マヌエル・コルパス | |
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マヌエル・コルパスの肖像 | |
| 生まれる | マヌエル・コルパス・ロペス |
| 母校 | ナバラ大学 |
| 知られている |
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| 受賞歴 | ソフトウェアサステナビリティ研究所 2016 |
| 科学者としてのキャリア | |
| フィールド | バイオインフォマティクス ゲノミクス |
| 機関 |
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| 論文 | タンパク質配列の折り畳みパターン (2007) |
| 博士課程の指導教員 | テリ・アトウッド |
| Webサイト |
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マヌエル・コルパスは、主にバイオインフォマティクスとゲノミクスの分野への貢献で知られる、スペイン系イギリス人の生物学者および起業家です。現在、コルパスはケンブリッジの新興企業であるケンブリッジ・プレシジョン・メディシンの主任科学者であり、[ 1]ケンブリッジ大学継続教育研究所の講師、ラ・リオハ国際大学の講師を務めています。マヌエルはキャリアの初めからヒトゲノムの研究に取り組んでおり、自身と近親者のゲノムを解読した最初の消費者の1人であり、その解読結果はCorpasomeとして発表されました。[2]彼はアーラム研究所でプロジェクトリーダーを務め、ウェルカム・サンガー研究所では希少ゲノム疾患の患者の診断を支援するデータベースであるDECIPHERデータベースを開発しました。
教育
コーパスは2000年にナバラ大学で生物学の理学士号を取得しました。 2007年にはマンチェスター大学でテリー・アトウッド教授とスティーブ・ペティファー博士の指導の下、タンパク質のフォールドの進化的保存を研究し、バイオインフォマティクスの博士号を取得しました。[3]
学術サービス
博士課程在籍中、コーパスは国際計算生物学会学生評議会(ISCBSC)[4]を設立しました。これは計算生物学の学生による国際組織です。国際計算生物学会は2004年に学生評議会を正式に承認し、コーパスは初代議長に就任しました。現在までに学生評議会は世界中に多数の地域学生グループを持ち、この分野の何千人もの学生に影響を与えています。[5] [6]コーパスはまた、マドリードで開催されたヨーロッパ計算生物学会議(2005年)で、初の計算生物学学生評議会シンポジウムを開催しました。さらに、アフリカバイオインフォマティクスおよび計算生物学会が主催したアフリカ初のバイオインフォマティクス会議では議長を務めました。
研究とキャリア
マドリードのスペイン国立バイオインフォマティクス研究所でアルフォンソ・バレンシアのもと、また欧州バイオインフォマティクス研究所でユアン・バーニーのもとで数か月働いた後、コーパスはウェルカム・サンガー研究所に着任し、ヘレン・V・ファース博士の指導の下、DECIPHERデータベースの開発者となった。[7]それ以来、彼はヒトゲノム研究とパーソナルゲノミクスの分野で研究を行っている。ウェルカム・サンガー研究所在職中、彼は当初、コピー数多型データセットの解釈のための統合および視覚化ツールの開発に注力した。[8] [9]しばらくして、彼は「コーパソーム」での研究を開始した。[10] [11] [12]彼は23andMeから得た自身の遺伝子型をインターネット上で公開した最初の一人であり、そのプロセスを「ゲノムブログ」と名付けた。[13]その後すぐに彼の家族は23andMeのデータ、次にヒトエクソーム技術、そして最近では全ゲノムを使用して遺伝子型を分析した。[14]これにより、個人ゲノム学の分野でいくつかの重要な出版物が生まれ、[15]ゲノムファミリーの最初のクラウドソーシング分析が行われた。[16]サンガー研究所での在職期間の終わりには、BioJavaScript(BioJS)コミュニティを組織し、2012年から2017年までコーディネーターを務めた。 BioJSコミュニティは、生物学的視覚化のためのオープンソースWebコンポーネントの提供におけるこれまでで最大の取り組みである。 Corpasの研究グループは、このオープンソフトウェアコミュニティの最も重要な開発のいくつかに関わってきた。[17] [18] [19] BioJSには、欧州バイオインフォマティクス研究所、バークレー研究所、ケンブリッジ大学などの世界をリードするリソースからの取り組み。Corpas はGoogle Summer of Codeのインターンシップを 5 件獲得することに成功し、BioJS を国際的な取り組みとして飛躍させました。
コーパスは、バイオインフォマティクスとデータリソースのためのヨーロッパネットワークELIXIRの英国支部であるELIXIR-UK [20]のテクニカルコーディネーターも務めています。ELIXIRテクニカルコーディネーターとして在任中、彼はヨーロッパ全体のデータリソースの影響を測定するためのベストプラクティスと標準化された指標の開発に携わってきました。この間、彼はバイオインフォマティクスの学習、教育、トレーニングのための世界組織[21] [22]にも関わり、同組織の技術委員会の議長を務め、バイオインフォマティクスコミュニティにオープンアクセスのトレーニングリソースを提供するトレーニングポータルの開発に携わりました。
ケンブリッジ精密医療での仕事に加え、マヌエルはケンブリッジ大学 継続教育研究所の講師も務めており、[23]英語とスペイン語で精密医療のオンラインコースも教えています。マヌエルは50を超える査読付き科学出版物を出版しており、[24]また、遺伝子配列の科学を超えた幅広い問題を探求した著書「パーフェクトDNA」[25]も出版しています。
受賞と栄誉
コーパス氏はソフトウェア・サステナビリティ研究所のフェローであり[26]、ロンドン・ゲノミクス・フェスティバル、バイオデータ・ウェスト、長寿世界フォーラムなど、ゲノミクスの世界的に有名なイベントで頻繁に講演を行っています。彼は、マラガ(スペイン)出身で世界に影響を与えている第一人者の一人として知られています。 [27]
参考文献
- ^ 「CPM - ホームページ」www.cpm.onl . 2019年9月4日閲覧。
- ^ Corpas, Manuel (2013). 「Corpasome」. figshare. doi :10.6084/m9.figshare.693052.v3 . 2019年9月4日閲覧。
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- ^ Corpas, Manuel (2005年8月). 「科学者と社会」. Nature . 436 (7054): 1204. doi : 10.1038/nj7054-1204b . ISSN 0028-0836. PMID 16144051. S2CID 186242202.
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- ^ Macintyre, Geoff (2013). 「ISCB 学生評議会の地域学生グループプログラム: 旅先からの物語」. PLOS Computational Biology . 9 (9): e1003241. Bibcode :2013PLSCB...9E3241M. doi : 10.1371/journal.pcbi.1003241 . PMC 3784494. PMID 24098107 .
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