ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| 国際電気通信協会 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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2CAR、2I5D、2J4E、4F95 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | ITPA、C20orf37、HLC14-06-P、dJ794I6.3、My049、ITPase、NTPase、イノシン三リン酸、DEE35 |
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| 外部ID | オミム: 147520; MGI : 96622;ホモロジーン: 6289;ジーンカード:ITPA; OMA :ITPA - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体2(マウス)[2] |
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| | バンド | 2 F1|2 63.24 cM | 始める | 130,509,530 bp [2] |
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| 終わり | 130,523,534 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 甲状腺の右葉
- 甲状腺の左葉
- 横行結腸粘膜
- 右副腎皮質
- 右子宮管
- 左副腎
- 左副腎皮質
- 食道粘膜
- 顆粒球
- 脚の皮膚
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| | トップの表現 | - 胚
- 胚
- 心室帯
- 心内膜クッション
- 胚葉上層
- 原始的な線
- 桑実胚
- 神経節隆起
- 神経管
- 耳板
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ヌクレオチド結合
- dITPジホスファターゼ活性
- XTPジホスファターゼ活性
- ITPジホスファターゼ活性
- 加水分解酵素活性
- 金属イオン結合
- ヌクレオチドジホスファターゼ活性
- NADHピロホスファターゼ活性
- ヌクレオシド三リン酸ジホスファターゼ活性
- 同一のタンパク質結合
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- ITP 分解プロセス
- ヌクレオチド代謝プロセス
- 染色体の構成
- ヌクレオシド三リン酸の分解過程
- プリンヌクレオチド分解過程
- デオキシリボヌクレオシド三リン酸の分解過程
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_001267623 NM_033453 NM_181493 NM_001324236 NM_001324237
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NM_001324238 NM_001324240 NM_001351739 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001254552 NP_001311165 NP_001311166 NP_001311167 NP_001311169
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NP_258412 NP_852470 NP_001338668 |
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| 場所 (UCSC) | 20章: 3.21 – 3.22 Mb | 2 章: 130.51 – 130.52 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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イノシン三リン酸ピロホスファターゼは、ヒトではITPA遺伝子[5] [6] 、細菌大腸菌ではrdgB遺伝子[ 7]、酵母S. cerevisiaeではHAM1遺伝子[8]によってコードされる酵素である。このタンパク質は、ポティウイルス科のRNAウイルスにもコードされている。 [9]この遺伝子には、2つの異なるアイソフォームをコードする2つの転写バリアントが見つかっている。また、少なくとも2つの他の転写バリアントが特定されており、これらはタンパク質コードではなく制御因子である可能性が高い。[要出典]
関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、イノシン三リン酸とデオキシイノシン三リン酸を一リン酸ヌクレオチドと二リン酸に加水分解する。[ 6]この酵素は複数の基質特異性を持ち、キサントシン三リン酸やデオキシキサントシン三リン酸を含む他のヌクレオチドにも作用する。[8]コードされるタンパク質はHAM1 NTPaseタンパク質ファミリーのメンバーであり、細胞質内に存在し、ホモ二量体として機能する。
臨床的意義
コードされたタンパク質の欠陥は、イノシン三リン酸ピロホスホリラーゼ欠損症を引き起こす可能性がある。[6]酵素ITPaseは、試験管内でリバビリン三リン酸を脱リン酸化してリバビリン一リン酸にするが、ヒトの30%に存在するITPaseの酵素活性の低下は、C型肝炎ウイルスの変異誘発を増強する。[10]予測されるITPase活性の低下を予測する遺伝子変異は、リバビリン誘発性貧血のリスク低下、血小板減少症のリスク上昇、リバビリン濃度の低下、およびC型肝炎ウイルス(HCV)遺伝子型2または3感染に対するインターフェロンベースの治療後のリバビリンのような再発リスクの低下と関連している。[11]
読む
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- Fraser JH、 Meyers H、Henderson JF、Brox LW 、 McCoy EE (1976)。「ヒト赤血球におけるイノシン三リン酸蓄積の個人差」。臨床生化学。8 (6): 353– 64。doi :10.1016/S0009-9120(75)93685-1。PMID 1204209 。
- Clawson GA、Song YL、Schwartz AM、Shukla RR 、 Patel SG、Connor L、他 (1992)。「ヒト免疫不全ウイルス I 型 Rev タンパク質と核骨格ヌクレオシドトリホスファターゼ活性との相互作用」。Cell Growth Differ。2 ( 11): 575– 82。PMID 1667585。
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参考文献
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