イオン性クーロンブロッケード(ICB)[1] [2]は、 M.クレムスとマッシミリアーノ・ディ・ヴェントラ(カリフォルニア大学サンディエゴ校)[1]によって予測された静電気現象であり、メソスコピック電気拡散システム(人工ナノ細孔[1] [3]および生物学的イオンチャネル[2] )を介したイオン輸送で現れ、細孔内の固定電荷[2](または外部電圧、またはバルク濃度[1] )に対する伝導度の振動依存性として現れます。
ICBは、量子ドットで観測される、よりよく知られている電子クーロンブロッケード(ECB)のイオン関連版です。[4] [5] ICBとECBは両方とも電荷の量子化と静電排除原理から生じ、多くの効果と基礎となる物理的メカニズムを共有しています。ICBは、異なる電荷(符号と値の両方が異なる)のイオンの存在に関連したいくつかの特定の効果をもたらします。ここで、整数はイオンの価数、は基本電荷であり、ECB()の単一価電子とは対照的です。
ICB効果は、自己容量 が非常に小さいため、単一イオンの充電エネルギーが粒子あたりの熱エネルギーに比べて大きくなる小さな細孔で現れます()。このような場合、細孔内のエネルギースペクトルの強い量子化があり、システムはイオンの輸送に対して「ブロック」されるか、反対の極端な場合、、、またはからの自由エネルギーバイアスに応じて、共鳴障壁のない伝導を示す可能性があります[6] [2]。
ICBモデルによれば、特定のイオンに対する伝導と選択性の主な決定要因は伝導度の予測される振動と、それに伴うチャネル占有率のクーロン階段[2]は、2価イオン( )または3価イオン( )の場合に強い影響を持つと予想される。
現在ICBに属すると認識されているいくつかの効果は、チャネルやナノ細孔における静電気支配の伝導メカニズムに関する先行論文で以前に発見され、検討されていました。[7] [8] [9] [10] [11]
ICBの発現は、2D単分子層を介した水で満たされたサブナノメートルの細孔で観察されており、[3]狭いチャネル内のカルシウム伝導帯のブラウン運動(BD)シミュレーションによって明らかにされており、[2] [12]生物学的イオンチャネルで見られる多様な効果を説明しています。[2] ICBの予測は、NaChBac細菌チャネルにおける二価遮断の変異研究によっても確認されています。[13]
モデル
チャネル/ナノポアの一般的な静電モデル

ICB効果は、ナノポアまたはイオンチャネルの選択フィルタの簡略化された静電気/ブラウン運動モデルに基づいて導き出すことができます。[8]このモデルは、チャネル/ポアを、膜に埋め込まれた水で満たされたタンパク質ハブを通る帯電した穴として表します。その固定電荷は、均一で中央に配置された剛性リングと見なされます(図1)。チャネルは、長さnmと半径nmの幾何学的パラメータを持つと想定され、部分的に水和したイオンが一列に並んで移動できるようにします。
モデルは、水とタンパク質をそれぞれ誘電率とを持つ連続媒体として表します。可動イオンは、原子価と半径を持つ離散的なエンティティとして記述され、自己無撞着に結合したポアソンの静電方程式とランジュバンの確率方程式によって支配され、細孔内を確率的に移動しています。
このモデルは、陽イオン性[9]と陰イオン性[14]の生物学的イオンチャネルと人工ナノポア[1]に適用可能である。 [3]
静電気
可動イオンは部分的に水和されており(通常は最初の水和殻[15]を保持している)、電荷を帯びていると仮定されます。ここで は基本電荷です(たとえばのイオン)。このモデルにより、障壁のない透過条件を満たす細孔とイオンのパラメータを、電荷の量子化を考慮した基本的な静電気から導くことができます。
イオンを含むチャネル/細孔の位置エネルギーは、静電エネルギー[1] [2] [8]、脱水エネルギー[15] 、およびイオン間局所相互作用エネルギーに分解できます。 基本的な ICB モデルでは、 という単純化された近似が成り立ちます。したがって、は、価数 の同一のイオンを含む場合の細孔の正味電荷であり、移動するイオンの符号は の符号と反対であり、は細孔の静電自己容量を表し、 は真空の誘電率です。
