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| ジンメンウイルス | |
|---|---|
ウイルスの分類 
| |
| (ランク外): | ウイルス |
| レルム: | リボビリア |
| 王国： | オルタナウイルス科 |
| 門: | キトリノビリコタ |
| クラス： | フラスビリセテス |
| 注文： | アマリロウイルス科 |
| 家族： | フラビウイルス科 (?) |
| (ランク外): | ジンメンウイルス |
| メンバーウイルス | |
| |
荊門ウイルスは、分節ゲノムを持つプラス鎖一本鎖RNAウイルスのグループです。主に節足動物と関連しており、動物宿主に感染するわずか2つの既知の分節RNAウイルスのうちの1つです。[1] [2] [3]最初のグループメンバーである荊門ダニウイルス（JMTV）は、2014年に説明されました。[4]もう1つのメンバーであるグアイコイエカウイルス（GCXV）は、ゲノムセグメントが異なるウイルスカプシドに別々に囲まれた非常に珍しい多成分構造を持っています。[5]
例
荊門ダニウイルス
このグループの最初のメンバーは2014年に記載され、中国の荊門市で採取されたダニから分離されたため、荊門ダニウイルス（JMTV）と名付けられました。 [4]これは、最も近いウイルスの親戚よりもわずかに大きい、エンベロープを持つ球状のウイルスです。JMTVゲノムは4つのセグメントで構成され、そのうち2つには、メチルトランスフェラーゼやRNA依存性RNAポリメラーゼなど、フラビウイルスに見られる非構造タンパク質と配列相同性を持つ遺伝子が含まれています。JMTVゲノム内の推定構造タンパク質には、相同性が知られていません。[ 4 ] JMTVは、ダニでの同定に加えて、 Aedes albopictusなどの蚊にも少量存在することが同定されています。[6]
グアイコイエカウイルス
グアイコイレックスウイルス（GCXV）は、トリニダード島グアイコ近郊で見つかったイエカ 属蚊から分離された後、2016年に報告されました。 [5]異なるウイルス分離株は4つまたは5つのゲノムセグメントを持っていますが、5番目はウイルスの増殖に必須ではありません。GCXVは、各ゲノムセグメントが小さなエンベロープウイルスカプシドに囲まれた多成分（多分節）ウイルスです。非構造タンパク質とカプシド成分の遺伝子を含む少なくとも3つのゲノムセグメントが細胞に入り込んで感染し、ウイルスを正常に増殖させる必要があります。[5] GMXVが発見される前は、多成分構造は植物や真菌に感染するウイルスでのみ報告されており、エンベロープウイルスでは観察されていませんでした。[1] [5]
その他のウイルス
他のジンメンウイルスに属すると思われる遺伝物質は、バイオインフォマティクスを通じて特定することができます。場合によっては、そのような配列はウイルスとして認識されていなかったり、ゲノムの分節性がJMTVが記述される前に認識されていなかったりします。たとえば、報告された犬の寄生虫であるトキソカラ・カニスのゲノムには、JMTVと相同性のある配列が含まれていることが判明しており、配列が決定された寄生虫のウイルス感染を表している可能性があります。[4] [7] 2011年に初めて報告されたモギアナダニウイルスも同様の例です。その分節ゲノムは最初の発表時には認識されませんでしたが、2017年に再分析され、ジンメンウイルスとして特定されました。[8]
JMTVと相同性のある配列もアカコロブスザルから分離されており、霊長類に感染する可能性のある分節化された、おそらく多成分のウイルスの可能性を示唆している。[5]節足動物フラビウイルスのメタゲノミクス研究では、さらに5つのジンメンウイルス配列の例が特定された。[9]
進化
ジンメンウイルスはフラビウイルスと関連があり、フラビウイルスは非分節ゲノムを持ち、単一のカプシドで伝播する。RNA依存性RNAポリメラーゼを含むジンメンウイルスとフラビウイルスの非構造タンパク質をコードする遺伝子の間には、一貫して相同性が観察されている。しかし、相同遺伝子のゲノム構造は大きく異なっており、標準的なフラビウイルスゲノムは単一のオープンリーディングフレーム（ORF）で構成され、そのタンパク質産物はプロテアーゼによって処理されるが、非構造のジンメンウイルスタンパク質は2つのゲノムセグメントにコードされており、それぞれに1つのORFが含まれている。既知のジンメンウイルス配列はほとんどないが、ゲノムセグメントの遺伝子構成はよく保存されているようである。[4] [5] [9]対照的に、ジンメンウイルスのカプシドを構成すると思われる推定構造タンパク質は、既知のタンパク質と相同性がない。[4] [5]
