MAP1LC3A

MAP1LC3A
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	3ECI、3WAL、3WAN、4ZDV
識別子
エイリアス	MAP1LC3A、ATG8E、LC3、LC3A、MAP1ALC3、MAP1BLC3、微小管関連タンパク質1軽鎖3アルファ
外部ID	オミム：601242; MGI : 1915661;ホモロジーン: 12021;ジーンカード：MAP1LC3A; OMA :MAP1LC3A - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体20（ヒト）
終わり	34,560,345 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体2（マウス）
終わり	155,119,993 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	小脳の右半球; ; 右前頭葉; ; ブロードマン領域9; ; 帯状回; ; 前帯状皮質; ; 前頭前皮質; ; 視床下部; ; C1セグメント; ; 扁桃体; ; 下垂体前葉;
	トップの表現
	リップ; ; 太ももの筋肉; ; 右心室; ; 海馬歯状回顆粒細胞; ; 上前頭回; ; 一次視覚野; ; 精細管; ; 視床下部背内側核; ; 二腹筋; ; 上腕三頭筋;
	参照表現データの詳細
	該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能	ホスファチジルエタノールアミン結合; タンパク質結合; リン脂質結合; ユビキチンタンパク質リガーゼ結合; 微小管結合;
細胞成分	細胞質; 細胞小器官膜; 細胞質; 後期エンドソーム; 膜; オートファゴソーム; 微小管; 細胞骨格; 細胞質小胞; 内膜系; オートリソソーム; オートファゴソーム膜; シナプス;
生物学的プロセス	オートファジー; ミトコンドリアのオートファジー; オートファゴソームの組み立て; 鉄(II)イオンに対する反応; 鉛イオンへの反応; 栄養レベルへの反応; アミノ酸欠乏に対する細胞反応; モルヒネに対する反応; 過酸化水素に対する細胞反応; 銅イオンに対する細胞反応; 窒素欠乏に対する細胞反応; 飢餓に対する細胞反応; マクロオートファジー; オートファゴソームの成熟;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	84557
	66734
	ENSG00000101460
	ENSMUSG00000027602
	Q9H492
	Q91VR7
	NM_032514 ; NM_181509
	NM_025735
	NP_115903 ; NP_852610
	NP_080011
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

微小管関連タンパク質1A/1B軽鎖3Aは、ヒトではMAP1LC3A遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]^[7]この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする2つの転写変異体が見つかっている。

関数

MAP1AとMAP1Bは微小管関連タンパク質であり、微小管と細胞骨格の構成要素との間の物理的相互作用を媒介する。MAP1AとMAP1Bはそれぞれ重鎖サブユニットと複数の軽鎖サブユニットから構成される。この遺伝子によってコードされるタンパク質は軽鎖サブユニットの1つであり、MAP1AまたはMAP1Bのいずれかと結合することができる。^[7]

MAPLC3Aは酵母ATG8の哺乳類ホモログの一つであり、オートファジーの重要なマーカーおよびエフェクターである。^[8]