共鳴バリアレス伝導

熱力学と統計力学は、粒子あたりのギブズ自由エネルギーとして定義される化学ポテンシャル によって、粒子の数が可変のシステムを説明します。 [16] [17]、ここで は粒子システムのギブズ自由エネルギーです。バルクリザーバーとの熱および粒子平衡では、システム全体に共通の化学ポテンシャルの値(他のコンテキストではフェルミレベル)があります。[16]新しいイオンがチャネルに入るために必要な自由エネルギーは、過剰化学ポテンシャル[16]によって定義されます。これは(エントロピー項 を無視すると)次のように表すことができます。ここで は入ってくるイオンの充電エネルギー(自己エネルギー障壁)、 は親和力(つまり、結合部位 への引き付けるエネルギー)です。との間のエネルギー差(図 2)は、イオンのエネルギーレベルの分離(クーロンギャップ)を定義し、観測されるほとんどの ICB 効果を引き起こします。
選択的イオンチャネルでは、結合部位への強い親和性にもかかわらず、優先イオン種はほぼ自由拡散速度 でチャネルを通過します。この伝導率と選択性のパラドックスは、選択的障壁なし伝導の結果であると説明されています。[6] [10] [17] [18] ICBモデルでは、これが( )によってほぼ正確にバランスしているときに発生し、これは の特定の値に対して発生します(図2)。[12]のこの共鳴値は、イオン特性と(暗黙的に、 - 依存の脱水エネルギー[6] [15]を介して) に依存し、それによって選択性の基礎が提供されます。
コンダクタンスの振動

ICB モデルは、チャネル内のイオン数が連続的に増加すると、2 つの絡み合った特異点セットが発生し、伝導が に依存する振動的な依存性を持つことを明示的に予測します(図 3A)。
静電的閉塞点は細孔の基底状態エネルギーの最小値に対応する(図3C)。点()は中和点[12]と等価であり、となる。
共鳴伝導点は、障壁のない条件、またはに対応します。
[2]の値は、、 における伝導率振動の周期といった簡単な式で与えられます。
の場合、典型的なイオンチャネル形状では、、ICBが強くなります。その結果、BDシミュレーションによる電流対のプロットは、複数のイオン伝導帯、つまり最小値と最大値の間の強いクーロンブロッケード振動を示します(図3A)。[12]
点は、 を持つ非荷電細孔に対応します。このような細孔は、どちらの符号のイオンに対しても閉塞されます。
クーロン階段
伝導度のICB振動は、細孔占有率のクーロン階段に対応し、遷移領域はに対応し、飽和領域はに対応します(図3B)。階段の形状は、量子ドットのクーロン階段と同様に、フェルミ-ディラック(FD)分布[2]によって記述されます。 [5]したがって、遷移のFD関数は次のようになります。ここで、は特定のイオンの過剰化学ポテンシャルであり、は細孔容積に関連する等価のバルク占有率です。占有率の飽和FD統計は、ラングミュア等温線[19]またはミカエリス-メンテン速度論[20]に相当します。
これは、図 3B に見られる階段状の濃度関連シフトを引き起こす 要因です。
特異点の移動
さまざまな発生源(脱水、[15]局所結合、[21]体積排除など[9] [17] )から生じる部分的な過剰化学ポテンシャルの追加により、ICB障壁のない状態がもたらされ、 ICB共鳴点の適切なシフトがもたらされます。これは「シフト方程式」によって説明されます。[22] [21]つまり、追加のエネルギー寄与により、共鳴障壁のない点がシフトします。
これらのシフト(過剰ポテンシャル)の中でより重要なのは次のとおりです。
- 体積エントロピーに起因する 濃度関連シフト[17]
- 部分的な脱水ペナルティから生じる 脱水関連の変化[15]
- 局所結合に関連したシフトは、局所結合エネルギー[21]と表面効果[23]から生じます。
人工ナノ細孔
サブナノメートル MoS2毛穴
