NCI -60癌細胞株パネルは、国立癌研究所(NCI)が潜在的な抗癌活性を検出する化合物のスクリーニングに使用する60種のヒト癌細胞株のグループです。 [1]
目的
このスクリーニング手順はNCI-60ヒト腫瘍細胞株スクリーニングと呼ばれ、 NCIの開発治療プログラム(DTP)の発見および開発サービスの1つです。 [2] [3] [4] 各細胞株のスクリーニング率は、試験物質の細胞増殖抑制効果と細胞毒性効果を示しています。[2]
細胞株の多様性により、試験化合物をその効果パターンで比較することが可能であり、高い相関関係は潜在的に同様の効果メカニズムに対応している。[2] COMPAREツールは 、88,000以上の純粋化合物と34,000以上の粗抽出物(2017年1月6日現在[アップデート])のデータベースとの自動比較を提供し、特定の試験物質に対するピアソン相関係数でランク付けされた物質のリストを表示する。 [5]
同じパネルが分子標的プログラムで分子標的の特性評価に使用されています。測定にはタンパク質レベル、RNA測定、変異状態、酵素活性レベルが含まれます。[6]
細胞株
このパネルには、白血病、黒色腫、非小細胞肺癌、脳癌、卵巣癌、乳癌、大腸癌、腎臓癌、前立腺癌を代表する細胞株が含まれています。[1] [2]
スクリーニングプログラムで使用するために13の追加細胞株が評価されており、そのうち2つの細胞株はこれまで代表されていなかった小細胞肺癌由来のものである。[1]
1つを除くすべての細胞株(2017年1月6日現在[アップデート])は、追加の細胞株を含め、他の研究室でも利用可能です。[1]
誤認と誤分類
2000年代初頭から、いくつかの細胞株が調査時またはそれ以前に誤って識別または誤分類されていたことが判明した。[7] [8] [9]
MDA-MB-435は、もともと乳がん細胞株として分類されていましたが、黒色腫細胞株であることが判明しました。[7] さらに調査したところ、現在のMDA-MB-435は細胞株M14と同じ個体に由来していることが判明しました。[7] クローンの検査により、M14との混同はMDA-MB-435の歴史の非常に初期、開発治療プログラムに確立される前に起こったことが明らかになりました。[7]
NCI/ADR-RESは、もともと乳がん細胞株として分類されていましたが、卵巣腫瘍細胞株であることが確認されました。[8] NCI/ADR-RESは、ある時点で細胞株OVCAR-8から派生したものと思われます。[8]もともとこの細胞株はMCF-7/ADR-RES と名付けられていましたが、分類の変更に合わせて改名されました。[8]
2つの脳腫瘍細胞株、SNB-19とU251は同一人物から採取されたものであることが判明した。[9] これにより、混同が起こる可能性が高い。
61番目の細胞株であるMDA-Nは、誤分類されたMDA-MB-435細胞株から派生したものであることが確認されている。[7] したがって、これも誤分類されており、実際には黒色腫細胞株であるが、2018年1月6日現在、[アップデート]公式ウェブサイトでは依然として乳がん細胞株として記載されている。[1] この細胞株は2018年1月6日現在入手できない[アップデート]。[1]
国際細胞株認証委員会は汚染細胞株のリストを維持している。[10] このリストには上記で報告された細胞株が含まれているが、報告日や記事はそれぞれの細胞株に関して具体的な懸念を引き起こした最初の日付や記事よりもかなり後になっていることが多い。[10] [7] [8] [9]
誤った分類の継続使用
2014年現在、[アップデート]MDA-MB-435は2007年に正式に黒色腫細胞株であると宣言された後も、また最高評価の国際査読ジャーナルでも、何百もの研究で乳がんのモデルとして使用されています。[11] 他の誤認細胞株についても同様です。[11]
NCI-60 細胞株のリスト
追加細胞株のリスト
参考文献
- ^ abcdefgh 「インビトロスクリーニングにおける細胞株」。開発治療プログラム。国立がん研究所。2015年5月8日。 2018年1月6日閲覧。
- ^ abcd 「NCI-60ヒト腫瘍細胞株スクリーン」。開発治療プログラム。国立がん研究所。2015年8月26日。 2018年1月6日閲覧。
- ^ 「Discovery & Development Services」。開発治療プログラム。国立がん研究所。2015年8月26日。 2018年1月6日閲覧。
- ^ 「開発治療プログラムへようこそ」。開発治療プログラム。国立がん研究所。 2018年1月6日閲覧。
- ^ 「COMPARE分析」。開発治療プログラム。国立がん研究所。2015年8月11日。 2018年1月6日閲覧。
- ^ 「分子標的」。開発治療プログラム。国立がん研究所。2015年5月12日。 2018年1月7日閲覧。
- ^ abcdef 「MDA-MB-435とその派生MDA-Nはメラノーマ細胞株であり、乳がん細胞株ではない」。開発治療プログラム。国立がん研究所。2015年5月8日。 2018年1月6日閲覧。
- ^ abcde 「細胞株 NCI/ADR-RES は卵巣腫瘍細胞株であり、乳がん細胞株ではありません」。開発治療プログラム。国立がん研究所。2015 年 5 月 8 日。2018年1 月 6 日閲覧。
- ^ abc 「CNS細胞株SNB-19とU251は同一個体由来」。開発治療プログラム。国立がん研究所。2015年5月8日。 2018年1月6日閲覧。
- ^ ab 交差汚染または誤認細胞株データベース(PDF)、8.0、国際細胞株認証委員会 (ICLAC)、2016年12月1日、 2018年1月6日閲覧
- ^ ab Prasad, Vidudala VTS; Gopalan, Ramprasad OG (2015 年 6 月 2 日)。「2014 年現在も、メラノーマ細胞株 MDA-MB-435 をヒト乳がんのモデルとして継続使用」 。npj Breast Cancer。1 : 15002 – 。doi :10.1038/npjbcancer.2015.2。PMC 5515196。PMID 28721362。
- ^ ab 「Cellosaurus 検索結果: 「NCI60 がん細胞株パネル」で 61 件ヒット」。Cellosaurus。スイスバイオインフォマティクス研究所。2018年1 月 7 日閲覧。 参照には、検索結果にリンクされたページのリストが含まれます。
- ^ 「Cellosaurus - 細胞株に関する知識リソース」Cellosaurus .スイスバイオインフォマティクス研究所. 2018年1月17日閲覧。 参照には、追加細胞株リストに記載されているそれぞれの細胞株名で検索して見つかったページが含まれます。
