ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| PP2R5C は |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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2IAE、2JAK、2NPP、2NYL、2NYM、3FGA、5JJA |
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| 識別子 |
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| エイリアス | PPP2R5C、B56G、PR61G、タンパク質ホスファターゼ2調節サブユニットB'ガンマ、B56ガンマ |
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| 外部ID | オミム:601645; MGI : 1349475;ホモロジーン: 135298;ジーンカード: PPP2R5C; OMA :PPP2R5C - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 12番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 12 F1|12 60.56 cM | 始める | 110,413,554 bp [2] |
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| 終わり | 110,549,496 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 精子
- 内皮細胞
- 結腸上皮
- 顆粒球
- アキレス腱
- ブロードマン領域23
- 扁桃腺
- C1セグメント
- 直腸
- 心室帯
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| | トップの表現 | - 網膜の神経層
- 房室弁
- 一次視覚野
- 精子細胞
- 上前頭回
- 一次運動野
- 精母細胞
- 帯状回
- 精細管
- 内側背核
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質結合
- タンパク質ホスファターゼ調節活性
- タンパク質ホスファターゼ活性化因子活性
| | 細胞成分 |
- タンパク質ホスファターゼ2A型複合体
- 染色体、セントロメア領域
- 核
- 染色体
- 核質
- ゴルジ体
- 細胞質
| | 生物学的プロセス |
- p53クラスメディエーターによるDNA損傷に対する内因性アポトーシスシグナル伝達経路
- DNA損傷応答、p53クラスメディエーターによるシグナル伝達により細胞周期停止を引き起こす
- シグナル伝達
- 細胞集団増殖の負の調節
- プロテアソームを介したユビキチン依存性タンパク質分解プロセス
- ホスファチジルイノシトール3キナーゼシグナル伝達の調節
- リン酸化タンパク質ホスファターゼ活性の調節
- タンパク質の自己リン酸化の調節
- タンパク質の脱リン酸化
- タンパク質キナーゼBシグナル伝達の負の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_001161725 NM_001161726 NM_002719 NM_178586 NM_178587
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NM_178588 NM_001352912 NM_001352913 NM_001352914 NM_001352915 NM_001352916 |
| NM_001037934 NM_001081457 NM_001081458 NM_001135001 NM_012023
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NM_001364204 NM_001364205 NM_001364206 NM_001364207 NM_001364208 NM_001364209 NM_001364210 NM_001364211 NM_001364212 NM_001364213 NM_001364214 NM_001373949 NM_001373950 NM_001373951 NM_001373952 NM_001373953 NM_001373954 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001155197 NP_001155198 NP_002710 NP_848701 NP_848702
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NP_001339841 NP_001339842 NP_001339843 NP_001339844 NP_001339845 |
| NP_001074926 NP_001074927 NP_001128473 NP_036153 NP_001351133
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NP_001351134 NP_001351135 NP_001351136 NP_001351137 NP_001351138 NP_001351139 NP_001351140 NP_001351141 NP_001351142 NP_001351143 NP_001360878 NP_001360879 NP_001360880 NP_001360881 NP_001360882 NP_001360883 |
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| 場所 (UCSC) | 14 章: 101.76 – 101.93 Mb | 12 章: 110.41 – 110.55 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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セリン/スレオニンタンパク質ホスファターゼ2A 56 kDa調節サブユニットガンマアイソフォームは、ヒトではPPP2R5C遺伝子によってコードされる酵素である。[5] [6]
