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| タンパク質アルギニンデイミナーゼ | |||||||||
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タンパク質-アルギニン デイミナーゼ 4、二量体、ヒト | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| EC番号 | 3.5.3.15 | ||||||||
| CAS番号 | 75536-80-0 | ||||||||
| データベース | |||||||||
| インテンズ | IntEnzビュー | ||||||||
| ブレンダ | BRENDAエントリー | ||||||||
| エクスパス | NiceZyme ビュー | ||||||||
| ケッグ | KEGGエントリー | ||||||||
| メタサイク | 代謝経路 | ||||||||
| プリアモス | プロフィール | ||||||||
| PDB構造 | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| 遺伝子オントロジー | アミゴー / クイックゴー | ||||||||
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酵素学では、タンパク質アルギニンデイミナーゼ(EC 3.5.3.15)は、アルギニン脱イミノ化またはシトルリン化と呼ばれる翻訳後修飾の一種を触媒する酵素です。
- タンパク質L -アルギニン + H 2 Oタンパク質L -シトルリン + NH 3
したがって、この酵素の2 つの基質はタンパク質L -アルギニン(タンパク質内のアルギニン残基) とH 2 Oであり、2 つの生成物はタンパク質L -シトルリンとNH 3です。
この酵素は、ペプチド結合以外の炭素-窒素結合、具体的には直鎖アミジンに作用する加水分解酵素のファミリーに属します。この酵素クラスの系統名は、タンパク質-L-アルギニンイミノヒドロラーゼです。この酵素は、ペプチジルアルギニンデイミナーゼとも呼ばれます。
構造研究
2007 年末現在、このクラスの酵素については 7 つの構造が解明されており、PDBアクセス コードは 1WD8、1WD9、1WDA、2DEW、2DEX、2DEY、および 2DW5 です。
哺乳類タンパク質
哺乳類には5つのタンパク質アルギニンデイミナーゼがあり、記号は
齧歯類を除いて、大文字と小文字は異なります。
- パディ1、パディ2、パディ3、パディ4、パディ6 [3]
この異なる事例は単なる歴史的遺物であり、げっ歯類のタンパク質が特別であることを示すものではありません。
参考文献
- ^ Sams, KL; Mukai, C; Marks, BA; Mittal, C; Demeter, EA; Nelissen, S; Grenier, JK; Tate, AE; Ahmed, F; Coonrod, SA (2022年10月). 「雄のPadi2/Padi4ダブルノックアウトマウスにおける思春期遅延、ゴナドトロピン異常および低受精能」Reprod Biol Endocrinol . 20 (1): 150. doi : 10.1186/s12958-022-01018-w . PMC 9555066. PMID 36224627 .
- ^ 「「ペプチジルアルギニンデイミナーゼ」の検索結果」。脊椎動物遺伝子命名委員会。 2022年2月9日閲覧。
- ^ 「タンパク質スーパーファミリーの詳細: タンパク質-アルギニンデイミナーゼ」。マウスゲノムインフォマティクス。
- 藤崎 正之、菅原 憲 (1981 年 1 月)。「新生ラットの表皮からのペプチジルアルギニンデイミナーゼの特性」。J . Biochem . 89 (1)。東京: 257– 63。doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a133189。PMID 7217033 。
- 米国国立医学図書館の医学主題標目表(MeSH)にあるタンパク質-アルギニン+デイミナーゼ
