ピコルナウイルス科

ピコルナウイルス目は、脊椎動物、無脊椎動物、原生生物、植物を宿主とするウイルスの目です。^[1] この名前には2つの語源があります。^[2] まず、 picorna-はポリオウイルス、エーテルに対する非感受性、コクサッキーウイルス、オーファンウイルス、ライノウイルス、リボ核酸の頭文字です。次に、極めて小さいを意味するpico-が RNAと組み合わさって、これらの非常に小さな RNAウイルスを表します。^[2]^この目は、歴史的にピコルナ様ウイルスと呼ばれているウイルスで構成されています。

特徴

この目内の科には、いくつかの共通の特徴があります。

ウイルス粒子はエンベロープを持たず、二十面体で、直径は約 30 ナノメートルです。
カプシドは「疑似 T=3」構造を持ち、それぞれが 3 つの類似したサイズだが同一ではないベータバレルで構成された 60 個のプロトマーで構成されています。
ゲノムは、重複するオープンリーディングフレームなしで直接mRNAとして機能する 1 つまたは少数の一本鎖RNAで構成されています。
ゲノムには、 5' 末端に共有結合した小さなタンパク質VPgと、通常はポリアデニル化された 3' 末端があります。
各ゲノム RNA は、 1 つまたは複数のウイルスコード化プロテアーゼを介してポリタンパク質に翻訳され、成熟したウイルスタンパク質が生成されます。
ピコルナウイルス科の特徴は、配列ドメインの保存されたモジュールである Hel-Pro-Pol であり、これはポリタンパク質のアミノ末端からカルボキシ末端までの特徴です。
- スーパーファミリーIIIに属するヘリカーゼ
- [VPgはこれら2つのドメインの間にエンコードされます]
- キモトリプシン様プロテアーゼで、触媒残基は典型的にはセリンではなくシステインである。
- スーパーファミリーIに属するポリメラーゼ。この保存されたモジュールはピコルナウイルス科の特徴である。

ピコルナ様ウイルスの進化は、真核生物が現存するクラウングループに分離するよりも前に起こったと思われる。^[3]

以下のファミリーが認められています: ^[4]

^ Le Gall, Olivier; Christian, Peter; Fauquet, Claude M.; King, Andrew MQ; Knowles, Nick J.; Nakashima, Nobuhiko; Stanway, Glyn; Gorbalenya, Alexander E. (2008-04-01). 「ピコルナウイルス目、擬似T = 3ビリオン構造を持つポジティブセンス一本鎖RNAウイルスの提案目」Archives of Virology . 153 (4): 715–27. doi :10.1007/s00705-008-0041-x. PMID 18293057. S2CID 2303309.
^ abc 「ピコルナウイルス科」。国際ウイルス分類委員会（ICTV） 2017年10月。2017年9月21日時点のオリジナルよりアーカイブ。2019年2月5日閲覧。
^ Koonin, Eugene V.; Wolf, Yuri I.; Nagasawa, Keizo; Dolja, Valerian V. (2008). 「ピコルナ様ウイルスの進化のビッグバンは、真核生物スーパーグループの放散に先行していた」。Nature Reviews Microbiology . 6 (12): 925–939. doi : 10.1038/nrmicro2030 . PMID 18997823. S2CID 205497478.
^ 「ウイルス分類：2019年リリース」。talk.ictvonline.org。国際ウイルス分類委員会。 2020年4月30日閲覧。