ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| PDGFD |
|---|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | PDGFD、IEGF、SCDGF-B、SCDFB、MSTP036、血小板由来成長因子D |
|---|
| 外部ID | OMIM : 609673; MGI : 1919035; HomoloGene : 11875; GeneCards : PDGFD; OMA :PDGFD - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置(マウス) |
|---|
 | | クロ。 | 9番染色体(マウス)[2] |
|---|
| | バンド | 9|9 A1 | 始める | 6,168,584 bp [2] |
|---|
| 終わり | 6,378,850 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
|---|
| トップの表現 | - 歯周繊維
- 胚上皮
- 精嚢
- 副腎皮質
- 心室帯
- 左副腎皮質
- 滑膜関節
- 右副腎皮質
- 胸部大動脈下行
- 上行大動脈
|
| | トップの表現 | - 心室中隔
- 上行大動脈
- 顔面運動核
- 脈絡叢上皮
- 大動脈弁
- 大腿骨体
- 頭蓋冠
- 虹彩
- 前庭感覚上皮
- 脊髄前角
|
| | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 | | | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- トランスフォーミング成長因子ベータ刺激に対する細胞反応
- 平滑筋細胞の走化性の正の調節
- MAPキナーゼ活性の正の調節
- 線維芽細胞増殖の正の調節
- 細胞移動の正の調節
- 血小板由来成長因子刺激に対する細胞反応
- 多細胞生物の発達
- 単球血管外漏出の正の調節
- タンパク質の自己リン酸化の正の制御
- 細胞集団増殖の正の調節
- ERK1およびERK2カスケードの正の制御
- アミノ酸刺激に対する細胞反応
- ホスファチジルイノシトール3キナーゼシグナル伝達の正の調節
- 血小板由来成長因子受容体シグナル伝達経路
- 糸球体メサンギウム細胞増殖の正の調節
- 細胞分裂の積極的な制御
- 平滑筋細胞の増殖の正の調節
- 過酸化水素に対する細胞反応
- ペプチジルチロシンリン酸化の調節
- 血液凝固
- シグナル伝達受容体の活性の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
| オルソログ |
|---|
| 種 | 人間 | ねずみ |
|---|
| エントレズ | | |
|---|
| アンサンブル | | |
|---|
| ユニプロット | | |
|---|
| RefSeq (mRNA) | | |
|---|
NM_027924 NM_001357397 NM_001357398 |
|
|---|
| RefSeq (タンパク質) | | |
|---|
NP_082200 NP_001344326 NP_001344327 |
|
|---|
| 場所 (UCSC) | 11 章: 103.91 – 104.16 Mb | 9 章: 6.17 – 6.38 Mb |
|---|
| PubMed検索 | [3] | [4] |
|---|
|
| ウィキデータ |
|
血小板由来成長因子Dは、ヒトではPDGFD遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、血小板由来成長因子ファミリーのメンバーです。このファミリーの 4 つのメンバーは、間葉系起源の細胞の分裂促進因子であり、8 つのシステインからなるコアモチーフを特徴としており、そのうち 7 つがこの因子に含まれています。この遺伝子産物はホモ二量体のみを形成するため、他の 3 つのファミリー メンバーとは二量体を形成しません。このファミリーのアルファ メンバーおよびベータ メンバーと異なるのは、CUB ドメインという珍しいN 末端ドメインを持つ点です。この遺伝子には 2 つのスプライス バリアントが特定されています。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000170962 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000032006 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 浜田T、Ui-Tei K、今木J、宮田Y (2001年2月)。 「SCDGF/PDGF-C/ファロテインに相同な新規増殖因子であるSCDGF-Bの分子クローニング」。Biochem Biophys Res Commun。280 (3): 733–7。土井:10.1006/bbrc.2000.4187。PMID 11162582。
- ^ LaRochelle WJ、Jeffers M、Corvalan JR、Jia XC、Feng X、Vanegas S、Vickroy JD、Yang XD、Chen F、Gazit G、Mayotte J、Macaluso J、Rittman B、Wu F、Dhanabal M、Herrmann J、Lichenstein HS (2002 年 4 月)。「血小板由来成長因子 D: マウスにおける腫瘍形成能とヒト癌における調節不全の発現」。Cancer Res . 62 (9): 2468–73. PMID 11980634。
- ^ ab 「Entrez Gene: PDGFD 血小板由来成長因子D」。
さらに読む
- Bergsten E、Uutela M、Li X、et al. (2001)。「PDGF-D は PDGF ベータ受容体に対する特異的なプロテアーゼ活性化リガンドである」。Nat . Cell Biol . 3 (5): 512–6. doi :10.1038/35074588. PMID 11331881. S2CID 25074372.
