ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ノヴァ1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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1DT4、2ANN、2ANR |
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| 識別子 |
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| エイリアス | NOVA1、Nova-1、NOVA 選択的スプライシング制御因子 1 |
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| 外部ID | オミム:602157; MGI : 104297;ホモロジーン: 21296;ジーンカード:NOVA1; OMA :NOVA1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 12番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 12 B3|12 21.46 cM | 始める | 46,694,517 bp [2] |
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| 終わり | 46,818,929 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 小脳
- 小脳半球
- C1セグメント
- 視床下部
- 小脳の傍小葉
- ブロードマン領域46
- 小脳の右半球
- 前頭前皮質
- ポンス
- 滑膜関節
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| | トップの表現 | - 脊髄の腰椎部分
- 視床下部背内側核
- 外側視床下部
- 中脳の中心灰白質
- 視床下部室傍核
- 内側前庭核
- 小脳皮質
- 上丘
- 深部小脳核
- 下丘
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 核酸結合
- mRNA結合
- RNA結合
- タンパク質結合
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- スプライソソームを介したmRNAスプライシング
- RNA処理
- 運動行動
- RNAスプライシング
- RNA代謝プロセスの調節
- 化学シナプス伝達
- 寒冷誘発性熱産生の負の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_002515 NM_006489 NM_006491 |
| NM_021361 NM_001364634 NM_001364635 NM_001364636 NM_001364637
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NM_001364638 NM_001364639 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_002506 NP_006480 NP_006482 NP_001353319 NP_001353320
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NP_001353321 NP_001353322 NP_001353323 NP_001353324 NP_001353325 NP_001353326 NP_001353327 |
| NP_067336 NP_001351563 NP_001351564 NP_001351565 NP_001351566
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NP_001351567 NP_001351568 |
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| 場所 (UCSC) | 14章: 26.44 – 26.6 Mb | 12 章: 46.69 – 46.82 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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RNA結合タンパク質Nova-1は、ヒトではNOVA1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子は、ニューロン特異的RNA結合タンパク質をコードしており、腫瘍随伴性疾患抗原のNovaファミリーのメンバーであり、腫瘍随伴性抗体によって認識され、阻害される。これらの抗体は、腫瘍随伴性眼球クローヌス運動失調症、乳がん、小細胞肺がんの患者の血清中に見られる。異なるアイソフォームをコードする選択的スプライシング転写産物が報告されている。[6]ネアンデルタール人とデニソワ人の両方に1つのバージョンがあり、ほぼすべての現代人は別のバージョンを持っていたことから、正の選択が示唆されている。神経腫瘍学的腹側抗原1(NOVA1)遺伝子のネアンデルタール人遺伝子変異体をヒト皮質オルガノイドに挿入すると、脳モデルの発達が遅くなり、表面の複雑性が高まる可能性があるが、[7]これはCRISPRの副作用によるアーティファクトである可能性があり、[8] [9]その後の研究では再現できなかった。[10]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000139910 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000021047 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Buckanovich RJ、Yang YY、Darnell RB (1996 年 2 月)。「腫瘍神経抗原 Nova-1 はニューロン特異的 RNA 結合タンパク質であり、その活性は腫瘍随伴抗体によって阻害される」。J Neurosci . 16 (3): 1114–22. doi :10.1523/JNEUROSCI.16-03-01114.1996. PMC 6578795. PMID 8558240 。
- ^ ab 「Entrez Gene: NOVA1 神経腫瘍腹側抗原 1」。
- ^ 「ネアンデルタール人の遺伝子変異がヒト脳オルガノイドの神経発達を変化させる」2021年2月11日。
- ^ マリチッチ T、ヘルムブレヒト N、リーゼンベルク S、マカク D、カニス P、ラックナー M、プガッハ=マトベーエワ AD、ペーボ S (2021-10-15)。 「皮質オルガノイドにおけるNOVA1の古風変異体の再導入は神経発達を変化させる」についてのコメント。科学。374 (6565): eabi6060。土井:10.1126/science.abi6060。ISSN 0036-8075。PMID 34648345。S2CID 238990790 。
- ^ Herai RH、Szeto RA、 Trujillo CA、Muotri AR (2021-10-15)。「NOVA1の古風な変異体を皮質オルガノイドに再導入すると神経発達が変化する」に対するコメントへの回答。Science。374 ( 6565 ) : eabi9881。doi : 10.1126/science.abi9881。ISSN 0036-8075。PMID 34648331。S2CID 238990560 。
- ^ Riesenberg S, Kanis P, Macak D, Wollny D, Düsterhöft D, Kowalewski J, Helmbrecht N, Maricic T, Pääbo S (2023-07-20). 「HDRobustによる効率的で高精度な相同組換え修復依存ゲノム編集」. Nature Methods . 20 (9): 1388–1399. doi : 10.1038/s41592-023-01949-1 . ISSN 1548-7091. PMC 10482697. PMID 37474806 .
さらに読む
- Buckanovich RJ、Posner JB、Darnell RB (1993)。「腫瘍随伴性 Ri 抗原であるNova は RNA 結合タンパク質と相同性があり、発達中の運動系で特異的に発現する」。Neuron . 11 (4): 657–72. doi :10.1016/0896-6273(93)90077-5. PMID 8398153. S2CID 22554933.
- Buckanovich RJ、Darnell RB (1997)。「ニューロンRNA結合タンパク質Nova-1は、in vitroおよびin vivoで特定のRNAターゲットを認識する」。Mol . Cell. Biol . 17 (6): 3194–201. doi :10.1128/MCB.17.6.3194. PMC 232172. PMID 9154818 。
- Lewis HA、Chen H、Edo C 、 et al. (1999)。「Nova-1 および Nova-2 K 相同 RNA 結合ドメインの結晶構造」。構造。7 ( 2): 191–203。doi : 10.1016/S0969-2126(99) 80025-2。PMID 10368286。
- Jensen KB、Dredge BK、Stefani G、et al. (2000)。「Nova-1はニューロン特異的な選択的スプライシングを制御し、ニューロンの生存に必須である」。Neuron . 25 (2): 359–71. doi : 10.1016/S0896-6273(00)80900-9 . PMID 10719891。
- Dias Neto E、Correa RG、Verjovski-Almeida S、他 (2000)。「ORF 発現配列タグによるヒトトランスクリプトームのショットガン シーケンシング」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 97 ( 7 ): 3491–6。Bibcode : 2000PNAS ...97.3491D。doi : 10.1073/ pnas.97.7.3491。PMC 16267。PMID 10737800。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Dredge BK、Darnell RB (2003)。「Nova は、遠位下流の UCAU に富むイントロンスプライシングエンハンサーを介して GABA(A) 受容体ガンマ 2 の選択的スプライシングを制御する」。Mol . Cell. Biol . 23 (13): 4687–700. doi :10.1128/MCB.23.13.4687-4700.2003. PMC 164843. PMID 12808107 。
- Brandenberger R、Wei H、Zhang S、他 (2005)。「トランスクリプトーム特性評価により、ヒト ES 細胞の成長と分化を制御するシグナル伝達ネットワークが解明」Nat. Biotechnol . 22 (6): 707–16. doi :10.1038/nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Ule J、Ule A、Spencer J、et al. (2005)。「Nova は脳特異的スプライシングを制御してシナプスを形成する」。Nat . Genet . 37 (8): 844–52. doi :10.1038/ng1610. PMID 16041372. S2CID 8446567。
- Lim J、Hao T、Shaw C、他 (2006)。「ヒト遺伝性運動失調症およびプルキンエ細胞変性症のタンパク質間相互作用ネットワーク」。Cell . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569。