ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
IR3 について 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 3QU6、1J2F、1QWT、1T2K、1ZOQ、2O61、2O6G、2PI0、3A77、5JEO、5JEK、5JER、5JEM、5JEL、5JEJ
識別子 エイリアス IRF3 、entrez:3661、IIAE7、インターフェロン調節因子3 外部ID オミム ：603734; MGI : 1859179; ホモロジーン : 1208; ジーンカード ：IRF3; OMA :IRF3 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体7（マウス） [2] バンド 7|7 B3 始める 44,647,072 bp [2] 終わり 44,652,272 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 顆粒球 右子宮管 横行結腸粘膜 脾臓 甲状腺の右葉 子宮頸管 甲状腺の左葉 下垂体前葉 リンパ節 子宮頸管
トップの表現 網膜の神経層 精母細胞 リップ 顆粒球 脛骨大腿関節 胸腺 卵黄嚢 右腎臓 小腸のリーベルキューン陰窩 蝸牛管の前庭膜
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
DNA結合 タンパク質ホモ二量体化活性 DNA結合転写因子活性 転写共調節活性 DNA結合転写抑制活性、RNAポリメラーゼII特異的 タンパク質結合 タンパク質ドメイン特異的結合 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 配列特異的DNA結合 同一のタンパク質結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 細胞成分 生物学的プロセス
アポトーシスの過程 I型インターフェロンを介したシグナル伝達経路の正の調節 マクロファージのアポトーシス過程 転写の調節、DNAテンプレート 細菌に対する反応 外因性dsRNAに対する反応 インターフェロンα産生の正の調節 MDA-5シグナル伝達経路 インターフェロン-γを介したシグナル伝達経路 免疫システムのプロセス RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 RNAポリメラーゼIIによる転写 dsRNAに対する細胞反応 転写、DNAテンプレート DNA損傷刺激に対する細胞反応 TRIF依存性Toll様受容体シグナル伝達経路 リポ多糖類に対する反応 ウイルスに対する防御反応 I型インターフェロンシグナル伝達経路 I-κBキナーゼ/NF-κBシグナル伝達の正の調節 I型インターフェロン産生の抑制 プログラムされた壊死性細胞死 ウイルスプロセス リポ多糖に対する細胞反応 I型インターフェロン産生の正の調節 リポ多糖類を介したシグナル伝達経路 インターフェロンβ産生の正の調節 先天性免疫反応 I型インターフェロン産生の調節 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 宿主によるウイルスに対する防御反応の負の調節 遺伝子発現の調節 炎症反応の調節 外因性dsRNAに対する細胞応答 転写の正の制御、DNAテンプレート 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001197122 NM_001197123 NM_001197124 NM_001197125 NM_001197126 NM_001197127 NM_001197128 NM_001571
RefSeq (タンパク質) NP_001184051 NP_001184052 NP_001184053 NP_001184054 NP_001184055 NP_001184056 NP_001184057 NP_001562 NP_001184053.1 NP_001184056.1 NP_001184057.1
場所 (UCSC) 19章: 49.66 – 49.67 Mb 7 章: 44.65 – 44.65 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
インターフェロン調節因子3は IRF3 としても知られ 、 インターフェロン調節因子 である。 [5]
関数 IRF3は、インターフェロン調節転写因子（IRF）ファミリーの一員である。 [5] IRF3はもともと IRF1 および IRF2 の 相同体 として発見された。IRF3はさらに特徴付けられ、核輸出シグナル、 DNA結合ドメイン 、 C末端 IRF関連ドメイン、およびいくつかの調節リン 酸化 部位を含むいくつかの機能ドメインを含むことが示された 。 [6] IRF3は不活性な細胞質形態で発見され、セリン/スレオニンリン酸化により CREBBP と複合体を形成する 。 [7] この複合体は核に 移行し、 インターフェロンαおよびβ、さらにはインターフェロン誘導遺伝子の転写を活性化する。 [8]
