ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
IPO5 識別子 エイリアス IPO5 、IMB3、KPNB3、Pse1、RANBP5、imp5、importin 5 外部ID オミム :602008; MGI : 1917822; ホモロジーン : 1710; ジーンカード :IPO5; OMA :IPO5 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) クロ。 14番染色体(マウス) [2] バンド 14|14 E4- E5 始める 121,148,636 bp [2] 終わり 121,185,411 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) トップの表現 精子 左精巣 右精巣 心室帯 胚 軟骨組織 神経節隆起 膵臓の体 腓腹筋 子宮内膜間質細胞
トップの表現 精細管 原始的な線 上皮層 体節 レンズ 胎児の尾 精子細胞 髄質集合管 心室帯 下顎突出
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
GTPase阻害活性
タンパク質結合
核局在配列結合
RNA結合
核輸入シグナル受容体活性
細胞成分 生物学的プロセス
リボソームタンパク質の核への輸入
アミノ酸刺激に対する細胞反応
タンパク質輸送
核へのタンパク質輸入の正の調節
ウイルスプロセス
細胞内タンパク質輸送
GTPase活性の負の調節
NLS含有タンパク質の核内への輸入
輸送
核へのタンパク質の輸入
サイクリン依存性タンパク質セリン/スレオニンキナーゼ活性の負の調節
出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
インポーチン5 は、ヒトでは IPO5 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6] [7]この遺伝子によってコードされるタンパク質は、 インポーチン ベータファミリーのメンバーである 。構造的には、このタンパク質は右手ソレノイドの形状をとり、24個の HEAT リピートから構成される。 [8]
関数
核輸送はシグナルとエネルギーに依存するプロセスで、 核膜 に埋め込まれた核膜孔複合体を通じて行われる。核 局在シグナル (NLS)を含むタンパク質の輸入には、 カリオフェリン としても知られるインポーチンαおよびβサブユニットのヘテロ二量体であるNLS輸入受容体が必要である 。インポーチンαは細胞質内のNLS含有貨物に結合し、インポーチンβは複合体を核膜孔複合体の細胞質側にドッキングする。ヌクレオシド三リン酸および小さなGTP結合タンパク質 Ran の存在下では、複合体は核膜孔複合体に移動し、インポーチンサブユニットは解離する。インポーチンαはパッセンジャータンパク質とともに核質に入り、インポーチンβは孔に留まる。インポーチンβと核膜孔複合体のFGリピートとの相互作用は、孔複合体を介した転座に不可欠である。 [9]
IPO5は、ニューロン内のCPEB3のRRM1モチーフに結合することにより、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質(CPEB)3の転座を促進する。NMDARシグナル伝達はRanBP1の発現を増加させ、細胞質GTP結合Ranのレベルを低下させる。これらの変化はCPEB3とIPO5の相互作用を強化し、その結果、CPEB3の核内輸入を加速し、その核機能を促進する。 [10]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000065150 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000030662 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ Yaseen NR、Blobel G (1997 年 4 月)。「ヒトカリオフェリン β3 のクローニングと特性評価」。 米国科学アカデミー紀要。94 ( 9 ) : 4451–6。Bibcode : 1997PNAS ... 94.4451Y。doi : 10.1073/ pnas.94.9.4451。PMC 20743。PMID 9114010 。
^ Deane R、Schäfer W、Zimmermann HP、Mueller L、Görlich D、Prehn S、他 (1997 年 9 月)。「Ran 結合タンパク質 5 (RanBP5) は核輸送因子インポーチンベータと関連しているが、RanBP1 とは相互作用が異なる」。 分子 細胞 生物 学 。17 ( 9): 5087–96。doi :10.1128/mcb.17.9.5087。PMC 232359。PMID 9271386 。
^ Deng T、Engelhardt OG、Thomas B、Akoulitchev AV、Brownlee GG、Fodor E (2006 年 12 月)。 「インフルエンザウイルスRNAポリメラーゼ複合体の核内移行および構築におけるラン結合タンパク質5の役割」。 ウイルス学ジャーナル 。 80 (24): 11911–9。 土井 :10.1128/JVI.01565-06。 PMC 1676300 。 PMID 17005651。
^ Swale C, Da Costa B, Sedano L, Garzoni F, McCarthy AA, Berger I, et al. (2020年5月). 「インフルエンザポリメラーゼの核輸送に必須の因子であるヒトカリオフェリンRanBP5のX線構造」 (PDF) . Journal of Molecular Biology . 432 (10): 3353–3359. doi :10.1016/j.jmb.2020.03.021. PMID 32222384. S2CID 219670671.