関数
この遺伝子の産物は、タンパク質ホスファターゼ 2A調節サブユニット B ファミリーに属します。タンパク質ホスファターゼ 2Aは、4 つの主要な Ser/Thr ホスファターゼの 1 つであり、細胞の成長と分裂の負の制御に関与しています。これは、触媒サブユニットと定常調節サブユニットから構成される共通のヘテロマーコア酵素で構成され、さまざまな調節サブユニットと関連しています。B 調節サブユニットは、基質選択性と触媒活性を調節する可能性があります。この遺伝子は、調節サブユニット B56 サブファミリーのガンマアイソフォームをコードします。異なるアイソフォームをコードする選択的スプライシング転写バリアントが特定されています。[6]
インタラクション
PPP2R5CはPPP2R1B [7]、PPP2CA [7] [8] [9]、PPP2R5A [10]と相互作用することが示されている。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000078304 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000017843 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ McCright B、Virshup DM (1995 年 11 月)。「タンパク質ホスファターゼ 2A調節サブユニットの新しいファミリーの同定」。The Journal of Biological Chemistry。270 (44): 26123–8。doi : 10.1074 /jbc.270.44.26123。PMID 7592815。
- ^ ab 「Entrez Gene: PPP2R5C タンパク質ホスファターゼ 2、調節サブユニット B'、ガンマアイソフォーム」。
- ^ ab McCright B、Rivers AM、Audlin S、Virshup DM (1996 年 9 月)。「タンパク質ホスファターゼ 2A (PP2A) 調節サブユニットの B56 ファミリーは、PP2A を核と細胞質の両方に標的とする分化誘導性リン酸化タンパク質をコードします」。The Journal of Biological Chemistry。271 ( 36): 22081–9。doi : 10.1074/jbc.271.36.22081。PMID 8703017。
- ^ 伊藤A、TR片岡、渡辺M、西山K、間崎Y、佐部H、北村Y、野島H (2000年2月)。 「PP2A B56 サブユニットの切断されたアイソフォームは、パキシリンのリン酸化を通じて細胞の運動性を促進します。」EMBO ジャーナル。19 (4): 562–71。土井:10.1093/emboj/19.4.562。PMC 305594。PMID 10675325。
- ^ Goudreault M、D'Ambrosio LM、Kean MJ、Mullin MJ、Larsen BG、Sanchez A、Chaudhry S、Chen GI、Sicheri F、Nesvizhskii AI、Aebersold R、Raught B、Gingras AC (2009 年 1 月)。「PP2A ホスファターゼ高密度相互作用ネットワークにより、大脳海綿状血管腫 3 (CCM3) タンパク質にリンクされた、新しいストリアチン相互作用ホスファターゼおよびキナーゼ複合体が特定されました」。分子および細胞プロテオミクス。8 (1): 157–71。doi : 10.1074/mcp.M800266 - MCP200。PMC 2621004。PMID 18782753。
- ^ Strack S、Ruediger R、Walter G、Dagda RK、Barwacz CA、Cribbs JT (2002 年 6 月)。「タンパク質ホスファターゼ 2A ホロ酵素アセンブリ: B ファミリー調節サブユニットとスキャフォールディング A サブユニット間の接触の特定」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 23): 20750–5。doi : 10.1074/jbc.M202992200。PMID 11929880。
さらに読む
- Le Rouzic E、Benichou S ( 2006)。 「 HIV-1 の Vpr タンパク質: ウイルスのライフサイクルに沿った異なる役割 」。Retrovirology。2 : 11。doi : 10.1186 / 1742-4690-2-11。PMC 554975。PMID 15725353。
- Zhao RY、Elder RT (2005 年 3 月)。「ウイルス感染と細胞周期 G2/M 制御」。 細胞研究。15 ( 3): 143–9。doi : 10.1038/ sj.cr.7290279。PMID 15780175。
- Zhao RY、Bukrinsky M、Elder RT (2005 年 4 月)。「HIV-1 ウイルスタンパク質 R (Vpr) と宿主細胞応答」。インド医学研究ジャーナル。121 (4): 270–86。PMID 15817944 。
- Nomura N, Miyajima N, Sazuka T, Tanaka A, Kawarabayasi Y, Sato S, Nagase T, Seki N, Ishikawa K, Tabata S (1995). 「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。I. ヒト未熟骨髄細胞株 KG-1 からランダムにサンプルした cDNA クローンの分析により推定された 40 個の新しい遺伝子 (KIAA0001-KIAA0040) のコード配列」。DNA研究。1 (1): 27–35。doi : 10.1093 /dnares/ 1.1.27。PMID 7584026 。
- 野村直人、長瀬哲也、宮島直人、佐塚哲也、田中亜人、佐藤真治、関直也、瓦林裕也、石川和人、田端真司 (1995) 「未確認のヒト遺伝子のコード配列の予測。II. ヒト細胞株 KG-1 の cDNA クローンの分析によって推定された 40 個の新しい遺伝子 (KIAA0041 ~ KIAA0080) のコード配列」。DNA 研究。1 (5): 223–9。土井:10.1093/dnares/1.5.223。PMID 7584044。