分節型のジンメンウイルスに最も近い既知の近縁種が分節型ではないことは驚くべきことである。[1] [ 2]ゲノム分節化、特に多成分構造の根底にある進化メカニズムは十分に理解されていない。分節ゲノムはウイルス群の中で複数回進化したように見えるが、この構造の根底にある進化メカニズムは不明である。[10] [11]同様に、多成分構造が明確な進化戦略なのか、それとも欠陥のある干渉粒子の形成による分節化メカニズムの産物なのかは不明である。[1] [10]
参考文献
- ^ abcd Holmes, Edward C. (2016年9月). 「拡大するウイルス圏」. Cell Host & Microbe . 20 (3): 279–280. doi : 10.1016/j.chom.2016.08.007 . PMID 27631697.
- ^ ab Attar, Naomi (2016年9月6日). 「動物ウイルスの断片」. Nature Reviews Microbiology . 14 (10): 606–7. doi : 10.1038/nrmicro.2016.133 . PMID 27595788.
- ^ミチャラキス、 ヤニス（2020年9月）。「多部分ウイルスの奇妙な戦略」（PDF） 。Annual Review of Virology。7（1）：203–218。doi ： 10.1146 / annurev-virology-010220-063346。PMID 32991271。S2CID 222161056 。
- ^ abcdef Qin, X.-C.; Shi, M.; Tian, J.-H.; Lin, X.-D.; Gao, D.-Y.; He, J.-R.; Wang, J.-B.; Li, C.-X.; Kang, Y.-J.; Yu, B.; Zhou, D.-J.; Xu, J.; Plyusnin, A.; Holmes, EC ; Zhang, Y.-Z. (2014年4月21日). 「ダニ媒介性分節RNAウイルスには、分節のないウイルス祖先に由来するゲノムセグメントが含まれる」。Proceedings of the National Academy of Sciences . 111 (18): 6744–6749. Bibcode :2014PNAS..111.6744Q. doi : 10.1073/pnas.1324194111 . PMC 4020047 . PMID 24753611.
- ^ abcdefg ラドナー、ジェイソン T.;ワイリー、マイケル R.ブレット・バイツェル;オーギュスト、アルバート J.デュピュイ、アラン P.リンドクイスト、マイケル E.シブリー、サミュエル D.コタ、クリシュナ P.デイビッド・フェタラー。イーストウッド、ジリアン。キンメル、デイビッド。プリエト、カルラ。グスマン、ヒルダ。アリオタ、マシュー・T.レイエス、ダニエル。ブリュッゲマン、エルンスト E.セントジョン、レナ。ハイエロバ、デイビッド。ラウク、マイケル。フリードリヒ、トーマス C.オコナー、デイビッド・H.ゲストレ、マリー C.カザレス、リサ H.ポポフ、フセヴォロド L.。カストロ・リャノス、ファニー;コッヘル、タデウシュ J.ケニー、タラ。ホワイト、ベイリー。ウォード、マイケル D.ロアイザ、ホセ R. Goldberg, Tony L.; Weaver, Scott C.; Kramer, Laura D.; Tesh, Robert B.; Palacios, Gustavo (2016 年 9 月)。「蚊から分離された多成分動物ウイルス」。Cell Host & Microbe . 20 (3 ): 357–367. doi :10.1016/j.chom.2016.07.011. PMC 5025392 . PMID 27569558.
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