解析理論[1] [2]と分子動力学シミュレーションに基づく予測に続き、単一の nm ナノポアが貫通した単分子膜の実験[3]から ICB の実験的証拠が明らかになりました。膜の両側の水性イオン溶液間では、非オーム性伝導が高度に観察されました。特に、膜全体の電圧が低い場合、電流はゼロに近いままでしたが、約mV のしきい値を超えると急激に上昇しました。これは、低電圧での大きな電位障壁により、(非帯電)ナノポア内の電流が完全にイオンクーロン遮断されていると解釈されました。しかし、より大きな電圧を印加すると障壁が引き下げられ、遷移が起こり得るアクセス可能な状態が生成され、伝導につながりました。
生物のイオンチャネル
ICBが生物学的イオンチャネルで発生する可能性があるという認識[2]は、実験的に観察された選択性の特徴をいくつか説明しました。
価数選択性
価数選択性とは、異なる価数のイオンを区別するチャネルの能力であり、例えばカルシウムチャネルは、イオンを最大1000倍優先します。 [24]価数選択性は、純粋な静電気、[11] 、電荷空間競合メカニズム、[25] 、イオンとリガンドの適合、[26] 、量子化された脱水など、様々に起因するとされています。[27] ICBモデルでは、価数選択性は静電気、つまり障壁のない伝導を提供するために必要なの値の -依存性 から生じます。
同様に、ICBモデルは、部位特異的変異がチャネルを遮断して破壊したり、選択性をイオン選択性からイオン選択性へと変化させたり、その逆を行ったりする理由を説明しています[28] 。
二価遮断
二価(例えば)による一価(例えば)電流の遮断は、いくつかの種類のイオンチャネルで観察される。すなわち、[24]純粋なナトリウム溶液中のイオンはカルシウムチャネルを妨げられることなく通過するが、非常に小さな(nM)細胞外濃度のイオンによって遮断される。[24] ICBは、現象自体と電流対減衰曲線のラングミュア等温線形状の両方を、イオンの強い親和性とFD分布から導き出すことで、明快に説明する。[2] [13]逆に、二価遮断の出現は、ICBを支持する強力な証拠を提示する。
同様に、ICBは生物学的塩化物()選択チャネルで観察されている二価(ヨウ化物)遮断を説明できる。[14]
特別な機能
ICBとECBの比較
ICB と ECB は、同じ基本的な静電現象の 2 つのバージョンとして考えるべきものです。ICB と ECB はどちらも電荷の量子化と有限の単一粒子の充電エネルギーに基づいており、その結果、これらの密接に関連した現象の支配方程式と発現はよく似ています。ただし、ICB と ECB には重要な違いがあります。その類似点と相違点は表 1 にまとめられています。
特別なケース
クーロンブロッケードは超伝導体でも発生することがある。その場合、自由電荷キャリアはクーパー対()である[29]
さらに、パウリスピンブロッケード[30]は、パウリの排他原理に関連する特別な種類のクーロンブロッケードを表します。
量子アナロジー
ICBは完全に古典的なシステムで現れるにもかかわらず、量子力学(QM)を彷彿とさせるいくつかの現象を示す。これらはイオンの電荷/実体の離散性がエネルギースペクトルの量子化につながり、QMの類似性につながるために生じる:[31]
- ノイズ駆動の拡散運動は、ECB の QM トンネリングに匹敵する障壁を越える脱出を可能にします。
- 占有率vsの特定のFD形状[2]は、二価ブロッケード現象のICB説明において重要な役割を果たしている。[13]排他原理に従う古典粒子の拡散におけるFD分布の出現は厳密に実証されている。[19] [32] [33]
参照
参考文献
- ^ abcdefg Krems, Matt; Di Ventra, Massimiliano (2013-01-10). 「ナノ細孔におけるイオン性クーロン遮断」. Journal of Physics: Condensed Matter . 25 (6): 065101. arXiv : 1103.2749 . Bibcode :2013JPCM...25f5101K. doi :10.1088/ 0953-8984 /25/6/065101. PMC 4324628. PMID 23307655.