規制

MAP1LC3Aは、いくつかの翻訳後修飾によって制御されています。これらには、オートファジー膜におけるC末端のホスファチジルエタノールアミンへの共有結合や、プロテインキナーゼAによるリン酸化が含まれ、^[9]オートファジー機能をダウンレギュレーションします。非共有結合相互作用は、選択的オートファジーにおける貨物標的化機能に重要です。例えば、セクエストソーム1と相互作用することが示されている。^[10]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000101460 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000027602 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Mann SS、Hammarback JA (1997 年 5 月)。「軽鎖 3 の遺伝子局在と発達的発現: 微小管関連タンパク質 1A (MAP1A) と MAP1B の共通サブユニット」。J Neurosci Res . 43 (5): 535–44。doi : 10.1002 /(SICI)1097-4547(19960301)43:5<535::AID-JNR3>3.0.CO;2- J。PMID 8833088。S2CID 23515321 。
^ Pankiv S, Clausen TH, Lamark T, Brech A, Bruun JA, Outzen H, Overvatn A, Bjorkoy G, Johansen T (2007 年 8 月). 「p62/SQSTM1 は Atg8/LC3 に直接結合し、ユビキチン化されたタンパク質凝集体のオートファジーによる分解を促進する」J Biol Chem . 282 (33): 24131–45. doi : 10.1074/jbc.M702824200 . PMID 17580304.
^ ab 「Entrez Gene: MAP1LC3A 微小管関連タンパク質 1 軽鎖 3 アルファ」。
^ ヴァレンテ G、モラーニ F、ニコトラ G、フスコ N、ペラッキオ C、ティトーネ R、アラビソ O、アリシオ R、カツァロス D、ベネデット C、イシドロ C (2014)。「卵巣癌におけるオートファジータンパク質BECLIN 1およびLC3の発現と臨床的意義」。バイオメッド研究所2014 : 462658.土井: 10.1155/2014/462658。PMC 4127242。PMID 25136588。
^ シェラ SJ、クーリッチ SM、上地 G、バラスブラマニ M、マウントズリス J、デイ BW、チュー CT (2010 年 8 月)。「リン酸化によるオートファジータンパク質LC3の制御」。Ｊ．セルバイオル．190 (4): 533–9。土井：10.1083/jcb.201002108。PMC 2928022。PMID 20713600。
^ Shvets E、Fass E、Scherz-Shouval R、Elazar Z (2008 年 8 月)。「LC3 の N 末端と Phe52 残基は p62/SQSTM1 をオートファゴソームにリクルートする」。J . Cell Sci . 121 (Pt 16): 2685–95. doi : 10.1242/jcs.026005 . PMID 18653543。

さらに読む

Snásel J, Pichová I (1997). 「HIV-1プロテアーゼによる宿主細胞タンパク質の切断」Folia Biol. (プラハ) . 42 (5): 227–30. doi :10.1007/BF02818986. PMID 8997639. S2CID 7617882.
Wallin M、Deinum J、Goobar L、Danielson UH (1990)。「レトロウイルスプロテアーゼによる微小管関連タンパク質のタンパク質分解切断」。J . Gen. Virol . 71 (9): 1985–91. doi : 10.1099/0022-1317-71-9-1985 . PMID 2212989。
Schoenfeld TA、McKerracher L、Obar R、Vallee RB (1989)。「MAP 1A と MAP 1B は、中枢神経系で異なる発達パターンを持つ構造的に関連のある微小管関連タンパク質です」。J . Neurosci . 9 (5): 1712–30. doi : 10.1523/JNEUROSCI.09-05-01712.1989 . PMC 6569839. PMID 2470876 。
Mann SS、Hammarback JA (1994)。「軽鎖3の分子特性。MAP1AおよびMAP1Bの微小管結合サブユニット」。J . Biol. Chem . 269 (15): 11492–7. doi : 10.1016/S0021-9258(19)78150-2 . PMID 7908909。
Hartley JL、Temple GF、Brasch MA (2001)。「In Vitro 部位特異的組換えを用いた DNA クローニング」。Genome Res . 10 (11): 1788–95. doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948 . PMID 11076863。
Wiemann S、Weil B、Wellenreuther R、他 (2001)。「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログに向けて：ヒトcDNAをコードする新規完全タンパク質500種の配列決定および分析」。Genome Res . 11 (3): 422–35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166 。
Bonnet C, Boucher D, Lazereg S, et al. (2001). 「チューブリンポリグルタミル化による微小管関連タンパク質 MAP1A、MAP1B、および MAP2 の異なる結合制御」J. Biol. Chem . 276 (16): 12839–48. doi : 10.1074/jbc.M011380200 . PMID 11278895.
Deloukas P、Matthews LH 、 Ashurst J、他 (2002)。「ヒト染色体20のDNA配列と比較分析」。Nature 414 ( 6866 ): 865–71。Bibcode :2001Natur.414..865D。doi : 10.1038 /414865a。PMID 11780052。
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
He H、Dang Y、Dai F、et al. (2003)。「ヒト MAP1LC3 ファミリーの 3 つのメンバーの翻訳後修飾と MAP1LC3B の新しいタイプの修飾の検出」。J . Biol. Chem . 278 (31): 29278–87. doi : 10.1074/jbc.M303800200 . PMID 12740394。
Tanida I, Sou YS, Ezaki J, et al. (2004). 「HsAtg4B/HsApg4B/autophagin-1 は 3 つのヒト Atg8 ホモログのカルボキシル末端を切断し、微小管関連タンパク質軽鎖 3 および GABAA 受容体関連タンパク質リン脂質複合体を脱脂する」J. Biol. Chem . 279 (35): 36268–76. doi : 10.1074/jbc.M401461200 . PMID 15187094.
Kouno T, Mizuguchi M, Tanida I, et al. (2005). 「ヒト微小管関連タンパク質軽鎖-3の1H、13C、および15N共鳴割り当て」。J . Biomol. NMR . 29 (3): 415–6. doi :10.1023/B:JNMR.0000032505.99071.ea. PMID 15213446. S2CID 23561733.
Goehler H、Lalowski M、Stelzl U、他 (2004)。「タンパク質相互作用ネットワークがハンチンチン凝集の促進因子である GIT1 とハンチントン病を結び付ける」。Mol . Cell . 15 (6): 853–65. doi : 10.1016/j.molcel.2004.09.016 . PMID 15383276。
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). 「ORFeome から生物学へ: 機能ゲノミクスパイプライン」Genome Res . 14 (10B): 2136–44. doi :10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336 .
Kouno T, Mizuguchi M, Tanida I, et al. (2005). 「微小管関連タンパク質軽鎖3の溶液構造とその機能サブドメインの同定」J. Biol. Chem . 280 (26): 24610–7. doi : 10.1074/jbc.M413565200 . PMID 15857831.
Sou YS、Tanida I、Komatsu M、et al. (2006)。「ホスファチジルセリンはホスファチジルエタノールアミンに加えて、哺乳類 Atg8 修飾因子 LC3、GABARAP、および GATE-16 の in vitro ターゲットである」。J . Biol. Chem . 281 (6): 3017–24. doi : 10.1074/jbc.M505888200 . PMID 16303767。
Mehrle A、Rosenfelder H、 Schupp I 、他 (2006)。「2006 年の LIFEdb データベース」。Nucleic Acids Res . 34 (データベース号): D415–8。doi : 10.1093/nar/gkj139。PMC 1347501。PMID 16381901。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000101460 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000027602 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid8833088-5] Mann SS、Hammarback JA (1997 年 5 月)。「軽鎖 3 の遺伝子局在と発達的発現: 微小管関連タンパク質 1A (MAP1A) と MAP1B の共通サブユニット」。J Neurosci Res . 43 (5): 535–44。doi : 10.1002 /(SICI)1097-4547(19960301)43:5<535::AID-JNR3>3.0.CO;2- J。PMID 8833088。S2CID 23515321 。

