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| パルティティウイルス科 | |
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| ペニシリウム ストロニフェルムウイルス S カプシド、EMD-5161のCryoEM [1] | |
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| ペニシリウム ストロニフェルムウイルス S のTEM | |
ウイルスの分類 
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| (ランク外): | ウイルス |
| 領域: | リボビリア |
| 王国： | オルタナウイルス科 |
| 門: | ピスビリコタ |
| クラス： | デュプロピビリセテス |
| 注文： | ドゥルナウイルス目 |
| 家族： | パルティティウイルス科 |
パルティティウイルス科は二本鎖RNAウイルスの科である。 [2] 植物、菌類、原生動物が自然宿主となる。細菌にも感染する可能性があるとされている。 [3]この科名はラテン語の「分割」を意味するpartitiusに由来し、パルティティウイルスの分節ゲノムを指す。この科には5属60種があり、そのうち15種は属に割り当てられていない。 [4] [5]
構造
パルティティウイルス科のウイルスはエンベロープを持たず、正二十面体の形状とT=1対称性を持つ。 [6]パルティティウイルスの直径は約25～43 nmである。[4]
ゲノム
パルティティウイルスは、2つのゲノムセグメントに分かれた二本鎖RNAゲノムを持ち、さらにサブゲノムセグメントが存在する場合もある。2つのゲノムセグメントは別々のウイルス粒子にパッケージ化されており、2つの異なるタンパク質をコードしている。最初のセグメントはRNA依存性RNAポリメラーゼ（RdRp）をコードし、2番目のセグメントはコートタンパク質をコードしている。セグメントの長さは約1.4～3.0 kbpで、ゲノム全体の長さは約3.0～4.8 kbpである。[4] [6]
ライフサイクル
ウイルスの複製は細胞質内で行われる。宿主細胞への侵入は宿主細胞への侵入によって達成される。複製は二本鎖RNAウイルス複製モデルに従う。二本鎖RNAウイルス転写が転写の手段である。ウイルスは細胞間移動によって宿主細胞から出る。真菌および植物が自然宿主となる。[4] [6]クリプトウイルスはクリプトスポリジウム属のアピコンプレックス原生動物に感染し、[7]他の属のウイルスは植物および真菌に感染する。細菌にも感染する可能性があることが示唆されている。
系統学
RNAポリメラーゼ遺伝子に基づいて、このグループは4つの系統群（I-IV）に分けられます。[8]動物と原生動物からの4つの分離株が5番目の系統群を形成します。系統群I-IVは、植物と真菌からのパルティティウイルス様配列の混合物で構成されています。[要出典]
分類
パルティティウイルス科には5つの属が認められている。さらに、属に割り当てられていない種が15種ある。[4] [5]
アルファパルティウイルス
- ビート潜在性ウイルス 1
- ニンジンの潜在的ウイルス
- チェリークロロティックさび斑点病関連パルティウイルス
- Chondrostereum purpureum 潜在性ウイルス 1
- エボシガラ褐変ウイルス
- ヘリコバシジウム モンパ パルチチウイルス V70
- ヘテロバシディオン・パルティティウイルス 1
- ヘテロバシディオン・パルティティウイルス3
- ヘテロバシディオン・パルティティウイルス 12
- ヘテロバシディオン・パルティティウイルス 13
- ヘテロバシディオン・パルティティウイルス 15
- ロゼリニア・ネカトリクス・パルティティウイルス2
- ソラマメ潜在性ウイルス
- シロツメクサ潜在性ウイルス 1
ベータパルティウイルス
- アトキンソンネラ・ハイポキシロンウイルス
- 大麻の謎のウイルス
- セラトシスティス・レシニフェラウイルス1
- クリムゾンクローバー クリプティックウイルス 2
- ディル クリプティック ウイルス 2
- フザリウムポアエウイルス1
- ヘテロバシディオン・パルティティウイルス2
- ヘテロバシディオン・パルティティウイルス 7
- ヘテロバシディオン・パルティティウイルス8