- ^ abcdefghijklmn Kaufman, Igor Kh; McClintock, Peter VE; Eisenberg, Robert S (2015). 「生物学的イオンチャネルの浸透と選択性のクーロン遮断モデル」。New Journal of Physics . 17 (8): 083021. Bibcode :2015NJPh...17h3021K. doi : 10.1088/1367-2630/17/8/083021 .
- ^ abcd Feng, Jiandong; Graf, Michael; Dumcenco, Dumitru; Kis, Andras; Di Ventra, Massimiliano; Radenovic, Aleksandra (2016). 「ナノ細孔におけるイオン性クーロン遮断の観察」. Nature Materials . 15 (8): 850–855. Bibcode :2016NatMa..15..850F. doi :10.1038/nmat4607. PMID 27019385.
- ^ Averin, DV; Likharev, KK (1986-02-01). 「単一電子トンネル効果のクーロンブロッケードと小さなトンネル接合におけるコヒーレント振動」. Journal of Low Temperature Physics . 62 (3–4): 345–373. Bibcode :1986JLTP...62..345A. doi :10.1007/bf00683469. ISSN 0022-2291. S2CID 120841063.
- ^ ab Beenakker, CWJ (1991-07-15). 「量子ドットの伝導におけるクーロンブロッケード振動の理論」. Physical Review B. 44 ( 4): 1646–1656. Bibcode :1991PhRvB..44.1646B. doi :10.1103/PhysRevB.44.1646. hdl : 1887/3358 . PMID 9999698.
- ^ abc Eisenman, George; Horn, Richard (1983-10-01). 「イオン選択性の再考: チャネルを介したイオン透過における運動学的および平衡プロセスの役割」. The Journal of Membrane Biology . 76 (3): 197–225. doi :10.1007/bf01870364. ISSN 0022-2631. PMID 6100862. S2CID 26390118.
- ^ von Kitzing, Eberhard (1992)、「膜貫通チャネルにおけるイオン伝導率の飽和に関する新しいモデル」、膜タンパク質:構造、相互作用、モデル、エルサレム量子化学および生化学シンポジウム、第25巻、Springer Netherlands、pp. 297–314、doi :10.1007/978-94-011-2718-9_25、ISBN 9789401052054
- ^ abc Zhang, J.; Kamenev, A.; Shklovskii, BI (2006-05-19). 「荷電壁を持つ水充填チャネルにおけるイオン交換相転移」. Physical Review E. 73 ( 5): 051205. arXiv : cond-mat/0510327 . Bibcode :2006PhRvE..73e1205Z. doi :10.1103/PhysRevE.73.051205. PMID 16802926.
- ^ abc Roux, Benot; Allen, Toby; Bernche, Simon; Im, Wonpil (2004-02-01). 「生物学的イオンチャネルの理論モデルと計算モデル」(PDF) . Quarterly Reviews of Biophysics . 37 (1): 15–103. Bibcode :2004APS..MAR.J7004R. doi :10.1017/s0033583504003968. ISSN 0033-5835. PMID 17390604. S2CID 6213437.
- ^ ab Yesylevskyy, SO; Kharkyanen, VN (2005-06-01). 「イオンチャネルにおけるバリアレスノックオン伝導:特異性か、それとも一般的なメカニズムか?」.化学物理学. 312 (1–3): 127–133. Bibcode :2005CP....312..127Y. doi :10.1016/j.chemphys.2004.11.031. ISSN 0301-0104.
- ^ ab Corry, Ben; Vora, Taira; Chung, Shin-Ho (2005年6月). 「陽イオンチャネルにおける価数選択性の静電的根拠」. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes . 1711 (1): 72–86. doi : 10.1016/j.bbamem.2005.03.002 . ISSN 0005-2736. PMID 15904665.
