このRNA構造予測ソフトウェアのリストは、 核酸構造予測 に使用されるソフトウェアツールとウェブポータルをまとめたものです。
比較方法 上述の単一配列解析法では、膨大な数の可能な構造の中から、妥当な二次構造のごく一部を検出することが困難です。この空間を縮小する有効な方法は、進化論的アプローチを用いることです。進化によって保存されてきた構造は、機能的な形態である可能性がはるかに高いからです。以下の手法はこのアプローチを採用しています。
分子間相互作用：マイクロRNA：あらゆるRNA 以下の表には、UTRに限定されない相互作用が含まれています。
分子間相互作用：マイクロRNA：UTR マイクロRNAは 3'UTR に結合することでタンパク質コード遺伝子の発現を調節しますが、これらの相互作用を予測するために特別に設計されたツールがあります。ハイスループット実験データに対するターゲット予測方法の評価については、（Baek et al. 、Nature 2008）[ 126 ] et al. 、Bioinformatics 2009）[ 127 ] [ 128 ]を参照してください。
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