ＰＲＤＭ２

ＰＲＤＭ２
利用可能な構造
ＰＤＢ	ヒト UniProt 検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	2JV0、2QPW
識別子
エイリアス	PRDM2、HUMHOXY1、KMT8、MTB-ZF、RIZ、RIZ1、RIZ2、PRドメイン2、PR/SETドメイン2、KMT8A
外部ID	オミム：601196; MGI : 107628;ホモロジーン: 40822;ジーンカード：PRDM2; OMA :PRDM2 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体1（ヒト）
終わり	13,825,079 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体4（マウス）
終わり	143,212,995 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	腓骨神経; ; 二次卵母細胞; ; 頬粘膜細胞; ; 中側頭回; ; 結腸上皮; ; ブロードマン領域46; ; ブロードマン領域10; ; 正面ポール; ; 骨髄細胞; ; ブロードマン領域23;
	トップの表現
	心室中隔; ; 精母細胞; ; 精子細胞; ; 顆粒球; ; 受精卵; ; 胎児の尾; ; 性器結節; ; 耳小胞; ; 太ももの筋肉; ; 視覚野;
	参照表現データの詳細
	; ; ; ;
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	DNA結合転写因子活性; メチルトランスフェラーゼ活性; トランスフェラーゼ活性; DNA結合; 亜鉛イオン結合; ヒストンリジンNメチルトランスフェラーゼ活性; 金属イオン結合; 核酸結合; RNAポリメラーゼII転写調節領域配列特異的DNA結合; DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的; DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的; クロマチンDNA結合; 配列特異的DNA結合;
細胞成分	核; ゴルジ体;
生物学的プロセス	ヒストンリジンメチル化; メチル化; 転写の調節、DNAテンプレート; 成人の寿命の決定; 転写、DNAテンプレート; RNAポリメラーゼIIによる転写; RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	7799
	110593
	ENSG00000116731
	ENSMUSG00000057637
	Q13029
	該当なし
NM_001007257 ; NM_001135610 ; NM_012231 ; NM_015866 ; NM_001393986;
	NM_001393987 ; NM_001393988
	NM_001081355 ; NM_001256380
	NP_001007258 ; NP_001129082 ; NP_036363 ; NP_056950
	該当なし
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

PRドメインジンクフィンガータンパク質2は、ヒトではPRDM2遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]

関数

この腫瘍抑制遺伝子は、核ヒストン/タンパク質メチルトランスフェラーゼスーパーファミリーのメンバーです。網膜芽細胞腫タンパク質、エストロゲン受容体、およびヘムオキシゲナーゼ-1遺伝子のTPA応答要素（MTE）に結合できるジンクフィンガータンパク質をコードしています。このタンパク質の機能は完全には解明されていませんが、（1）網膜芽細胞腫の神経分化および病因における転写調節に役割を果たす、（2）ヘムオキシゲナーゼ-1遺伝子の転写活性化因子として機能する、（3）エストロゲン作用の特異的エフェクターである可能性があります。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする3つの転写バリアントが見つかっています。^[6]

インタラクション

PRDM2はエストロゲン受容体α ^[7]および網膜芽細胞腫タンパク質^[5]と相互作用することが示されている。

参考文献

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さらに読む

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外部リンク

PRDM2+タンパク質、+ヒト、米国国立医学図書館医学件名表(MeSH)

この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000116731 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000057637 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid7538672-5] Buyse IM、Shao G、Huang S (1995 年 5 月)。「網膜芽細胞腫タンパク質は、アデノウイルス E1A タンパク質とエピトープを共有するジンクフィンガータンパク質 RIZ に結合する」。米国科学アカデミー紀要。92 (10): 4467–71。Bibcode : 1995PNAS ... 92.4467B。doi : 10.1073 / pnas.92.10.4467。PMC 41965。PMID 7538672。

[entrez-6] "Entrez Gene: PRDM2 PRドメイン2を含み、ZNFドメインを含む".

[pmid10706618-7] Abbondanza C, Medici N, Nigro V, Rossi V, Gallo L, Piluso G, Belsito A, Roscigno A, Bontempo P, Puca AA, Molinari AM, Moncharmont B, Puca GA (2000 年 3 月). 「網膜芽細胞腫と相互作用するジンクフィンガータンパク質 RIZ は、エストロゲン作用の下流エフェクターである」。米国科学アカデミー紀要。97 ( 7): 3130–5。doi : 10.1073 / pnas.050015697。PMC 16204。PMID 10706618。