ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ナビ2 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | ヒト UniProt 検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | NAV2、HELAD1、POMFIL2、RAINB1、STEERIN2、UNC53H2、ニューロンナビゲーター2 |
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| 外部ID | オミム:607026; MGI : 2183691;ホモロジーン: 52330;ジーンカード:NAV2; OMA :NAV2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体7(マウス)[2] |
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| | バンド | 7|7 B4 | 始める | 48,908,716 bp [2] |
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| 終わり | 49,610,090 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 軟骨組織
- 精巣上体の尾
- 精巣上体
- 臓側胸膜
- 内淡蒼球
- 気管支上皮細胞
- 精巣上体頭部
- 卵母細胞
- 乳腺上皮
- 延髄
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| | トップの表現 | - 受精卵
- 上行大動脈
- 粒状層
- 大動脈弁
- 左心室の心筋組織
- 二次卵母細胞
- 第四脳室脈絡叢
- 外眼筋
- 足底筋
- 長趾伸筋
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ヌクレオチド結合
- ヘパリン結合
- タンパク質結合
- ATP結合
- 加水分解酵素活性
- ヘリカーゼ活性
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 迷走神経の発達
- 嗅覚の知覚
- 舌咽神経の発達
- 圧受容器フィードバックによる全身動脈血圧の調節
- 聴覚
- 運動行動
- 視神経の発達
- 神経系の発達
- 神経新生
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001111018 NM_001111019 NM_001244963 NM_145117 NM_182964 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001104488 NP_001104489 NP_001231892 NP_660093 NP_892009 |
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| 場所 (UCSC) | 11章: 19.35 – 20.12 Mb | 7 章: 48.91 – 49.61 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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ニューロンナビゲーター2は、ヒトではNAV2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]ビタミンA代謝物であるオールトランスレチノイン酸(atRA)は、神経突起の伸展を含む神経細胞の発達に重要な役割を果たしている。NAV2はatRA応答性遺伝子である。[7]
ニューロンナビゲーターは、細胞の成長と移動にも役割を果たしていると理論化されています。[8]さらに、この遺伝子にはさまざまなアイソフォームバリアントが発見されています。 Nav2 は、人間の神経認知障害であるアルツハイマー病や加齢に伴う表現型と関連していると考えられています。 Nav2 の今後の研究は、この疾患の病態生理学と関連する表現型を理解する上で重要な情報を提供する可能性があると議論されています。[9]
NAV2協会
脳で広く発現し、神経系の発達に重要なNAV2遺伝子は、アルツハイマー病に何らかの役割を果たしている可能性がある。[10]アルツハイマー病は慢性の神経疾患で、65歳に達すると有病率が急激に上昇する。報告によると、アルツハイマー病は米国における死亡原因のトップ10に数えられている。ニューロンナビゲーター2(NAV2)遺伝子には、50のイントロンと38のエクソンがある。[10] NAV2遺伝子は、脳のほか、腎臓、肝臓、甲状腺、乳腺、脊髄で強く発現していることが示された(細胞増殖、移動、神経系の発達に関与している可能性がある)。[10] NAV2は最近、アルツハイマー病患者のエピソード記憶スコアに関連付けられている。現在まで、NAV2遺伝子とアルツハイマー病のリスクまたはAAOとの関連を調査した研究はない。[10]この研究によると、NAV2は血圧、心血管疾患、神経変性疾患を結びつけるプロセスの1つである可能性がある。別の遺伝子発現解析では、NAV2がヒトの大腸がんにおいて過剰発現していることが判明しており、大腸がんの予測バイオマーカーとしてだけでなく、治療標的としても使用できる可能性があることを示唆している。しかし、実施された研究にはいくつかの限界がある可能性があるため、NAV2の目的を適切に理解するにはさらなる研究が必要である。[10]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000166833 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000052512 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Maes T、Barcelo A、Buesa C (2002 年 6 月)。「ニューロンナビゲーター: Caenorhabditis elegans の細胞誘導遺伝子である unc-53 と相同性を持つヒト遺伝子ファミリー」。Genomics . 80 ( 1): 21–30. doi :10.1006/geno.2002.6799. PMID 12079279。