- ^ abcd Kaufman, I.; Luchinsky, DG; Tindjong, R.; McClintock, PVE; Eisenberg, RS (2013-11-19). 「カルシウム-ナトリウムイオンチャネルファミリーにおける離散選択バンドと突然変異誘発遷移のエネルギー論」. Physical Review E. 88 ( 5): 052712. arXiv : 1305.1847 . Bibcode :2013PhRvE..88e2712K. doi :10.1103/PhysRevE.88.052712. PMID 24329301. S2CID 10145481.
- ^ abc Kaufman, Igor Kh.; Fedorenko, Olena A.; Luchinsky, Dmitri G.; Gibby, William AT; Roberts, Stephen K.; McClintock, Peter VE; Eisenberg, Robert S. (2017). 「NaChBac細菌イオンチャネルとその電荷変化変異体におけるイオンクーロン遮断と異常モル分率効果」. EPJ Nonlinear Biomedical Physics . 5 :4. doi : 10.1051/epjnbp/2017003 . ISSN 2195-0008.
- ^ ab Hartzell, Criss; Putzier, Ilva; Arreola, Jorge (2005-03-17). 「カルシウム活性化塩化物チャネル」. Annual Review of Physiology . 67 (1): 719–758. doi :10.1146/annurev.physiol.67.032003.154341. ISSN 0066-4278. PMID 15709976.
- ^ abcde Zwolak, Michael; Wilson, James; Ventra, Massimiliano Di (2010). 「ナノ細孔における脱水とイオン伝導の量子化」. Journal of Physics: Condensed Matter . 22 (45): 454126. arXiv : 1005.2550 . Bibcode :2010JPCM...22S4126Z. doi :10.1088/0953-8984/22/45/454126. ISSN 0953-8984. PMC 2997750. PMID 21152075 .
- ^ abc Landsberg, Peter T. ( 2014-03-05 ). 熱力学と統計力学。Courier Corporation。ISBN 9780486167589。
- ^ abcd Krauss, Daniel; Eisenberg, Bob; Gillespie, Dirk (2011-03-06). 「モデルカルシウムチャネルの選択性配列:静電場強度の役割」. European Biophysics Journal . 40 (6): 775–782. doi :10.1007/s00249-011-0691-6. ISSN 0175-7571. PMC 3124256. PMID 21380773 .
- ^ Nadler, Boaz; Hollerbach, Uwe; Eisenberg, RS (2003-08-13). 「誘電境界力とグラミシジンにおけるその重要な役割」. Physical Review E. 68 ( 2): 021905. Bibcode :2003PhRvE..68b1905N. doi :10.1103/physreve.68.021905. ISSN 1063-651X. PMID 14525004.
- ^ ab Fowler, RH (1935). 「ラングミュアの吸着等温線の統計的導出」.ケンブリッジ哲学協会数学紀要. 31 (2): 260–264. Bibcode :1935PCPS...31..260F. doi :10.1017/S0305004100013359. ISSN 1469-8064. S2CID 137095413.
- ^ エインズワース、スタンレー(1977)、「ミカエリス・メンテン運動学」、定常酵素運動学、マクミラン教育UK、pp. 43–73、doi:10.1007 / 978-1-349-01959-5_3、ISBN 9781349019618
- ^ abc Kaufman, I.Kh.; Gibby WAT, Luchinsky DG, McClintock PVE (2017). 「イオンチャネルにおける確率的輸送に対する局所結合の影響 - IEEE カンファレンス出版物」. arXiv : 1704.00956 . doi :10.1109/ICNF.2017.7985974. S2CID 1163779.
{{cite journal}}:ジャーナルを引用するには|journal=(ヘルプ)が必要ですCS1 maint: multiple names: authors list (link) - ^ Luchinsky, DG; Gibby WAT, Kaufman I.Kh., McClintock PVE, Timucin DA (2017). 「狭いイオンチャネルにおける選択性と伝導性の関係 - IEEE 会議出版物」(PDF) . doi :10.1109/ICNF.2017.7985973. S2CID 38221919.
