ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| MZF1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | ヒト UniProt 検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | MZF1、MZF-1、MZF1B、ZFP98、ZNF42、ZSCAN6、骨髄性ジンクフィンガー1 |
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| 外部ID | オミム:194550; MGI : 107457;ホモロジーン: 9633;ジーンカード:MZF1; OMA :MZF1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体7(マウス)[2] |
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| | バンド | 7 A1|7 7.73 cM | 始める | 12,776,230 bp [2] |
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| 終わり | 12,788,691 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 膵管細胞
- 右子宮管
- 甲状腺の右葉
- 小脳の右半球
- 下垂体
- 甲状腺の左葉
- 下垂体前葉
- 右副腎
- 右副腎皮質
- 左卵巣
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| | トップの表現 | - 男性の尿道
- 上前頭回
- 一次視覚野
- 網膜の神経層
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 精子細胞
- 精母細胞
- 顆粒球
- 胎児の尾
- 胚
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- タンパク質ホモ二量体化活性
- DNA結合
- タンパク質結合
- 核酸結合
- 金属イオン結合
- RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合
- DNA結合転写抑制活性、RNAポリメラーゼII特異的
- DNA結合転写因子活性
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
- 転写、DNAテンプレート
- RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
- 転写の調節、DNAテンプレート
- RNAポリメラーゼIIによる転写
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001267033 NM_003422 NM_198055 |
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NM_001290452 NM_001290453 NM_145819 NM_001382820 NM_016793 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001253962 NP_003413 NP_932172 |
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| 場所 (UCSC) | 19章: 58.56 – 58.57 Mb | 7 章: 12.78 – 12.79 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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骨髄性ジンクフィンガー1は、ヒトではMZF1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
インタラクション
MZF1はSCAND1と相互作用することが示されている。[7] 2014年にNathan H. Lents
の研究室は、 MZF-1がGAPDH遺伝子を誘導することを示した。これは、MZF-1を誘導または混乱させる可能性のある実験でGAPDHをローディングコントロールとして使用する場合に考慮する必要がある。[8]同じグループは後に、MZF-1がCCN遺伝子ファミリーの2つのメンバーであるCTGFとNOVを誘導することを示した。[9]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000099326 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000030380 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Hromas R、Collins SJ、Hickstein D、Raskind W、Deaven LL、O'Hara P、Hagen FS、Kaushansky K (1991 年 9 月)。「骨髄細胞で優先的に発現するレチノイン酸応答性ヒトジンクフィンガー遺伝子 MZF-1」。J Biol Chem . 266 (22): 14183–7. doi : 10.1016/S0021-9258(18)98664-3 . PMID 1860835。
- ^ 「Entrez Gene: MZF1 骨髄亜鉛フィンガー 1」。
- ^ Sander TL、Haas AL、Peterson MJ、Morris JF (2000 年 4 月)。「MZF1B と相互作用する新規 SCAN ボックス関連タンパク質の同定。ロイシンに富む SCAN ボックスはヘテロおよびホモタンパク質の結合を仲介します」。J . Biol. Chem . 275 ( 17): 12857–12867。doi : 10.1074/jbc.275.17.12857。PMID 10777584。
- ^ Piszczatowski RT、Rafferty BJ、Rozado A、Tobak S、Lents NH (2014)。「グリセルアルデヒド3リン酸脱水素酵素遺伝子(GAPDH)は骨髄ジンクフィンガー1(MZF-1)によって制御され、カルシトリオールによって誘導される」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 451 (1): 137–41. doi :10.1016/j.bbrc.2014.07.082. PMID 25065746。
- ^ Piszczatowski RT (2015). 「骨髄性ジンクフィンガー1(MZF-1)は造血コンパートメントにおけるCCN2/CTGFおよびCCN3/NOV遺伝子の発現を制御する」。Journal of Cellular Physiology . 230 (11): 2634–2639. doi : 10.1002/jcp.25021 . PMID 25899830. S2CID 6888015.
さらに読む
- Bavisotto L、Kaushansky K、Lin N、Hromas R (1991)。「段階特異的骨髄ジンクフィンガー遺伝子MZF-1からのアンチセンスオリゴヌクレオチドは、in vitroでの顆粒球形成を阻害する」。J . Exp. Med . 174 (5): 1097–1101. doi :10.1084/jem.174.5.1097. PMC 2119006. PMID 1719120 。
- Sander TL、Haas AL、Peterson MJ、Morris JF (2000)。「MZF1B と相互作用する新規 SCAN ボックス関連タンパク質の同定。ロイシンに富む SCAN ボックスはヘテロおよびホモタンパク質の結合を仲介する」。J . Biol. Chem . 275 ( 17): 12857–12867。doi : 10.1074 /jbc.275.17.12857。PMID 10777584。
- Peterson MJ、Morris JF (2000)。「ヒト骨髄ジンクフィンガー遺伝子MZFは複数の転写産物を生成し、SCANボックスタンパク質をコードする」。遺伝子。254 (1–2):105–118。doi : 10.1016 / S0378-1119(00)00281- X。PMID 10974541 。
- Takahashi K, Matsumoto C, Ra C (2005). 「FHL3 は MZF-1 の転写コリプレッサーとして作用することにより、ヒト高親和性 IgE 受容体ベータ鎖遺伝子発現を負に制御する」。Biochem . J. 386 ( Pt 1): 191–200. doi :10.1042/BJ20040775. PMC 1134781. PMID 15453830 .
- Kang NY、Park YD、Choi HJ、Kim KS、Lee YC、Kim CH (2005)。「ヒトNeuAcalpha2,3Galbeta1,3GalNAcalpha2,6-シアリルトランスフェラーゼ(hST6GalNAc IV)遺伝子の転写に関与する調節要素」。Mol . Cells . 18 (2): 157–62. doi : 10.1016/S1016-8478(23)13096-2 . PMID 15528990。
- Le Mée S、Fromigué O、Marie PJ (2005)。「Sp1/Sp3 と骨髄ジンクフィンガー遺伝子 MZF1 は骨芽細胞におけるヒト N-カドヘリンプロモーターを制御する」。Exp . Cell Res . 302 (1): 129–142. doi :10.1016/j.yexcr.2004.08.028. PMID 15541732。
- 井上 正之、高橋 健、新出 修、柴田 正之、福澤 正之、Ra C (2005)。「LDOC1、新規 MZF-1 相互作用タンパク質はアポトーシスを誘導する」。FEBS Lett . 579 (3): 604–608. doi :10.1016/j.febslet.2004.12.030. PMID 15670815. S2CID 30914046.
- 謝 YH、呉 TT、蔡 JH、黄 CY、謝 YS、劉 JY (2006)。 「ヒトHCC細胞におけるElk-1およびMZF-1によって調節されるPKCalpha発現」。生化学。生物物理学。解像度共通。339 (1): 217–225。土井:10.1016/j.bbrc.2005.11.015。PMID 16297876。
- Peterson FC、Hayes PL、Waltner JK、Heisner AK、Jensen DR、Sander TL、Volkman BF (2006)。「腫瘍抑制タンパク質MZF1のSCANドメインの構造」。J . Mol. Biol . 363 (1): 137–147. doi :10.1016/j.jmb.2006.07.063. PMC 1941711. PMID 16950398 。
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、Macek B、Kumar C、Mortensen P、Mann M (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–648. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。