核酸シミュレーションソフトウェアの比較

これは、核酸シミュレーションに使用される著名なコンピュータプログラムの一覧です。

参考文献

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[2] 「pmemd.cuda GPU実装」。

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[8] Petr Šulc; Flavio Romano; Thomas E. Ouldridge; Lorenzo Rovigatti; Jonathan PK Doye; Ard A. Louis (2012). "粗視化DNAモデルの配列依存熱力学". J. Chem. Phys . 137 (13): 135101. arXiv : 1207.3391 . Bibcode : 2012JChPh.137m5101S . doi : 10.1063 / 1.4754132 . PMID 23039613. S2CID 15555697 .

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[11] ボニエキ、ミハル・Ｊ．ラック、グジェゴシュ;ドーソン、ウェイン K.トマラ、コンラッド。ルカシュ、パヴェル。ソルティシンスキー、トマシュ。クリスチャン・M・ロザー； Bujnicki、Janusz M. (2015-12-19)。「SimRNA: RNA フォールディングシミュレーションと 3D 構造予測のための粗粒化手法」。核酸研究。44 (7): e63。土井：10.1093/nar/gkv1479。ISSN 0305-1048。PMC 4838351。PMID 26687716。

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