IRF3は、ウイルス感染に対する 自然免疫系 の反応 において重要な役割を果たしている 。 [9] 凝集した MAVSは IRF3の二量体化を活性化することがわかっている。 [10] 2015年の研究では、自然免疫アダプタータンパク質MAVS、STING、TRIFの保存されたpLxISモチーフでのリン酸化が、セリン/スレオニンタンパク質キナーゼTBK1によるIRF3のリン酸化と活性化を誘導して特定し、それによってI型インターフェロンの産生を活性化することが示された。 [11] 別の研究では、IRF3-/-ノックアウトが心筋梗塞から保護することが示された。 [12] 同じ研究で、IRF3とI型IFN応答が 心筋梗塞 後の心臓保護の潜在的な治療標的であることが特定された。 [12]
Toll様受容体のシグナル伝達経路。灰色の破線は未知の関連性を表す。
インタラクション IRF3はIRF7 と 相互作用する ことが示されている 。 [13]
参考文献
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さらに読む
Pitha PM、Au WC、Lowther W、Juang YT、Schafer SL、Burysek L、Hiscott J、Moore PA (1999)。「ウイルス媒介シグナル伝達および細胞増殖の調節におけるインターフェロン調節因子 (IRF) の役割」。Biochimie。80 ( 8–9 ) : 651–8。doi : 10.1016 /S0300-9084(99)80018-2。PMID 9865487 。 米山 正之、須原 渉、藤田 哲也 (2002)。「リン酸化によるIRF-3活性化の制御」。J .インターフェロンサイトカイン研究 。22 ( 1): 73–6。doi : 10.1089 /107999002753452674。PMID 11846977 。 Au WC、Moore PA、Lowther W、Juang YT、Pitha PM (1996)。「インターフェロン刺激応答エレメントに結合し、インターフェロン誘導遺伝子の発現を活性化するインターフェロン調節因子ファミリーのメンバーの同定」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 92 (25): 11657–61. doi : 10.1073/pnas.92.25.11657 . PMC 40461 . PMID 8524823。 米山 正之、須原 渉、福原 勇、福田 正之、西田 栄、藤田 孝 (1998)。「ウイルス感染による I 型インターフェロン系の直接誘導: IRF-3 および CBP/p300 を含む転写因子複合体の活性化」。EMBO J. 17 (4): 1087–95. doi :10.1093/emboj/17.4.1087 . PMC 1170457. PMID 9463386 。 Weaver BK、Kumar KP、Reich NC (1998)。「インターフェロン調節因子3とCREB結合タンパク質/p300は二本鎖RNA活性化転写因子DRAF1のサブユニットである」。Mol . Cell. Biol . 18 (3): 1359–68. doi :10.1128/MCB.18.3.1359. PMC 108849. PMID 9488451 。 Lin R、Heylbroeck C、Pitha PM、Hiscott J (1998)。「IRF-3 転写因子のウイルス依存性リン酸化は、核移行、転写活性化能、およびプロテアソーム媒介分解を制御する」。Mol . Cell. Biol . 18 (5): 2986–96. doi :10.1128/MCB.18.5.2986. PMC 110678. PMID 9566918 。 Ronco LV、Karpova AY、Vidal M、Howley PM (1998)。「ヒトパピローマウイルス 16 E6 オンコプロテインはインターフェロン調節因子 3 に結合し、その転写活性を阻害する」。Genes Dev . 12 ( 13 ): 2061–72。doi : 10.1101/gad.12.13.2061。PMC 316980。PMID 9649509 。 Bellingham J、Gregory-Evans K、Gregory - Evans CY (1999)。「遺伝子内多型マーカーによるヒトインターフェロン調節因子 3 (IRF3) の染色体 19q13.3-13.4 へのマッピング」。Annals of Human Genetics。62 ( Pt 3): 231–4。doi : 10.1046 /j.1469-1809.1998.6230231.x。PMID 9803267。S2CID 46070705 。 