のDNA配列ベース分析」.環境微生物学. 12 (6): 1513–1530. doi :10.1111/j.1462-2920.2010.02181.x. PMID 20192968.
^ Scales, Brittan S.; Dickson, Robert P.; LiPuma, John J.; Huffnagle, Gary B. (2014年10月). 「ヒトの無評価のコロニー形成菌であるPseudomonas fluorescens種複合体の微生物学、ゲノミクス、臨床的意義」。臨床微生物学レビュー。27 ( 4): 927–948。doi :10.1128/ CMR.00044-14。ISSN 0893-8512。PMC 4187640。PMID 25278578 。

外部リンク

BacDive の Pseudomonas chlororaphis の標準株 - 細菌多様性メタデータ

[1] Chin-A-Woeng TF, et al. (2000). 「フェナジン-1-カルボキサミド産生細菌 Pseudomonas chlororaphis PCL1391 による根のコロニー形成は、トマトの根腐れおよび根腐れの生物的防除に不可欠である」Mol Plant Microbe Interact . 13 (12): 1340–5. doi : 10.1094/MPMI.2000.13.12.1340 . hdl : 1887/62881 . PMID 11106026.

[Anzai-2] Anzai; Kim, H; Park, JY; Wakabayashi, H; Oyaizu, H; et al. (2000年7月). 「16S rRNA配列に基づくシュードモナスの系統学的所属」. Int J Syst Evol Microbiol . 50 (4): 1563–89. doi :10.1099/00207713-50-4-1563. PMID 10939664.

[:0-3] Nikolaidis, Marios; Mossialos, Dimitris; Oliver, Stephen G.; Amoutzias, Grigorios D. (2020-07-24). 「Pseudomonas 主要進化グループ間のコアプロテオームの比較分析により、Pseudomonas aeruginosa および Pseudomonas chlororaphis の種特異的適応が明らかになる」.多様性. 12 (8): 289. doi : 10.3390/d12080289 . ISSN 1424-2818.

[4] Mulet, Magdalena; Lalucat, Jorge; García-Valdés, Elena (2010年3月). 「Pseudomonas種のDNA配列ベース分析」.環境微生物学. 12 (6): 1513–1530. doi :10.1111/j.1462-2920.2010.02181.x. PMID 20192968.

[5] Scales, Brittan S.; Dickson, Robert P.; LiPuma, John J.; Huffnagle, Gary B. (2014年10月). 「ヒトの無評価のコロニー形成菌であるPseudomonas fluorescens種複合体の微生物学、ゲノミクス、臨床的意義」。臨床微生物学レビュー。27 ( 4): 927–948。doi :10.1128/ CMR.00044-14。ISSN 0893-8512。PMC 4187640。PMID 25278578 。