ヒドロゲノフィラ科

ヒドロゲノフィラ科
科学的分類
ドメイン：	細菌
門:	シュードモナドタ
クラス：	親水症 Boden et al., 2022
注文：	Hydrogenophilales Garrity et al., 2006
家族：	Hydrogenophilaceae Garrity et al., 2006
属
ハイドロゲノフィルス[1] テピディフィルス[1]

ハイドロジェノフィラ科は、シュードモナス門（「プロテオバクテリア」）のハイドロジェノフィリア綱に属する科で、ハイドロジェノフィラス属とテピディフィラス属の 2 つの属がある。すべてのシュードモナス門と同様に、ハイドロジェノフィラ科はグラム陰性である。既知の種はすべて好熱性で、約 50 °C で成長し、成長を支える電子源として分子状水素または有機分子を使用する。一部の種は独立栄養生物である。

チオバチルス属は以前はこの科に属していると考えられていたが、ハイドロジェノフィラレスがベータプロテオバクテリアから除去されハイドロジェノフィラリア綱が形成されたのと同時に、ニトロソモナダレス目に再分類された。^[2]

ハイドロジェノフィルス・テルモルテオルスは、もともと温泉から分離された通性化学合成無機栄養生物であるが、2004年に南極のボストーク湖を覆う氷の約3kmの深さから採取された氷床コアサンプルで検出された。^[3]氷の中に好熱細菌のDNA（およびおそらく生きた細胞）が存在することは、ボストーク湖の冷水域の下に地熱システムが存在する可能性があること、または単にハイドロジェノフィルスの非好熱性株が存在し、氷の中に存在していたことを示唆している。

細菌のハイドロジェノフィリア綱は、生理学、生化学、脂肪酸プロファイル、およびrMLSTプラットフォームによる多座配列タイピングを用いて連結された16S rRNA遺伝子と53のリボソームタンパク質配列に基づく系統解析に基づいて、ハイドロジェノフィラレス目がベータプロテオバクテリアとは異なることが実証された2017年に定義されました。^[2]

この綱は、好熱性生物（独立栄養生物と従属栄養生物の両方）を含む好熱性生物であるハイドロジェノフィラレス目（基準目）の1つの目から成り、前者は分子状水素を電子供与体として利用し、その酸化とNAD ⁺の還元をヒドロゲナーゼ酵素で結び付けます。ω-シクロヘキシル脂肪酸（具体的にはC19:0シクロおよびC17:0シクロ）の割合が直鎖脂肪酸と比較して非常に高いことが、ベータプロテオバクテリアに対する大きな特徴であり、おそらく高い増殖温度での膜安定性の確保に関与しています。^{[2]この綱のメンバーはすべて、分子状}酸素を末端電子受容体として利用できる（つまり好気性である）ほか、硝酸塩も利用でき、硝酸塩は脱窒時に一部のメンバーによって利用できます。この綱の独立栄養メンバーは、二酸化炭素を濃縮したり、カルボキシラーゼとしてRuBisCOの効率を酸素添加酵素よりも向上させたりするためにカルボキシソームを使用したりしません。このクラスの主な呼吸キノンはユビキノン-8であり、メナキノンやロドキノンは観察されないが、隣接するベータプロテオバクテリアには存在する。^[2]