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COVID-19シミュレーションモデルは、COVID-19の拡散に関する数学的な感染症モデルです。[1]このリストは、主にデジタル接触追跡に使用されるCOVID-19アプリと混同しないでください。
リストされているアプリケーションの中には、Web サイト専用のモデルまたはシミュレーターがあり、その一部は他のソースからの リアルタイム データに依存 (または使用) していることに注意してください。
最も科学的に裏付けられたモデル
サブリストには理論モデルに基づいたシミュレータが含まれています。COVID-19パンデミックによって作成され推進されているプレプリント研究の数が多いため、[2]特に新しいモデルは、より科学的な厳密さをもってのみ検討されるべきです。[3] [4]
シミュレーションとモデル
- ChenらによるBats-Hosts-Reservoir-People (BHRP)モデルに基づくシミュレーション(RPのみに簡略化)[5]
- CoSim19 [6] – Lehr教授、 SEIRDモデルに基づく
- COVID-19モビリティモデリング[7] – スタンフォード大学SEIRモデルに基づく[8]
- COVID-19シミュレーター[9] – ハーバード大学医学部、検証済みのシステムダイナミクス(コンパートメント)モデルに基づく[10]
- COVID-19の急増[11] – CDC [12]
- COVIDSIM [13] – Mark Kok Yew Ng他著
- CovidSim –インペリアル・カレッジ・ロンドン、MRCグローバル感染症分析センター、ニール・ファーガソン他
- CovidSim [14] – ミュンヘン応用科学大学ケスター教授による研究プロジェクト
- COVIDSim [15] – MATLAB [16]で書かれたNgとGui [17]
- CovidSIM.eu [18] – Martin Eichner、Markus Schwehm 、テュービンゲン大学の支援を受け、ドイツ連邦教育研究省が後援。
- CovidSIM [19] – シュナイダーら。
- CovRadar [20] – コロナスパイクタンパク質の分子監視用[21] [22]
- デ・レオンとペデリバ – 統計物理学の基本原理に基づいた動的粒子モンテカルロアルゴリズム。[23] [24]
- ガファルザデガン博士のモデル[25] [26] [27]
- イベントホライズン – COVID-19 [28] – SIR-Xモデルに基づくHUベルリン[29]
- 進化型AI [30] – 「AIが時間の経過とともにさまざまな国や地域向けに生成する非医薬品介入(NPI)とその予測効果。」[31] [32] [33]
- インデックスケースから世界的拡大まで – シウィアク博士、実際の人口密度、通勤パターン、長距離移動ネットワークを組み込んだGLEAMフレームワークに基づく。[34]
- IHME モデル– 保健指標評価研究所 COVID モデル
- MEmilio [35] – ハイブリッドグラフSIR型モデル[36]に基づくオープンソースの高性能モジュラー疫学シミュレーションソフトウェア。地域間の通勤テスト[37]とワクチン接種戦略[38]およびエージェントベースモデル
- OpenCOVID [39] [40] –スイス熱帯公衆衛生研究所(スイスTPH) – Rで実装されたSARS-CoV-2感染とCOVID-19疾患ダイナミクスのオープンアクセスの個人ベース伝播モデル。
- OxCGRT [41] – オックスフォードCOVID-19政府対応トラッカー[42] [33]
- SC-COSMO [43] – スタンフォード-CIDEコロナウイルスシミュレーションモデル
- SDL-PAND: カタルーニャのパンデミック状況のデジタルツイン。[44]
- SECIR [45] [46] [47] [48] –ヘルムホルツ感染研究センターによるモデル
- スモールワールドネットワーク上のSEIRモデルは、非医薬品介入が感染伝播ネットワークの構造に与える影響を推定するために使用される[49]
- SIAM疫学コレクション[50]
- 社会的ストレスのダイナミクスと古典的な疫病モデルを組み合わせたSIR SSモデル。 [51]社会的ストレスは社会物理学のツールによって記述されます。
- 新型コロナウイルス感染拡大防止に向けたウイルスRNA検査リソースへの賢明な投資[52] [53]
- 顧有陽COVIDモデル
ゲノムデータベース
これらのモデルのいくつかは、次のようなゲノム データベースを利用します。
コンソーシアム、研究クラスター、その他のコレクション
- CDCの予測対象と仮定のリスト[54] – さまざまなモデルなどを含む大規模なリスト。
