ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| PDC |
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| 識別子 |
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| エイリアス | PDC、MEKA、PHD、PhLOP、PhLP、ホスデューシン |
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| 外部ID | オミム:171490; MGI : 98090;ホモロジーン: 1950;ジーンカード:PDC; OMA :PDC - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体1(マウス)[2] |
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| | バンド | 1 G1|1 63.84 cM | 始める | 150,195,168 bp [2] |
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| 終わり | 150,209,657 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 睾丸
- 網膜色素上皮
- 小脳の右半球
- 脳梁
- 結腸上皮
- アキレス腱
- ブロードマン領域9
- ヒップの皮膚
- 脛骨神経
- 横紋筋組織
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| | トップの表現 | - 網膜の神経層
- 網膜色素上皮
- 水晶体上皮
- 毛様体
- 角膜実質
- 虹彩
- 松果体
- 胆嚢
- 結膜円蓋
- 内頸動脈
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ホスホリパーゼ阻害活性
- キューインtRNAリボシルトランスフェラーゼ活性
| | 細胞成分 |
- 光受容体内節
- 細胞質
- 細胞質
- 光受容体外節
- 細胞投影
- 繊毛
- 核
| | 生物学的プロセス |
- キューオシン生合成プロセス
- Gタンパク質共役受容体シグナル伝達経路
- 刺激に対する反応
- 視覚
- 光変換
- 触媒活性の負の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_002597 NM_022576 NM_022577 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_002588 NP_072098 NP_002588.3 |
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| 場所 (UCSC) | 1 章: 186.44 – 186.46 Mb | 1 章: 150.2 – 150.21 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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ホスデューシンはPDCとしても知られ、ヒトのタンパク質および遺伝子です。[5]ホスデューシンファミリーのタンパク質に属します。
この遺伝子は、網膜の桿体細胞の外節と内節に位置するリン酸化タンパク質をコードします。このタンパク質は、視覚光伝達の調節または光受容体代謝の統合に関与している可能性があります。網膜 G タンパク質トランスデューシンのベータ サブユニットとガンマ サブユニットと相互作用することで、光伝達カスケードを調整します。これらのサブユニットのみと結合することで、トランスデューシン アルファ サブユニットはより長くアクティブになります。これにより、視覚興奮の時間が長くなります。
この遺伝子は網膜色素変性症およびアッシャー症候群II型の潜在的な候補遺伝子である。異なるアイソフォームをコードする選択的スプライシング転写変異体が同定されている。[5]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000116703 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000006007 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab 「Entrez Gene: PDC ホスデューシン」。
さらに読む
- Abe T, Nakabayashi H, Tamada H, et al. (1990). 「網膜と松果体におけるヒト、ウシ、ラットの33kDaタンパク質とcDNAの分析」. Gene . 91 (2): 209–15. doi :10.1016/0378-1119(90)90090-E. PMID 2210381.
- Watanabe Y, Kawasaki K, Miki N, Kuo CH (1990). 「網膜特異的タンパク質をコードするヒトMEKA遺伝子の単離と分析」. Biochem. Biophys. Res. Commun . 170 (2): 951–6. doi :10.1016/0006-291X(90)92183-Z. PMID 2383274.
- Lee RH、Brown BM、Lolley RN (1990)。「タンパク質キナーゼAは、網膜ホスデューシンのセリン73をin situでリン酸化する」。J . Biol. Chem . 265 (26): 15860–6. doi : 10.1016/S0021-9258(18)55478-8 . PMID 2394752。
- Hawes BE、Touhara K、Kurose H、et al. (1994)。「ホスデューシンのGベータガンマ結合ドメインの決定。Gベータガンマシグナル伝達の調節可能なモジュレーター」。J . Biol. Chem . 269 (47): 29825–30。doi : 10.1016 / S0021-9258 (18)43955-5。PMID 7961975。
- Abe T, Kikuchi T, Shinohara T (1994). 「ヒトホスデューシン遺伝子 (PDC) の配列とその 5' 隣接領域」. Genomics . 19 (2): 369–72. doi :10.1006/geno.1994.1072. PMID 8188267.
