ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| LDB2 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | LDB2、CLIM1、LDB1、LDB-2、LIMドメイン結合2 |
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| 外部ID | オミム:603450; MGI : 894670;ホモロジーン: 989;ジーンカード:LDB2; OMA :LDB2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 5番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 5|5 B3 | 始める | 44,629,474 bp [2] |
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| 終わり | 44,957,022 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 右肺
- ブロードマン領域23
- 中側頭回
- 子宮体部
- 上前頭回
- 大静脈
- ブロードマン領域10
- 一次視覚野
- 正面ポール
- アキレス腱
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| | トップの表現 | - 生殖腺隆起
- 鉤状部
- 性器結節
- 精管
- 腰椎神経節
- 視床下部背内側核
- 腹内側核
- 左肺
- 海馬のI領域
- 左肺葉
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 酵素結合
- LIMドメインバインディング
- 転写共調節活性
- タンパク質結合
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
- 毛包の発達
- 細胞成分の生合成の正の調節
- 上皮構造の維持
- 体性幹細胞集団の維持
- RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
- キナーゼ活性の調節
- 細胞移動の調節
- RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
- 多細胞生物の発達
- 転写の負の調節、DNAテンプレート
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001130834 NM_001290 NM_001304434 NM_001304435 |
| NM_001077398 NM_001286348 NM_010698 NM_001347349 NM_001359070
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NM_001359071 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001124306 NP_001281 NP_001291363 NP_001291364 |
| NP_001070866 NP_001273277 NP_001334278 NP_034828 NP_001345999
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NP_001346000 |
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| 場所 (UCSC) | 4 章: 16.5 – 16.9 Mb | 5 章: 44.63 – 44.96 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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LIMドメイン結合タンパク質2は、ヒトではLDB2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7] [8]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000169744 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000039706 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Ueki N, Oda T, Kondo M, Yano K, Noguchi T, Muramatsu M (1999年2月). 「核標的タンパク質をコードする遺伝子の選択システム」Nat Biotechnol . 16 (13): 1338–42. doi :10.1038/4315. PMID 9853615. S2CID 20001769.
- ^ Retaux S、Rogard M、Bach I、Failli V、Besson MJ (1999 年 2 月)。「Lhx9: 発達中の前脳で発現する新規 LIM ホメオドメイン遺伝子」。J Neurosci . 19 (2): 783–93. doi :10.1523/JNEUROSCI.19-02-00783.1999. PMC 6782204 . PMID 9880598。
- ^ Kotaka M、Kostin S、Ngai S、Chan K、Lau Y、Lee SM、Li H、Ng EK、Schaper J、Tsui SK、Fung K、Lee C、Waye MM (2000 年 10 月)。 「エニグマファミリータンパク質であるhCLIM1とα-アクチニン2の相互作用」。Jセルバイオケム。78 (4): 558–65。土井:10.1002/1097-4644(20000915)78:4<558::AID-JCB5>3.0.CO;2-I。PMID 10861853。S2CID 84122657 。
- ^ 「Entrez Gene: LDB2 LIM ドメイン結合 2」。
さらに読む
- Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). 「全長濃縮および5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Semina EV、Altherr MR、Murray JC (1998)。「LIMドメイン結合因子CLIM1およびCLIM2/LDB1/NLIをコードする2つの新規ヒト遺伝子のクローニングと染色体局在」。Mamm . Genome . 9 (11): 921–4. doi :10.1007/s003359900899. PMID 9799849. S2CID 28813194.
- Ueki N, Seki N, Yano K, et al. (1999). 「LIMホメオドメインタンパク質の補因子であるCLIM1およびCLIM2をコードするヒト遺伝子の単離および染色体割り当て」J. Hum. Genet . 44 (2): 112–5. doi : 10.1007/s100380050120 . PMID 10083735.
- Bach I、Rodriguez-Esteban C、Carrière C、et al. (1999)。「RLIM はヒストン脱アセチル化酵素複合体のリクルートメントを介して LIM ホメオドメイン転写因子の機能活性を阻害する」。Nat . Genet . 22 (4): 394–9. doi :10.1038/11970. PMID 10431247. S2CID 22326394。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Colland F, Jacq X, Trouplin V, et al. (2004). 「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」Genome Res . 14 (7): 1324–32. doi :10.1101/gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748 .
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。