- LaRochelle WJ、Jeffers M、McDonald WF、他 (2001)。「PDGF-D、新しいプロテアーゼ活性化成長因子」。Nat . Cell Biol . 3 (5): 517–21. doi :10.1038/35074593. PMID 11331882. S2CID 19633551.
- Uutela M、Laurén J、 Bergsten E 、 et al. (2001) 。「ヒトPDGFCおよびPDGFC遺伝子の染色体位置、エクソン構造、血管発現パターン」。Circulation。103 ( 18 ) : 2242–7。doi : 10.1161/01.cir.103.18.2242。PMID 11342471。
- Wistow G、Bernstein SL、Ray S、他 (2002)。「NEIBank プロジェクトのための成人ヒト虹彩の発現配列タグ分析: ステロイド反応因子および網膜色素上皮との類似点」。Mol . Vis . 8 : 185–95。PMID 12107412 。
- Changsirikulchai S、Hudkins KL、Goodpaster TA、他 (2003)。「発達中および成熟ヒト腎臓における血小板由来成長因子-Dの発現」。Kidney Int . 62 (6): 2043–54. doi : 10.1046/j.1523-1755.2002.00662.x . PMID 12427128。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Clark HF、Gurney AL、Abaya E、他 (2003)。「分泌タンパク質発見イニシアチブ (SPDI)、新規ヒト分泌タンパク質および膜貫通タンパク質を同定するための大規模な取り組み: バイオインフォマティクス評価」。Genome Res . 13 (10): 2265–70. doi :10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309 。
- Taneda S、Hudkins KL、Topouzis S、他 (2004)。「マウスとヒトの閉塞性尿路疾患:尿細管間質障害の進行におけるPDGF-Dの潜在的役割」。J. Am. Soc. Nephrol . 14 (10): 2544–55. doi : 10.1097/01.ASN.0000089828.73014.C8 . PMID 14514732。
- Uutela M、Wirzenius M、Paavonen K、他 (2004)。「PDGF-D は血管新生中にマクロファージの動員、間質圧の上昇、血管の成熟を誘導する」。Blood . 104 ( 10): 3198–204. doi : 10.1182/blood-2004-04-1485 . PMID 15271796。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Ray S、Gao C、Wyatt K、他 (2005)。「血小板由来成長因子D、眼における組織特異的発現、および水晶体上皮細胞増殖の制御における重要な役割」。J . Biol. Chem . 280 (9): 8494–502. doi : 10.1074/jbc.M413570200 . PMID 15611105。
- Ustach CV、Kim HR (2005)。「前立腺癌細胞において血小板由来成長因子Dはウロキナーゼプラスミノーゲン活性化因子によって活性化される」。Mol . Cell. Biol . 25 (14): 6279–88. doi :10.1128/MCB.25.14.6279-6288.2005. PMC 1168822. PMID 15988036 。
- Liu MY、Eyries M、Zhang C、他 (2006)。「アンジオテンシン II および過酸化水素による誘導性血小板由来成長因子 D 鎖発現には、Ets-1 および Sp1 による転写調節が関与している」。Blood . 107 ( 6): 2322–9. doi : 10.1182/blood-2005-06-2377 . PMID 16189269。