Lowther WJ、Moore PA、Carter KC、Pitha PM (1999)。「ヒトIRF-3プロモーターのクローニングと機能解析」。DNA Cell Biol . 18 (9): 685–92. doi :10.1089/104454999314962. PMID 10492399。 Kim T、Kim TY、Song YH、Min IM、Yim J、Kim TK (1999)。「DNA損傷因子に対するインターフェロン調節因子3の活性化」。J . Biol. Chem . 274 (43): 30686–9. doi : 10.1074/jbc.274.43.30686 . PMID 10521456。 Kumar KP、McBride KM、Weaver BK、Dingwall C、Reich NC (2000)。「二本鎖RNA活性化因子1のサブユニットであるインターフェロン調節因子3の調節された核-細胞質局在」。Mol . Cell. Biol . 20 (11): 4159–68. doi :10.1128/MCB.20.11.4159-4168.2000. PMC 85785. PMID 10805757 。 Suhara W, Yoneyama M, Iwamura T, Yoshimura S, Tamura K, Namiki H, Aimoto S, Fujita T (2000). 「IRF-3 とコアクチベーター CBP/p300 間のウイルス誘導性ホモマーおよびヘテロマータンパク質結合の解析」 J. Biochem . 128 (2): 301–7. doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022753. PMID 10920266. Servant MJ、ten Oever B、LePage C、Conti L、Gessani S、Julkunen I、Lin R、Hiscott J (2001)。「インターフェロン調節因子3のリン酸化につながる明確なシグナル伝達経路の特定」。J . Biol. Chem . 276 (1): 355–63. doi : 10.1074/jbc.M007790200 . PMID 11035028。 Smith EJ、Marié I、Prakash A、García-Sastre A、Levy DE (2001)。「ウイルス感染細胞におけるIRF3およびIRF7のリン酸化は、二本鎖RNA依存性タンパク質キナーゼRまたはIkappa Bキナーゼを必要としないが、ワクシニアウイルスE3Lタンパク質によって阻害される」。J . Biol. Chem . 276 (12): 8951–7. doi : 10.1074/jbc.M008717200 . PMID 11124948。 Au WC、Yeow WS、Pitha PM (2001)。「インターフェロン調節因子7の機能ドメインの分析とIRF-3との関連性」。 ウイルス 学 。280 ( 2): 273–82。doi : 10.1006 /viro.2000.0782。PMID 11162841 。 Barnes BJ、Moore PA、Pitha PM (2001)。「新規インターフェロン調節因子 IRF-5 のウイルス特異的活性化により、異なるインターフェロン アルファ遺伝子が誘導される」。J . Biol. Chem . 276 (26): 23382–90. doi : 10.1074/jbc.M101216200 . PMID 11303025。 Mach CM、Hargrove BW、Kunkel GR (2002)。「Small RNA 遺伝子活性化タンパク質、SphI ポストオクタマー相同結合因子/セレノシステイン tRNA 遺伝子転写活性化因子は、ヒトインターフェロン調節因子 3 遺伝子の転写を刺激する」。J . Biol. Chem . 277 (7): 4853–8. doi : 10.1074/jbc.M108308200 . PMID 11724783。 Morin P、Bragança J、Bandu MT、Lin R、Hiscott J、Doly J、Civas A (2002)。「インターフェロンA遺伝子転写に関与するインターフェロン調節因子3および7の優先結合部位」。J. Mol. Biol . 316 (5): 1009–22. doi :10.1006/jmbi.2001.5401. PMID 11884139。 Dang O、Navarro L、Anderson K、David M (2004)。「最先端：炭疽菌致死毒素はリポ多糖によるIFN調節因子3の活性化を阻害する」。Journal of Immunology。172 ( 2 ): 747–51。doi ： 10.4049 /jimmunol.172.2.747。PMID 14707042 。
外部リンク
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