イェンス・ニールセン

イェンス・ニールセン
2017年のニールセン
国籍	デンマーク語
母校	デンマーク工科大学、デンマーク
知られている	代謝工学、システム生物学
受賞歴	受賞セクションを参照
科学者としてのキャリア
機関	チャルマース工科大学（スウェーデン）、バイオイノベーション研究所（デンマーク）
博士課程の指導教員	ジョン・ヴィラドセン

イェンス・ニールセンは、デンマークのコペンハーゲンにあるバイオイノベーション研究所^[1]のCEOであり、スウェーデンのヨーテボリにあるシャルマース工科大学のシステム生物学[2]の教授です。また、デンマーク工科大学とコペンハーゲン大学の非常勤教授でもあります。ニールセン^は代謝工学の分野で最も引用されている研究者であり、スウェーデンとデンマーク（ヨーロッパでトップ5）の生物学と生化学の分野で最も引用されている研究者です。彼は米国の3つのアカデミー（科学、工学、医学）すべての唯一の外国人会員であり、中国工程院の外国人会員でもあります。彼は国際代謝工学協会の初代会長でした。彼はさらにいくつかのバイオテクノロジー企業を設立しました。

イェンス・ニールセンは、1981年にホーセンス国立高等学校を卒業し、デンマーク工科大学（DTU）で化学工学の修士号（1986年）と生化学工学の博士号（1989年）を取得しました。^{[引用が必要]}学業を終えた後、DTUに独立した研究グループを設立し、1998年に教授に任命されました。 ^{[引用が必要]} 1995年から1996年までMITでフルブライト客員教授を務めました。^{[引用が必要]} DTUでは、微生物バイオテクノロジーセンターを設立し、その責任者を務めました。^{[引用が必要]}

2008年、スウェーデンのチャルマース工科大学の教授兼ディレクターに採用され、60人以上の研究グループを築き上げた。^[要出典]チャルマースでは、部門横断的な戦略的研究イニシアチブである先端生命科学工学分野^{[3]を設立し、生物学部と生物工学部の初代部長を務めた。 [4]}現在、両学部には約200人が所属している。ニールセンは850本以上の研究論文を発表し、^[5] 40冊以上の本の共著者であり、50件以上の特許を保有している。^[要出典]トムソン・ロイター/クラリベイトによって2015～2023年の高引用研究者に選ばれ、^[6] Google Scholarによると、代謝工学、産業バイオテクノロジー分野で最も引用されている研究者であり、合成生物学でもトップ5に入っている。^[要出典]彼はいくつかの教科書の共著者であり、バイオ反応工学原理に関する教科書^[7]は3版が出版されている。代謝工学に関する教科書^{[8] は}中国語と日本語に翻訳されている。^[要出典]

2019年、ニールセンはノボノルディスク財団による科学の革新と社会への応用を支援する取り組みであるバイオイノベーション研究所（BII）のCEOに採用されました。^[9]

ニールセンは、30 年近く代謝の研究とエンジニアリングに携わってきました。彼の研究は、天然の希少分子、抗生物質、バイオ燃料を生み出しました。また、人間の代謝も研究しており、特に2 型糖尿病、肥満、心血管疾患、さまざまな癌などの代謝性疾患に興味を持っています。

ニールセンは、さまざまな産業バイオテクノロジープロセスの研究と改善に取り組んできました。最初は、ペニシリン生産に使用される糸状菌ペニシリウム・クリソゲナムの生理学的特性評価に取り組みました。その結果、オランダの会社 DSM と共同で、セファレキシンの前駆体であるアジポイル-7-ADCA の新しい生産プロセスの開発に取り組みました。また、抗生物質生産に使用されるその他の発酵プロセスの特性評価にも取り組み、実験およびモデリング技術を使用して、いくつかの企業の生産プロセスの改善を支援しました。ニールセンは、菌類と細菌の両方を使用して、 工業用酵素の生産に使用される発酵プロセスの改善にも取り組んできました。

ニールセンは、古典的および新しい発酵プロセスの改良に関する研究に関連して、今日では表現型の改善を目的とした細胞の直接遺伝子改変である代謝工学の基礎となっている多くの実験ツールと計算ツールを開発した。 ^[10]彼は、フラックス分析を行う目的で、C13標識代謝物の測定のための実験ツールとしてガスクロマトグラフィー質量分析法（GC-MS）を使用した初めての人物であった。^[11]代謝工学を通じて、ニールセンは、酵母によるエタノール生産の改善や副産物としてのグリセロール形成の削減など、多くのバイオテクノロジープロセスを開発および改良してきた。^[12]酵母の温度耐性を改善することで高温でのエタノール生産を可能にし、それによってコストを削減した。^[13]遺伝子操作された酵母を用いた、レスベラトロール、^[14] 3-ヒドロキシプロピオン酸、^[15]ヒトヘモグロビン、^[16]脂肪酸エチルエステル、^[17]短鎖脂肪酸、アルカン、^[18]脂肪アルコール、^[19]サンタレン、^[20] ファルネセン、^[21] クマリン酸、^[22] オルニチン、^[23]スペルミジンなどのさまざまな化学物質の生産。