{{cite journal}}:ジャーナルを引用するには|journal=(ヘルプ)が必要ですCS1 maint: multiple names: authors list (link) - ^ 田中 浩也; 飯塚 秀夫; ユリー・V・パーシン; マッシミリアーノ・ディ・ヴェントラ (2018). 「ナノメートルサイズの細孔におけるイオン性クーロン遮断に対する表面効果」.ナノテクノロジー. 29 (2): 025703. arXiv : 1711.09725 . Bibcode :2018Nanot..29b5703T. doi :10.1088/1361-6528/aa9a14. ISSN 0957-4484. PMID 29130892. S2CID 206087040.
- ^ abc Sather, William A.; McCleskey, Edwin W. (2003). 「カルシウムチャネルの透過と選択性」. Annual Review of Physiology . 65 (1): 133–159. doi :10.1146/annurev.physiol.65.092101.142345. ISSN 0066-4278. PMID 12471162.
- ^ Boda, Dezso; Nonner, Wolfgang; Henderson, Douglas; Eisenberg, Bob; Gillespie, Dirk (2008). 「カルシウム選択チャネルにおける容積排除」. Biophysical Journal . 94 (9): 3486–3496. Bibcode :2008BpJ....94.3486B. doi :10.1529/biophysj.107.122796. PMC 2292364. PMID 18199663 .
- ^ Dudev, Todor; Lim, Carmay (2014). 「真核生物イオンチャネルの進化:Ca 選択性チャネルからNa選択性チャネルへの変換の原理」アメリカ化学会誌。136 (9): 3553–559. doi :10.1021/ja4121132. PMID 24517213.
- ^ Corry, Ben (2013). 「細菌電位依存性ナトリウムチャネル NavAb における Na + {\displaystyle ^{+}} /Ca 2 + {\displaystyle ^{2+}} 選択性」. Peer J. 1 : e16. doi : 10.7717/peerj.16 . PMC 3629057. PMID 23638350 .
- ^ Heinemann, Stefan H.; Terlau, Heinrich; Stühmer, Walter; Imoto, Keiji; Numa, Shosaku (1992). 「単一変異によるナトリウムチャネルに付与されたカルシウムチャネル特性」Nature . 356 (6368): 441–443. Bibcode :1992Natur.356..441H. doi :10.1038/356441a0. ISSN 0028-0836. PMID 1313551. S2CID 4266532.
- ^ Amar, A.; Song, D.; Lobb, CJ; Wellstood, FC (1994-05-16). 「超伝導クーロンブロッケード電位計における 2e から e への周期的対電流」. Physical Review Letters . 72 (20): 3234–3237. Bibcode :1994PhRvL..72.3234A. doi :10.1103/PhysRevLett.72.3234. PMID 10056141.
- ^ Danon, J.; Nazarov, Yu. V. (2009-07-01). 「強いスピン軌道結合がある場合のパウリスピンブロッケード」. Physical Review B. 80 ( 4): 041301. arXiv : 0905.1818 . Bibcode :2009PhRvB..80d1301D. doi :10.1103/PhysRevB.80.041301. S2CID 53623926.
- ^ Meyertholen, Andrew; Di Ventra, Massimiliano (2013-05-31). 「ナノ細孔を介したイオン輸送における量子アナロジー」. arXiv : 1305.7450 [cond-mat.mes-hall].
- ^ Kaniadakis, G.; Quarati, P. (1993-12-01). 「排他原理に従う古典粒子の運動方程式」. Physical Review E. 48 ( 6): 4263–4270. Bibcode :1993PhRvE..48.4263K. doi :10.1103/PhysRevE.48.4263. PMID 9961106.
- ^ Kaniadakis, G.; Quarati, P. (1994-06-01). 「ボソンとフェルミオンの古典モデル」(PDF) . Physical Review E . 49 (6): 5103–5110. Bibcode :1994PhRvE..49.5103K. doi :10.1103/PhysRevE.49.5103. PMID 9961832.