- CORSMA – EUコンソーシアム(Eヘルス、血清学、モデリング、人工知能、実装研究を組み合わせたCOVID-19アウトブレイク対応)[55]
- COVID-19予測ハブ[56] – 50を超える国際研究グループからの予測と予想の中央リポジトリとして機能します。[57] [58]
- Nextstrain – 病原体ゲノムデータの科学的および公衆衛生的可能性を活用するオープンソースプロジェクト[59]
- Nextstrain SARS-CoV-2リソースも参照[60]
- SIMID [61] – 感染症のシミュレーションモデル – ベルギー研究コンソーシアム
- RAMP – パンデミックのモデル化における迅速な支援[62] (英国)
- UTオースティンCOVID-19モデリングコンソーシアム[63]
- 感染症の治療と診断におけるイノベーションを促進する計算アプローチ
ワクチン接種モニター、モデル、ダッシュボード
注:以下の(追加の)リソースは、シミュレーションではなく実際のデータに基づいています。ワクチン接種率の推定など予測機能が含まれている場合もありますが、一般的にはこの記事の主なリストのように理論的またはモデリング的根拠に基づいていません。それでも、予測は重要です。[64] (たとえば、COVID-19予測ハブを参照してください)[65]
- COVID-19ダッシュボード[66] -ジョンズホプキンス大学(JHU)システム科学工学センター(CSSE)[67] [68]
- CDCによるCOVIDVaxView [69]
- データハブ新型コロナウイルス2019データセット[70] [71] - COVID-19データセット新型コロナウイルス感染症2019(COVID-19)の時系列で、確認された症例、報告された死亡者、報告された回復者を一覧表示しています。
- Impfdashboard.de - ドイツのワクチン接種モニター[72]
- COVID19ワクチン接種キャンペーンのシミュレーション[73] - Zi Data Science Labによるドイツのワクチン接種キャンペーンのモニター
- 保健指標評価研究所(IHME)COVID-19予測[74]
科学的根拠の少ないモデル
以下のモデルは純粋に教育目的のみに使用されます。
- 細胞防御オートマトンモデル[75]
- 注目すべきSARS-CoV-2の変異体と変異の概要[76]
- Covid-19シミュレーター[77]
- COVID19: トップ7 - Mediumに投稿された厳選リスト[78]
- github.com/topics: covid-19 [79]
- ISEEシステムCOVID-19シミュレーター[80]
- nCoV2019.live [81] - 「一目でわかる必要な数字」シフマン/コンロン著
- cov19.cc-コンロン著[82]
- Simul8 - COVID-19シミュレーションリソース[83]
- SIRモデルによるコロナウイルスのシミュレーション[84]
- ウイルス拡散シミュレーション[85]
その他の関連シミュレーション、モデル、データソース
- (アメリカ化学会)CAS COVID-19バイオインジケーターエクスプローラー[86]
- CDCのCOVIDデータトラッカー[87]
- COVID-19に対する連帯を目的とした市民社会パートナー(CSPAC):251の地域と71隻の船舶に関する完全なライブの世界的なCOVID-19状況レポート[88]
- コーネル社会経済研究所(CISER):COVID-19データソース[89]
- オイラー・ラグランジュ多相モデル、例えばCFDに基づくエレベーター内でのCOVID-19の伝播[90]
- LarsenらによるCOVID-19症状発現シミュレーション(確率的進行モデル)[91]
- Our World in Dataのコロナウイルスソースデータ[92]
- アトランティック誌のCOVID-19追跡プロジェクト[93]
- Vadere - 歩行者と群衆のシミュレーションのためのオープンソースフレームワーク[94]
- WHOコロナウイルス(COVID-19)ダッシュボード[95]
トレーニングとその他のリソース
- 感染症モデリング専門 - インペリアル・カレッジ・ロンドンが Coursera で提供
- COVID-19 の拡散を予測するための COVID-19 シミュレーターと機械学習ツールキットの紹介 - AWS Machine Learning ブログ
参照
参考文献
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さらに読む
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