^ 「Entrez Gene: RANBP5 RAN結合タンパク質5」。
^ Chao HW、Lai YT、Lu YL、Lin CL、Mai W、Huang YS (2012 年 9 月)。「NMDAR シグナル伝達は IPO5 を介した CPEB3 の核内輸入を促進する」。 核酸 研究 。40 ( 17 ) : 8484–98。doi :10.1093/nar/gks598。PMC 3458550。PMID 22730302 。
さらに読む
Bukrinsky MI、Haffar OK (1997年 12 月) 。 「HIV-1 核輸入: リーダーの探求」。Frontiers in Bioscience。2 ( 4): d578-87。doi : 10.2741/A213。PMID 9366553 。
Bukrinsky MI 、Haffar OK (1998 年 3 月)。「HIV-1 核内輸入: マトリックスタンパク質が再び注目を集める 、 今回 は Vpr とともに」。 分子医学 。4 (3): 138–43。doi : 10.1007 /BF03401911。PMC 2230352。PMID 9562972 。
Christophe D、Christophe-Hobertus C、 Pichon B (2000 年 5 月)。「タンパク質の核標的化: 異なるシグナルはいくつあるか?」 細胞シグナル伝達 。12 (5): 337–41。doi :10.1016/S0898-6568(00)00077-2。PMID 10822175 。
Chook YM、 Blobel G (2001 年 12 月)。「カリオフェリンと核輸入」。Current Opinion in Structural Biology 11 ( 6): 703–15。doi :10.1016/S0959-440X(01)00264-0。PMID 11751052 。
Bukrinsky MI、Sharova N、Dempsey MP、Stanwick TL、Bukrinskaya AG、Haggerty S、Stevenson M (1992 年 7 月)。「ヒト免疫不全ウイルス 1 型プレインテグレーション複合体の能動的な核内輸入」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。89 (14): 6580–4。Bibcode : 1992PNAS ...89.6580B。doi : 10.1073 / pnas.89.14.6580。PMC 49545。PMID 1631159 。
Bukrinsky MI、Haggerty S、 Dempsey MP、Sharova N 、Adzhubel A、Spitz L、他 (1993 年 10 月)。「非分裂細胞の感染を制御する HIV-1 マトリックス タンパク質内の核局在シグナル」。Nature。365 ( 6447 ) : 666–9。Bibcode : 1993Natur.365..666B。doi :10.1038/ 365666a0。PMC 9524217。PMID 8105392。S2CID 25678 。
Maruyama K, Sugano S (1994年1月). 「オリゴキャッピング: 真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡単な方法」. Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Bonaldo MF、 Lennon G、Soares MB (1996 年 9 月)。「正規化と減算: 遺伝子発見を容易にする 2 つのアプローチ」。 ゲノム 研究 。6 (9): 791–806。doi : 10.1101/ gr.6.9.791。PMID 8889548 。
Gallay P、Hope T、Chin D、Trono D (1997 年 9 月)。「インポーチン/カリオフェリン経路によるインテグラーゼの認識を介した非分裂細胞の HIV-1 感染」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。94 (18): 9825–30。Bibcode : 1997PNAS ...94.9825G。doi : 10.1073 / pnas.94.18.9825。PMC 23276。PMID 9275210 。
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997年10月). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Henderson BR、Percipalle P (1997 年 12 月)。「HIV Rev と核輸入および輸出因子との相互作用: Rev 核局在シグナルはヒトインポーチンベータへの特異的結合を媒介する」。Journal of Molecular Biology。274 ( 5): 693–707。doi :10.1006/ jmbi.1997.1420。PMID 9405152 。
Efthymiadis A 、 Briggs LJ 、 Jans DA (1998 年 1 月)。「HIV-1 Tat 核局在配列は新しい核輸入特性を付与する」。The Journal of Biological Chemistry。273 ( 3): 1623–8。doi : 10.1074/jbc.273.3.1623。PMID 9430704 。
Vodicka MA、 Koepp DM、Silver PA、Emerman M (1998 年 1 月)。「HIV-1 Vpr は核輸送経路と相互作用してマクロファージ感染を促進する」。 遺伝子 と 発達 。12 ( 2): 175–85。doi :10.1101/gad.12.2.175。PMC 316441。PMID 9436978 。
Popov S、Rexach M、Zybarth G、 Reiling N、Lee MA、Ratner L、他 (1998 年 2 月)。「ウイルスタンパク質 R は HIV-1 プレインテグレーション複合体の核内輸送を制御する」。EMBO ジャーナル 。17 ( 4 ) : 909–17。doi :10.1093/emboj/17.4.909。PMC 1170440。PMID 9463369 。
Popov S、Rexach M、Ratner L、Blobel G、Bukrinsky M (1998 年 5 月)。「ウイルスタンパク質 R は HIV-1 プレインテグレーション複合体の核膜孔複合体へのドッキングを制御する」。The Journal of Biological Chemistry。273 ( 21): 13347–52。doi : 10.1074/ jbc.273.21.13347。PMID 9582382 。
Fouchier RA、Meyer BE、Simon JH、Fischer U、Albright AV、González-Scarano F、Malim MH (1998 年 7 月)。「ヒト免疫不全ウイルス 1 型 Vpr タンパク質と核膜孔複合体との相互作用」。Journal of Virology。72 ( 7 ) : 6004–13。doi : 10.1128 /JVI.72.7.6004-6013.1998。PMC 110405。PMID 9621063 。