ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| 56 位 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | NOP56、NOL5A、SCA36、NOP56リボ核タンパク質 |
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| 外部ID | オミム:614154; MGI : 1914384;ホモロジーン:4660;ジーンカード:NOP56; OMA :NOP56 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体2(マウス)[2] |
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| | バンド | 2|2 F1 | 始める | 130,116,350 bp [2] |
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| 終わり | 130,121,233 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 顆粒球
- 小脳の右半球
- 膵臓の体
- 右子宮管
- 右卵巣
- 左子宮管
- 左卵巣
- リンパ節
- 下垂体前葉
- 心室帯
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| | トップの表現 | - 胎児の尾
- 性器結節
- 胚葉上層
- 胚盤胞
- 心室帯
- 胚
- 胚
- 神経管
- 胸腺
- 桑実胚
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ヒストンメチルトランスフェラーゼ結合
- タンパク質結合
- snoRNA結合
- RNA結合
- カドヘリン結合
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- ボックス C/D RNP 複合体
- sno(s)RNA含有リボ核タンパク質複合体
- 小サブユニットプロセソーム
- プレsnoRNP複合体
- 膜
- 核
- 核質
- 原線維中心
- 核小体
| | 生物学的プロセス | | | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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核小体タンパク質56は、ヒトではNOP56遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
Nop56pは酵母核小体タンパク質であり、核小体タンパク質Nop58pおよびフィブリラリンとの複合体の一部である。Nop56pは60Sリボソームサブユニットの組み立てに必要であり、プレrRNAの処理に関与している。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、配列がNop56pに類似しており、核小体にも見られる。この遺伝子には、いくつかの異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントが見つかっているが、そのほとんどは全長が決定されていない。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000101361 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000027405 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Gautier T、Berges T、Tollervey D、他 (1997 年 12 月)。「核小体の KKE/D 反復タンパク質 Nop56p および Nop58p は Nop1p と相互作用し、リボソーム生合成に必要である」。Mol Cell Biol . 17 (12): 7088–98. doi :10.1128/MCB.17.12.7088. PMC 232565. PMID 9372940 。
- ^ ab "Entrez Gene: NOL5A 核小体タンパク質 5A (56kDa、KKE/D リピートあり)"。
さらに読む
- Deloukas P、Matthews LH 、 Ashurst J、他 (2002)。「ヒト染色体20のDNA配列と比較分析」。Nature 414 ( 6866 ): 865–71。Bibcode :2001Natur.414..865D。doi : 10.1038 /414865a。PMID 11780052。
- Andersen JS、Lyon CE、Fox AH、et al. (2002)。「ヒト核小体の指向性プロテオーム解析」。Curr . Biol . 12 ( 1 ) : 1–11。Bibcode :2002CBio...12....1A。doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9。PMID 11790298。S2CID 14132033。
- Watkins NJ、Dickmanns A、Lührmann R (2003)。「ボックス C/D モチーフの保存されたステム II は核小体の局在に必須であり、15.5K タンパク質とともにボックス C/D snoRNP の階層的アセンブリに必要である」。Mol . Cell. Biol . 22 (23): 8342–52. doi :10.1128/MCB.22.23.8342-8352.2002. PMC 134055. PMID 12417735 。
- Scherl A, Couté Y, Déon C, et al. (2003). 「ヒト核小体の機能的プロテオーム解析」Mol. Biol. Cell . 13 (11): 4100–9. doi :10.1091/mbc.E02-05-0271. PMC 133617 . PMID 12429849.
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Hayano T, Yanagida M, Yamauchi Y, et al. (2003). 「ヒト Nop56p 関連プレリボソームリボ核タンパク質複合体のプロテオーム解析。Nop56p とトリーチャーコリンズ症候群の原因となる核小体タンパク質糖鎖との関連の可能性」J. Biol. Chem . 278 (36): 34309–19. doi : 10.1074/jbc.M304304200 . PMID 12777385.
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Hassel S、Eichner A、 Yakymovych M、他 (2004)。「II 型骨形成タンパク質受容体 (BMPR-II) に関連し、2 次元ゲル電気泳動および質量分析によって同定されたタンパク質」。 プロテオミクス。4 ( 5): 1346–58。doi : 10.1002 / pmic.200300770。PMID 15188402。S2CID 6773754。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Watkins NJ、Lemm I、Ingelfinger D、et al. (2005)。「大きな動的多タンパク質複合体の核質における U3 snoRNP の組み立てと成熟」。Mol . Cell . 16 (5): 789–98. doi :10.1016/j.molcel.2004.11.012. hdl : 11858/00-001M-0000-0012-EB89-8 . PMID 15574333。
- Andersen JS 、Lam YW、Leung AK 、他 (2005)。「核小体プロテオームダイナミクス」。Nature . 433 ( 7021 ): 77–83。Bibcode :2005Natur.433...77A。doi : 10.1038/nature03207。PMID 15635413。S2CID 4344740。
- Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, et al. (2006). 「ヒト有糸分裂紡錘体のリン酸化プロテオーム解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 103 (14): 5391–6. Bibcode :2006PNAS..103.5391N. doi : 10.1073/pnas.0507066103 . PMC 1459365 . PMID 16565220.
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、et al. (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。