チオバチルス

チオバチルス（Thiobacillus）は、グラム陰性 ベータプロテオバクテリアの属である。チオバチルス・チオパルス（Thiobacillus thioparus）は、この属の基準種であり、基準株はスターキー^T株であり、1930年代にロバート・スターキーがアメリカ合衆国ラトガース大学の圃場から分離した1904年にマーティヌス・ベイエリンク（Martinus Beijerinck）によって定義されて以来、30を超える「種」が命名されてきたが（ ^{[1] [2]}、最初の株は1902年に海洋生物学者のアレクサンダー・ネイサンソン（Alexander Nathansohn）によって観察され、現在ではおそらくハロチオバチルス・ネアポリタヌス（Halothiobacillus neapolitanus^{）と呼ばれるものである）、ほとんどの名前は有効にまたは効果的に公表されることはなかった。残りは、}パラコッカス（Paracoccus ）またはスターキーア（どちらもアルファプロテオバクテリア）に再分類されたか、 Sulfuriferula、 Annwoodia、 Thiomonas（ベータプロテオバクテリア属）、 Halothiobacillus、 Guyparkeria（ガンマプロテオバクテリア属）、 ThermithiobacillusまたはAcidithiobacillus（アシディチオバチルス属）。非常に曖昧に定義された「種」 Thiobacillus trautweiniiは、1910年から1960年代に硫黄酸化従属栄養菌と化学合成無機従属栄養菌に割り当てられたもので、そのほとんどはおそらくPseudomonas属の種でした。 ^[4]この属に命名された種の多くは、サービスコレクションに保管されることがなく、失われています。 ^{[4] [3]}

すべての種は絶対独立栄養生物^{[1] [2] [3]}（カルビン・ベンソン・バシャム回路のトランスアルドラーゼ型^[4]を使用）であり、元素硫黄、チオ硫酸塩、またはポリチオネートをエネルギー源として使用します。以前のThiobacillus aquaesulis は従属栄養生物として複合培地で弱く成長できますが、 Annwoodia aquaesulisに再分類されています。基準種Thiobacillus thioparusの一部の株（E6 および Tk-m）は、ジメチルスルフィド、ジメチルジスルフィド、または二硫化炭素からの硫黄を使用して独立栄養成長をサポートできます。これらの種からの炭素を二酸化炭素に酸化して同化します。硫黄の酸化はケリー・トルーディンガー経路を介して行われます。

16SリボソームRNA配列解析の結果、 Thiobacillus属の多くのメンバーが再分類された。^{[5] [4] [6]}

• チオバチルス・ベルストゥスからパラコッカスまで
• チオバチルス・アシドフィルスからアシディフィリウムへ
• チオバチルス・インターメディウス、チオバチルス・ペロメタボリス、チオバチルス・サーモスルファタス、およびチオバチルス・クプリヌスからチオモナス
• チオバチルス・チオオキシダンス、チオバチルス・フェロオキシダンス、チオバチルス・カルダス、およびチオバチルス・アルベルテンシスからアシディチオバチルス
• Thiobacillus aquaesulisからAnnwoodia aquaesulisへ。^[4]
• チオバチルス・ナポリタヌスからハロチオバチルス
• チオバチルス・シアシリスからチオミクロスピラ・シアシラエへ^[7]
• チオバチルス・ハイドロサーマリスとチオバチルス・ハロフィラスは、最初はハロチオバチルスに、後にガイパルケリア^{に進化した[6]}
• チオバチルス・テピダリウスからテルミチオバチルスへ^[5]