- ^ Coy JF、Wiemann S、Bechmann I、Bachner D、Nitsch R、Kretz O、Christiansen H、Poustka A (2002 年 6 月)。「Pore 膜および/またはフィラメント相互作用様タンパク質 1 (POMFIL1) は主に神経系で発現し、さまざまなタンパク質アイソフォームをエンコードします」。Gene . 290 ( 1–2 ): 73–94。doi :10.1016/S0378-1119(02)00567-X。PMID 12062803 。
- ^ ab 「Entrez Gene: NAV2 ニューロンナビゲーター 2」。
- ^ 「NAV2 ニューロンナビゲーター2 [ホモサピエンス (ヒト)] - 遺伝子 - NCBI」。www.ncbi.nlm.nih.gov 。 2022年5月5日閲覧。
- ^ Xu C、Su BB、Lozano S、Wang K (2020-01-01)、Martin CR、Preedy VR (編)、「第1章 ニューロンナビゲーター2遺伝子とアルツハイマー病」、認知症における遺伝学、神経学、行動、食事、Academic Press、pp. 3–24、ISBN 978-0-12-815868-5、 2022年5月5日取得
- ^ abcde Wang KS、Liu Y、Xu C、Liu X、Luo X (2017-09-15)。「NAV2遺伝子とアルツハイマー病発症リスクおよび発症年齢との家族ベースの関連分析」。Journal of Neuroimmunology。310 :60–65。doi:10.1016 / j.jneuroim.2017.06.010。ISSN 0165-5728。PMC 6167010。PMID 28778446。
さらに読む
- 中島大将、岡崎直人、山川博司、他(2003年)。 「KIAA 遺伝子の発現準備が整った cDNA クローンの構築: 330 個の KIAA cDNA クローンの手動キュレーション」。DNA研究所9 (3): 99-106。土井:10.1093/dnares/9.3.99。PMID 12168954。
- Xu C、Su BB、Lozano S、Wang K (2020-01-01)、Martin CR、Preedy VR (編)、「第 1 章 - ニューロン ナビゲーター 2 遺伝子とアルツハイマー病」、認知症における遺伝学、神経学、行動、食事、Academic Press、pp. 3–24、ISBN 978-0-12-815868-5、 2022年5月5日取得
- Hillier LD、Lennon G、Becker M、et al. (1997)。「280,000 個のヒト発現配列タグの生成と分析」。Genome Res . 6 (9): 807–28. doi : 10.1101/gr.6.9.807 . PMID 8889549。
- 永瀬 剛、菊野 亮、石川 KI、他 (2000)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XVI。in vitro で巨大タンパク質をコードする脳由来の 150 個の新しい cDNA クローンの完全配列」。DNA Res . 7 (1): 65–73. doi : 10.1093/dnares/7.1.65 . PMID 10718198。
- Dias Neto E、Correa RG、Verjovski-Almeida S、他 (2000)。「ORF 発現配列タグによるヒトトランスクリプトームのショットガン シーケンシング」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 97 ( 7 ): 3491–6。Bibcode : 2000PNAS ...97.3491D。doi : 10.1073/ pnas.97.7.3491。PMC 16267。PMID 10737800。
- Merrill RA、Plum LA、Kaiser ME、Clagett-Dame M (2002)。「unc-53 の哺乳類ホモログは、神経芽細胞腫細胞および胚においてオールトランスレチノイン酸によって制御される」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (6): 3422–7。Bibcode :2002PNAS...99.3422M。doi: 10.1073 / pnas.052017399 . PMC 122539 . PMID 11904404 。
- 石黒 秀、下川剛、角田 剛、他 (2002)。「大腸癌で発現上昇がみられる新規ヒトヘリカーゼ遺伝子 HELAD1 の単離」。Oncogene . 21 (41): 6387–94. doi :10.1038/sj.onc.1205751. PMID 12214280. S2CID 20205673.
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Mitin NY、Ramocki MB、Zullo AJ、et al. (2004)。「ユニークな細胞内局在を持つ新しいRas相互作用タンパク質rainの同定と特性評価」。J . Biol. Chem . 279 (21): 22353–61. doi : 10.1074/jbc.M312867200 . PMID 15031288。
- 堤 S、鎌田 直、Vokes TJ 他(2004)。 「顎骨幹異形成症(GDD)では、推定上の膜貫通タンパク質をコードする新規遺伝子が変異している」。午前。 J. ハム。ジュネット。74 (6): 1255–61。土井:10.1086/421527。PMC 1182089。PMID 15124103。
- Peeters PJ、Baker A、Goris I、他 (2004)。「unc-53 の哺乳類相同遺伝子の低形質マウスにおける感覚障害」。Brain Res. Dev. Brain Res . 150 (2): 89–101. doi :10.1016/j.devbrainres.2004.03.004. PMID 15158073。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
- Beausoleil SA、Villén J、Gerber SA、他 (2006)。「高スループットタンパク質リン酸化解析および部位局在化のための確率ベースのアプローチ」Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92. doi :10.1038/nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、et al. (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。