- Sparkes RS、Lee RH、Shinohara T、et al. (1994)。「体細胞ハイブリダイゼーションおよびin situハイブリダイゼーションによるホスデューシン(PDC)遺伝子のヒト染色体1q25-1q32.1への割り当て」。Genomics。18 ( 2):426–8。doi : 10.1006 /geno.1993.1490。PMID 8288249 。
- Ding C、Li X、Griffin CA、et al. (1994)。 「 Gタンパク質βγ二量体に結合する可溶性タンパク質であるヒトホスデューシン(PDC)の遺伝子は、1q25-q31.1にマッピングされます」。Genomics。18 (2 ):457–9。doi :10.1006/ geno.1993.1501。PMID 8288259。
- Boekhoff I, Touhara K, Danner S, et al. (1997). 「ホスデューシン、嗅覚シグナル伝達の調節における潜在的役割」J. Biol. Chem . 272 (7): 4606–12. doi : 10.1074/jbc.272.7.4606 . PMID 9020189.
- Barhite S、Thibault C、Miles MF (1998)。「Gベータガンマ機能の調節因子であるフォスデューシン様タンパク質(PhLP)は、プロテアソームタンパク質SUG1と相互作用する」。Biochim . Biophys. Acta . 1402 (1): 95–101. doi : 10.1016/S0167-4889(97)00141-9 . PMID 9551090。
- Zhu X、Craft CM (1998)。「ホスデューシンおよびホスデューシンアイソフォームと26SプロテアソームサブユニットSUG1との相互作用」。Mol . Vis . 4:13 . PMID 9701609。
- Craft CM、Xu J、 Slepak VZ、et al. (1998)。「G ベータガンマ結合タンパク質のホスデューシンファミリーの PhLP と PhLOP」。生化学。37 ( 45): 15758–72。doi :10.1021/bi980921a。PMID 9843381 。
- Carpten JD、Makalowska I、Robbins CM、他 (2000)。「遺伝性前立腺がん 1 (HPC1) 領域を網羅する 6 Mb の高解像度物理および転写マップ」。Genomics . 64 ( 1): 1–14. doi :10.1006/geno.1999.6051. PMID 10708513。
- Zhu X, Craft CM (2000). 「ホスデューシンのカルボキシル末端ドメインは転写活性化因子として機能する」. Biochem. Biophys. Res. Commun . 270 (2): 504–9. doi :10.1006/bbrc.2000.2414. PMID 10753654.
- Zhu X, Craft CM (2000). 「ホスデューシンアイソフォームによる CRX トランス活性化活性の調節」Mol. Cell. Biol . 20 (14): 5216–26. doi : 10.1128/MCB.20.14.5216-5226.2000. PMC 85970. PMID 10866677.
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- Thulin CD、Savage JR、McLaughlin JN、他 (2001)。「Ca2+/カルモジュリン依存性タンパク質キナーゼIIリン酸化および14-3-3タンパク質結合によるGタンパク質調節因子ホスデューシンの調節」。J . Biol. Chem . 276 (26): 23805–15. doi : 10.1074/jbc.M101482200 . PMID 11331285。
- Wistow G、Bernstein SL、Wyatt MK、他 (2002)。「NEIBank プロジェクトのためのヒト網膜の発現配列タグ解析: 豊富な新規網膜 cDNA であるレトビンディンと、その他の網膜優先遺伝子転写の選択的スプライシング」。Mol . Vis . 8 : 196–204。PMID 12107411 。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- マーグリス A、ダン L、プルクリ S、他。 (2002年)。 「ウシ網膜細胞の核におけるホスデューシンの存在」。モル。ヴィス。8 : 477–82。PMID 12500174。