[pmid17580304-6] Pankiv S, Clausen TH, Lamark T, Brech A, Bruun JA, Outzen H, Overvatn A, Bjorkoy G, Johansen T (2007 年 8 月). 「p62/SQSTM1 は Atg8/LC3 に直接結合し、ユビキチン化されたタンパク質凝集体のオートファジーによる分解を促進する」J Biol Chem . 282 (33): 24131–45. doi : 10.1074/jbc.M702824200 . PMID 17580304.

[entrez-7] 「Entrez Gene: MAP1LC3A 微小管関連タンパク質 1 軽鎖 3 アルファ」。

[8] ヴァレンテ G、モラーニ F、ニコトラ G、フスコ N、ペラッキオ C、ティトーネ R、アラビソ O、アリシオ R、カツァロス D、ベネデット C、イシドロ C (2014)。「卵巣癌におけるオートファジータンパク質BECLIN 1およびLC3の発現と臨床的意義」。バイオメッド研究所2014 : 462658.土井: 10.1155/2014/462658。PMC 4127242。PMID 25136588。

[pmid20713600-9] シェラ SJ、クーリッチ SM、上地 G、バラスブラマニ M、マウントズリス J、デイ BW、チュー CT (2010 年 8 月)。「リン酸化によるオートファジータンパク質LC3の制御」。Ｊ．セルバイオル．190 (4): 533–9。土井：10.1083/jcb.201002108。PMC 2928022。PMID 20713600。

[pmid18653543-10] Shvets E、Fass E、Scherz-Shouval R、Elazar Z (2008 年 8 月)。「LC3 の N 末端と Phe52 残基は p62/SQSTM1 をオートファゴソームにリクルートする」。J . Cell Sci . 121 (Pt 16): 2685–95. doi : 10.1242/jcs.026005 . PMID 18653543。