- ヘテロバシディオン・パルティティウイルスP
- ホップトレフォイル潜在性ウイルス 2
- ヒラタケウイルス1
- プリムラマラコイデスウイルス1
- レッドクローバー潜在性ウイルス 2
- リゾクトニア・ソラニウイルス717
- ロゼリニア・ネカトリクスウイルス1
- シロツメクサ潜在性ウイルス 2
デルタパルティウイルス
- ビートクリプティックウイルス2
- ビート潜在性ウイルス 3
- イチジクの潜在性ウイルス
- ペッパークリプティックウイルス1
- ペッパークリプティックウイルス2
ガンマパルチチウイルス
- アスペルギルス・オクラセウスウイルス
- ディスキュラ・デストラクティバウイルス1
- ディスキュラ・デストラクティバウイルス2
- フザリウムソラニウイルス1
- グレメニエラ・アビエティナ RNA ウイルス MS1
- オフィオストマ・パルティティウイルス1
- ペニシリウム・ストロニフェルムウイルスF
- ペニシリウム ストロニフェルム ウイルス S
属に割り当てられていない:
- アガリクスビスポラスウイルス4
- アルファルファ潜在性ウイルス 1
- カーネーション潜在性ウイルス 1
- ニンジン温帯ウイルス1
- ニンジン温帯ウイルス2
- ニンジン温帯ウイルス3
- ニンジン温帯ウイルス4
- ガウマノミセス グラミニス ウイルス 0196A
- ガウマノミセス グラミニス ウイルス T1A
- ホップトレフォイル潜在性ウイルス 1
- ホップトレフォイル潜在性ウイルス 3
- 大根黄化ウイルス
- ライグラス潜在性ウイルス
- ほうれん草温帯ウイルス
- シロツメクサ潜在性ウイルス 3
参考文献
- ^ Tang, J.; Pan, J.; Havens, WM; Ochoa, WF; Guu, TSY; Ghabrial, SA ; Nibert, ML; Tao, YJ; Baker, TS (2010). 「電子線クライオ顕微鏡法とホモロジーモデリングによるパルティティウイルスカプシドタンパク質のバックボーントレース」。Biophysical Journal . 99 (2): 685–694. Bibcode :2010BpJ....99..685T. doi : 10.1016/j.bpj.2010.04.058. PMC 2905076. PMID 20643089.
- ^ ヴァイニオ、EJ;千葉、S;ガブリアル、SA;メイス、E;ルーシンク、M;サバナゾビッチ、S;鈴木直也謝、J;ニベール、M; ICTV レポート、コンソーシアム (2018 年 1 月)。 「ICTV ウイルス分類プロファイル: パルティウイルス科」。一般ウイルス学ジャーナル。99 (1): 17-18。土井：10.1099/jgv.0.000985。PMC 5882087。PMID 29214972。
- ^ ネリ・U、ウルフ・YI、ルー・S、カマルゴAP、カズラウスカスD、ミン・チェンI、リー・B、イワノバ・N、アレン・LZ、パエズ・エスピノ・D、ブライアント・DA、バーヤ・D、クルポビッチ・M、ドルジャ・VV、キルピデスNC、クーニンEV、ゴフナU（2022年2月17日）。 「グローバルなRNAバイロームの5倍の拡大により、RNAバクテリオファージの複数の新しいクレードが明らかになりました。」bioRxiv 10.1101/2022.02.15.480533。
- ^ abcde "ICTV オンラインレポート パルティウイルス科".
- ^ ab 「ウイルス分類：2020年リリース」。国際ウイルス分類委員会（ICTV）。2021年3月。 2021年5月20日閲覧。
- ^ abc 「Viral Zone」。ExPASy 。 2015年6月15日閲覧。
- ^ Nibert ML、Woods KM、Upton SJ、Ghabrial SA (2009) クリスポウイルス: パルティティウイルス科の原生動物ウイルスの新属。アーチ ヴィロル 154(12):1959–1965
- ^ Liu H, Fu Y, Xie J, Cheng J, Ghabrial SA, Li G, Yi X, Jiang D (2012) In Silico クローニングによる新規 dsRNA ウイルス配列の発見とウイルスの多様性、宿主域、進化への影響。PLoS One。2012;7(7):e42147。
外部リンク
- ICTVオンラインレポート: パルティティウイルス科
- ウイルスゾーン: パルティティウイルス科