ニールセンは、産業用微生物のためのシステム生物学ツールの開発の先駆者です。彼は、酵母（サッカロミセス・セレビシエ）、ラクトコッカス・ラクティス、ストレプトミセス・コエリカラー、アスペルギルス・オリザエ、アスペルギルス・ニガー、ペニシリウム・クリソゲナム、ピキア・パストリスなど、多くの重要な産業用微生物のゲノムスケール代謝モデル（GEM）を開発しました。^[要出典]また、彼は統合オミクス解析を実行するためのツールも数多く開発しており^[要説明]、共制御に関する洞察を得るためにトランスクリプトームデータをGEMのコンテキストに統合する方法を初めて実証しました。^{[24]ニールセンは、多くの微生物の定量的}メタボローム解析を実行するための方法も開発しており、いくつかの重要な産業用微生物のゲノム配列決定にも携わっています。^[要出典]

ニールセンは、微生物用に開発したシステム生物学のツールボックスを使用して、ヒトの代謝に関する研究を開始しました。これに関連して、彼はヒト細胞の包括的なゲノム規模の代謝モデルを開発し、がん代謝の代謝異質性を説明するためにヒトGEMを使用した最初の人物となりました。^[25]彼のヒト代謝に関する研究には、肥満、^[26] NAFLDとNASH、^{[27 ]}肝細胞がんなどのさまざまな疾患の研究が含まれています。^[28] ニールセンはさらに、ヒトGEMを使用して、いくつかのグリコサミノグリカンの組み合わせ測定値が明細胞腎細胞がんの強力なバイオマーカーとして使用できることを確認しました。^[29]これはおそらく最初のシステムバイオマーカーです。

ニールセンはシステム生物学の能力を活かして腸内細菌叢の代謝を研究してきました。彼は腸内細菌叢の特徴を明らかにするためにメタゲノム配列解析を使用し、その変異が心血管疾患^[30]や2型糖尿病[ ^31]と関連していることを実証する初期の研究に携わりました。彼はまた、高度な代謝モデリングスキルを活用して、食事の変化に応じて腸内細菌叢が血漿メタボロミクスの変化にどのように影響するかについて、さらなる機能的洞察を得ました。^[32]

• ディレクトール・ゴーム・ピーターセンのミンデレガット、デンマーク (1989)
• ウルリク・ブリンチとフストラ・マリー・ブリンチの遺物、デンマーク (1994)
• STVF ジュビリエウムスプリス、スタテンス・テクニスク・ヴィデンスカベリーゲ・フォルスクニングスロード、デンマーク (1996)
• アクセル・トフボルグ・ジェンセンス・レガット、ビェラム＝ブレンステッド＝ラング講演、カールスバーグ財団、デンマーク（2001）
• ヴィラム・カン・ラスムッセンのオールスレガット、ヴィラム・カン・ラスムッセン・フォンデン、デンマーク（2002）
• メルク代謝工学賞（米国）（2004年）
• アムジェン生化学工学賞、米国（2011）
• ネイチャー賞メンタリング賞、ネイチャー出版グループ、英国 (2012)
• チャールズ・D・スコット賞 2012、燃料と化学品のためのバイオテクノロジーに関するシンポジウム、米国 (2012)
• ノーブラッド・エクストランド・メダル、スウェーデン化学協会、スウェーデン (2013)
• ノボザイム賞、ノボ ノルディスク財団、デンマーク (2016)
• ガデン賞、アメリカ化学会、米国（2016）
• スウェーデン王立工学アカデミー金メダル（2017年）
• エリック・アンド・シーラ・サムソン首相賞、輸送、燃料、スマートモビリティイニシアチブにおける代替燃料の革新、イスラエル（2017年）
• ENI賞、イタリア（2017）
• ジェームズ・E・ベイリー賞、アメリカ化学工学協会、米国（2019）
• Arvid Carlssons Award、サールグレンスカ サイエンス パーク、スウェーデン (2019)
• エミール・クリスチャン・ハンセン微生物学研究金メダル、デンマーク（2019年）
• グレゴリー・ステファノプロス代謝工学賞、IMES、米国（2020）
• 中国政府友好賞、中国（2021年）
• ジュリアス・トムセン技術化学金メダル、DTU（2023）^[33]
• チャルマーズメダル、チャルマーズ大学（2023）^[34]
• 中国国際科学技術協力賞、中国（2024年）^[35]

• デンマーク技術科学アカデミー会員（1997年）
• スウェーデン王立工学アカデミー会員（2010年）
• デンマーク王立科学文学アカデミー会員（2010年）
• 米国工学アカデミー外国人会員（2010年） ^[36]
• アメリカ医学生物工学協会フェロー（米国）（2011年）
• アメリカ微生物学会フェロー（2012年）^[37]
• スウェーデン、ヨーテボリ王立芸術科学協会会員（2012年）
• スウェーデン王立科学アカデミー会員（2014年）
• 中国工程院外国人会員（2019年）
• 米国科学アカデミー外国人会員（2019年）^[38]
• 米国医学アカデミー会員（2023年）^[39]

• フルブライトフェロー、米国（1995）
• スナー記念講演会、ルンド大学、スウェーデン (2002)
• ハフ記念講演、バーミンガム大学、英国 (2004)
• ヴァレンバーグ奨学生、スウェーデン（2010）
• 北京化学工学大学名誉教授（中国北京、2014年）
• ウィリアム・チャーマーズ講演、スウェーデン、チャーマーズ工科大学（2014）
• 張大宇講演会、中国科学院大連化学物理研究所、中国（2015）
• Ridder af Danneblog (ダンネブログ騎士団騎士)、デンマーク女王マルグレーテ 2 世(2019)
• 中国無錫の江南大学名誉教授(2019)
• 中国天津市南開大学名誉教授
• 中国、天津の天津大学、ペイヤン講義
• 天津大学名誉教授（中国天津市）

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