- 秋山直、島裕、波多野裕、大沢裕、杉村隆、長尾正(1995年6月)。 「2A型プロテインホスファターゼのB調節サブユニットの新規脳特異的アイソフォームであるBRガンマのcDNAクローニング」。欧州生化学ジャーナル。230 (2): 766–72。土井:10.1111/j.1432-1033.1995.tb20619.x。PMID 7607250。
- Tehrani MA、Mumby MC、 Kamibayashi C (1996 年 3 月)。「筋肉で高度に発現する新規タンパク質ホスファターゼ2A調節サブユニットの同定」。The Journal of Biological Chemistry。271 ( 9 ): 5164–70。doi : 10.1074/jbc.271.9.5164。PMID 8617797 。
- Zolnierowicz S、Van Hoof C、Andjelković N、Cron P、Stevens I、Merlevede W、Goris J、Hemmings BA (1996 年 7 月)。「タンパク質ホスファターゼ 2A0 に関連する可変サブユニットは、新しいマルチメンバーの調節サブユニット ファミリーを定義します」。The Biochemical Journal。317 ( Pt 1 ) : 187–94。doi :10.1042/bj3170187。PMC 1217462。PMID 8694763。
- McCright B、Rivers AM、Audlin S、Virshup DM (1996 年 9 月)。「タンパク質ホスファターゼ 2A (PP2A) 調節サブユニットの B56 ファミリーは、PP2A を核と細胞質の両方に標的とする分化誘導性リン酸化タンパク質をコード化します」。The Journal of Biological Chemistry。271 ( 36): 22081–9。doi : 10.1074/jbc.271.36.22081。PMID 8703017。
- McCright B、Brothman AR、Virshup DM (1996 年 8 月)。「筋肉と脳で高度に発現するヒトタンパク質ホスファターゼ 2A 調節サブユニット遺伝子 b56alpha、b56beta、b56gamma、b56delta、および b56epsilon (PPP2R5A-PPP2R5E) の染色体領域 1q41、11q12、3p21、6p21.1、および 7p11.2 --> p12 への割り当て」。Genomics。36 ( 1 ) : 168–70。doi :10.1006/geno.1996.0438。PMID 8812429 。
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- Ruediger R、Brewis N、Ohst K、Walter G (1997 年 11 月)。「PP2A コア酵素とホロ酵素の比率を増やすと、Tat 刺激による HIV-1 転写とウイルス生成が阻害される」。Virology . 238 ( 2): 432–43. doi : 10.1006/viro.1997.8873 . PMID 9400615。
- Scanlan MJ、Gordan JD、Williamson B、Stockert E、Bander NH、Jongeneel V、Gure AO、Jäger D、Jäger E、Knuth A、Chen YT、Old LJ (1999 年 11 月)。「腎細胞癌患者における自己抗体によって認識される抗原」。International Journal of Cancer。83 (4): 456–64。doi : 10.1002 /(SICI) 1097-0215 (19991112)83:4 < 456::AID-IJC4>3.0.CO;2-5。PMID 10508479 。
- 伊藤A、TR片岡、渡辺M、西山K、間崎裕、佐部裕、北村裕、野島裕(2000年2月)。 「PP2A B56 サブユニットの切断されたアイソフォームは、パキシリンのリン酸化を通じて細胞の運動性を促進します。」EMBO ジャーナル。19 (4): 562–71。土井:10.1093/emboj/19.4.562。PMC 305594。PMID 10675325。
- 池田 誠、岸田 正之、松浦 勇、臼井 秀、菊池 明(2000 年 1 月)。「大腸腺腫性ポリポーシス遺伝子産物の GSK-3beta 依存性リン酸化は、β-カテニンおよびタンパク質ホスファターゼ 2A と Axin の複合体によって調節される」。Oncogene . 19 ( 4): 537–45. doi : 10.1038/sj.onc.1203359 . PMID 10698523。
- Elder RT、Yu M、Chen M、Zhu X、Yanagida M、Zhao Y (2001 年 9 月)。「HIV-1 Vpr は、PP2A の調節サブユニットと触媒サブユニットを介し、Wee1 と Cdc25 の両方に作用して分裂酵母 (Schizosaccharomyces pombe) の細胞周期 G2 停止を誘導する」。Virology . 287 ( 2): 359–70. doi : 10.1006/viro.2001.1007 . PMID 11531413。
- Muneer S、Ramalingam V、Wyatt R、Schultz RA、Minna JD、Kamibayashi C (2002 年 3 月)。「PP2A B56gamma 調節サブユニットをコードする遺伝子のゲノム構成とマッピング」。Genomics . 79 ( 3): 344–8. doi :10.1006/geno.2002.6721. PMID 11863364。
- Strack S、Ruediger R、Walter G、Dagda RK、Barwacz CA、Cribbs JT (2002 年 6 月)。「タンパク質ホスファターゼ 2A ホロ酵素アセンブリ: B ファミリー調節サブユニットとスキャフォールディング A サブユニット間の接触の特定」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 23): 20750–5。doi : 10.1074/jbc.M202992200。PMID 11929880。