ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| MBNL2 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | MBNL2、MBLL、MBLL39、PRO2032、muscleblind様スプライシング調節因子2 |
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| 外部ID | オミム: 607327; MGI : 2145597;ホモロジーン: 76766;ジーンカード:MBNL2; OMA :MBNL2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 14番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 14|14 E4 | 始める | 120,513,081 bp [2] |
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| 終わり | 120,669,109 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 内皮細胞
- 外淡蒼球
- 右心室
- 迷走神経下神経節
- 視床の外側核群
- 視床下核
- 網状部
- ポンス
- 緻密部
- 視神経
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| | トップの表現 | - 手
- 心室中隔
- 耳石器官
- 卵形嚢
- 乳頭体
- 外側中隔核
- 腹内側核
- 上頸部神経節
- 嗅結節
- 足
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- RNAスプライシングの調節
- mRNA処理
- スプライソソームを介した選択的mRNAスプライシングの制御
- RNAスプライシング
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001306070 NM_144778 NM_207304 |
| NM_175341 NM_207515 NM_001360376 NM_001360377 NM_001360378
|
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NM_001360379 NM_001360380 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001292999 NP_659002 NP_997187 NP_001369578 NP_001369579
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NP_001369580 NP_001369581 NP_001369582 NP_001369583 NP_001369585 NP_001369589 NP_001369590 NP_001369592 NP_001369595 NP_001369596 NP_001369597 NP_001369598 NP_001369599 NP_001369600 NP_001369601 NP_001369602 NP_001369603 NP_001369604 NP_001369605 NP_001369606 NP_001369607 NP_001369608 NP_001369609 NP_001369610 NP_001369611 NP_001369612 NP_001369613 NP_001369614 NP_001369615 NP_001369616 NP_001369617 NP_001369618 NP_001369619 NP_001369620 NP_001369621 NP_001369622 NP_001369623 NP_001369624 NP_001369625 NP_001369626 |
| NP_780550 NP_997398 NP_001347305 NP_001347306 NP_001347307
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NP_001347308 NP_001347309 |
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| 場所 (UCSC) | 13 章: 97.22 – 97.39 Mb | 14 章: 120.51 – 120.67 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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マッスルブラインド様タンパク質2は、ヒトではMBNL2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子はC3H型ジンクフィンガータンパク質をコードしており、これはショウジョウバエのmuscleblind Bタンパク質に類似している。ショウジョウバエのmuscleblindは光受容体の分化に必要な遺伝子である。いくつかの選択的スプライシング転写変異体が記載されているが、全長の性質が決定されているのはそのうちのいくつかだけである。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000139793 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000022139 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Fardaei M、Rogers MT、Thorpe HM、Larkin K、Hamshere MG、Harper PS、Brook JD (2002 年 4 月)。「3 つのタンパク質、MBNL、MBLL、および MBXL は、DM1 および DM2 細胞における拡張反復転写物の核フォーカスと生体内で共存します」。Hum Mol Genet . 11 (7): 805–14. doi : 10.1093/hmg/11.7.805 . PMID 11929853。
- ^ ab "Entrez 遺伝子: MBNL2 筋肉ブラインド様 2 (ショウジョウバエ)"。
さらに読む
- Adereth Y、Dammai V、Kose N、他 (2006)。「Muscleblind 様タンパク質 MLP1 によって制御される RNA 依存性インテグリン α3 タンパク質の局在」。Nat . Cell Biol . 7 (12): 1240–7. doi :10.1038/ncb1335. PMC 2365307. PMID 16273094 。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Ho TH、Charlet-B N、Poulos MG、et al. (2005)。「Muscleblindタンパク質は選択的スプライシングを制御する」。EMBO J. 23 ( 15): 3103–12. doi :10.1038/sj.emboj.7600300. PMC 514918. PMID 15257297 。
- Dunham A、Matthews LH、Burton J、他 (2004)。「ヒト染色体 13 の DNA 配列と分析」。Nature 428 ( 6982 ) : 522–8。Bibcode : 2004Natur.428..522D。doi : 10.1038 /nature02379。PMC 2665288。PMID 15057823。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Christian SL、McDonough J、Liu Cy CY、他 (2002)。「双極性障害および統合失調症に関連するヒト染色体 13q32-q33 上の約 15 Mb 領域のアセンブリの評価」。Genomics . 79 ( 5): 635–56. doi :10.1006/geno.2002.6765. PMID 11991713。
外部リンク