mir-34 マイクロRNA前駆体ファミリー

mir-34 マイクロRNA前駆体ファミリー
mir-34 マイクロRNA前駆体ファミリー
	mir-34の予測される二次構造と配列の保存
識別子
シンボル	ミール34
Rfam	RF00456
miRBase	ＭＩ００００２６８
miRBase ファミリー	ＭＩＰＦ０００００３９
その他のデータ
RNAタイプ	遺伝子; miRNA
ドメイン	真核生物
行く	GO:0035195 GO:0035068
それで	000124 ...
PDB構造	PDBe

miR -34マイクロRNA前駆体ファミリーは、哺乳類において3つの主要な成熟miRNAを生み出す非コードRNA分子である。miR-34ファミリーのメンバーは計算的に発見され^[1]、後に実験的に検証された。^[2]^{[3]前駆体miRNAステムループは細胞の細胞質で処理され、主要なmiR-34成熟配列は}ヘアピンの5'アームから切除される。^[4]

miR-34ファミリー

哺乳類では、2つの転写単位から3つのmiR-34前駆体が生成されます。^[5]ヒトのmiR-34a前駆体は1番染色体から転写されます。miR-34bとmiR-34cの前駆体は11番染色体上の領域から共転写され、BC021736として知られる転写産物の一部であると思われます。

マウスのMIR34A（遺伝子）の発現は、調べたすべての組織で観察されましたが、最も高いのは脳でした。miR-34bとmiR-cはほとんどの組織で比較的豊富ではありませんが、肺では優勢なmiR-34種です。^{[5] miR-34産物の存在は、}胚性幹細胞でも確認されています。miR-34は、ショウジョウバエとゼブラフィッシュで母性遺伝することが示されており、miR-34の喪失は、ゼブラフィッシュ胚の後脳の発達に欠陥をもたらしました。これは、モデル生物におけるmiR-34のノックダウン表現型の初めての報告でしたが、この表現型はゼブラフィッシュ胚の約30％でのみ観察されました。^[6]

miR-34の標的

山口らは、 miR-34aがサイレント情報調節因子1（SIRT1）遺伝子を標的とすることを示した： ^[7]

「miR-34 による SIRT1 の阻害は、アセチル化 p53 の増加と、それぞれ細胞周期とアポトーシスを制御する p53 の転写標的である p21 と PUMA の発現につながります。さらに、miR-34 による SIRT1 の抑制は、最終的には WT ヒト大腸癌細胞でアポトーシスにつながりますが、p53 を欠くヒト大腸癌細胞ではアポトーシスは起こりません。最後に、miR-34a 自体は p53 の転写標的であり、 p53 と miR-34a の間に正のフィードバックループがあることを示唆しています。したがって、miR-34a は、部分的に SIRT1-p53 経路を介して腫瘍抑制因子として機能します。」^[7]

最近、定量的プロテオミクス（SILACアプローチ）がHEK293T細胞におけるゲノムレベルでのmiR-34a標的の同定に使用されました。^[8]

Mir-34はヒトp53変異胃癌腫瘍球を阻害する

p53欠損ヒト胃癌細胞では、機能的miR-34の回復により細胞増殖が抑制され、化学感受性およびアポトーシスが誘導されることから、miR-34がp53機能を回復する可能性があることが示唆されている。miR-34の回復は腫瘍球形成および増殖を抑制し、これは癌幹細胞の自己複製と相関していると報告されている。miR-34による自己複製抑制のメカニズムは、下流標的Bcl-2、Notch、およびHMGA2の直接的な調節に関連しているようであり、miR-34が胃癌幹細胞の自己複製/分化の意思決定に関与している可能性があることを示唆している。^[9]^[10] miR-34cは骨の発達および骨癌にも関連していることが示唆されている。^[11]

参考文献

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^ He L、He X、Lim LP、de Stanchina E、Xuan Z、Liang Y、Xue W、Zender L、Magnus J、Ridzon D、Jackson AL、Linsley PS、Chen C、Lowe SW、Cleary MA、Hannon GJ (2007 年 6 月)。「p53 腫瘍抑制因子ネットワークのマイクロ RNA コンポーネント」。Nature . 447 (7148): 1130–4. doi :10.1038/nature05939. PMC 4590999 . PMID 17554337 。
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^ Mir-34 と p53 経路
^ Bae Y、Yang T、Zeng HC、Campeau PM、Chen Y、Bertin T、Dawson BC、Munivez E、Tao J、Lee BH (2012 年 7 月)。「miRNA-34c は骨の発達中に Notch シグナル伝達を制御する」。ヒト分子遺伝学。21 ( 13): 2991–3000。doi :10.1093/hmg/dds129。PMC 3373245。PMID 22498974。

外部リンク

Rfamの mir-34 microRNA 前駆体ファミリーのページ
マウス miR-34a (mmu-miR-34a) の miRBase エントリ
ヒト miR-34a (hsa-miR-34a) の miRBase エントリ

[1] Lim LP、Glasner ME、Yekta S、Burge CB、Bartel DP (2003 年 3 月)。「脊椎動物のマイクロ RNA 遺伝子」。Science . 299 ( 5612): 1540. doi :10.1126/science.1080372. PMID 12624257. S2CID 37750545.

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[6] Soni K、Choudhary A、Patowary A、Singh AR、Bhatia S、Sivasubbu S、Chandrasekaran S、Pillai B (2013 年 4 月)。「miR-34 は Drosophila melanogaster と Danio rerio で母性遺伝する」。核酸研究。41 ( 8): 4470–80。doi :10.1093 / nar /gkt139。PMC 3632126。PMID 23470996。

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[9] Ji Q, Hao X, Meng Y, Zhang M, Desano J, Fan D, et al. (2008). 「腫瘍抑制因子 miR-34 の回復はヒト p53 変異胃癌腫瘍球を阻害する」BMC Cancer . 8 : 266. doi : 10.1186/1471-2407-8-266 . PMC 2564978. PMID 18803879 .

[10] Mir-34 と p53 経路

[doi.10.1093/hmg/dds129-11] Bae Y、Yang T、Zeng HC、Campeau PM、Chen Y、Bertin T、Dawson BC、Munivez E、Tao J、Lee BH (2012 年 7 月)。「miRNA-34c は骨の発達中に Notch シグナル伝達を制御する」。ヒト分子遺伝学。21 ( 13): 2991–3000。doi :10.1093/hmg/dds129。PMC 3373245。PMID 22498974。